アカギツネ (Vulpes vulpes) に適用される主要な階級:ドメイン、界、門、綱、目、科、属、種生物分類学 において、分類上の順位 とは、進化関係を反映した生物学的分類の階層で視覚化された生物群の相対的レベルまたは絶対的レベルのいずれかを指す。一部の研究者は命名上の順位 という用語の使用を好み、[ 1 ] 、いくつかの定義によれば、生物の順位は分類学 の順位よりも命名法 の下でより正確に説明されると主張している。したがって、最も包括的な分類群またはクレード(真核生物 や動物界 など)には最高の分類順位が割り当てられ、最も包括的でない分類群(ホモ・サピエンス 、ヒキガエル 、ティラノサウルス・レックス 、ホンドギツネ など)には最低の順位が与えられている。
順位は「絶対的」か「相対的」かのいずれかであり、後者の場合は種 、属 、族 、科 、目 、綱 、門 、界 、ドメイン などの複数の記述用語で順位を指定します。後者の場合は、インデントされた 分類法で順位を指定し、インデントのレベルが順位を反映する。このページでは絶対的な順位について強調する。また、順位に基づくコード(動物コード 、植物コード 、栽培植物コード 、原核生物コード 、ウイルスコードなど)はすべて絶対的な順位を必要とする。(ただし、すべての 命名体系 で絶対的な順位が必要なわけではなく、例えば系統命名法 のコードであるPhyloCode [ 2 ] では絶対 的 な順位は不要である。)
アカギツネ (Vulpes vulpes )という特定の種について、動物学規約におけるその分類と順位付けを考えてみましょう。種小名 vulpes (小文字のv )は、キツネ属( Vulpes 属、大文字のV )に含まれる特定の種 vulpes (アカギツネ)を特定します。この属は、種小名 vulpes の 1 つ上のランクに「真の」キツネのすべての種をグループ化します。キツネに最も近い種は、イヌ 科 に分類され、イヌ、オオカミ、ジャッカルが含まれます。階層構造で次に上位の分類群は食肉目で、これには イヌ 亜 目 (上記のすべてに加えてクマ、アザラシ、イタチ、スカンク、アライグマ)とネコ亜 目 (ネコ、ハクビシン、ハイエナ、マングース)が含まれます。肉食動物は、哺乳類綱 に属する毛深く温血で哺乳動物の一種であり、脊索動物 門 に属する脊索動物に含まれます。そして、上記に挙げた動物はすべて動物界に属するすべての動物に含まれます。そして、最高位において、上記はすべて 細胞核を持つ他のすべての生物とともに 、 真核生物 ドメイン に 分類されます。
より一般的には、分類群は分類プロセスの結果として生じる生物の階層的グループ分けを記述し、表現するものであり、分類群に割り当てられた順位は、階層内におけるそれらのグループの相対的な位置を示します。上位の分類群(例えば、ドメインや界)は、門や属などの下位の分類群よりも多くのサブ分類群を含みます。これは、分類学上の順位を示す逆ピラミッド 図で示されています。また、種、あるいは亜種は、サブ分類群の数が最も少ないか、あるいは全く含みません。特定の分類群の順位は、他の分類群と共通の祖先から受け継がれた 形質や分子的特徴の進化的継承を反映しています。
二名法は 基本的なもの であり、つまり、特定の生物を識別するために、通常、ランクに基づくコードを含む分類学内で、属と種(すなわち、属と種小名)の最初の2つ以外のランク名を指定する必要はありません。[ 3 ] (ただし、ほとんどのランクに基づくコードは互いに独立しており、コード間同名(すなわち、複数のコード間で異なる生物に同じ名前が使用されている こと)が多数存在するため、これは世界的に当てはまりません。これは通常、動物または特定のランクに基づくコードによってカバーされる分類群に対して行われます。このため、すべての分類群名を規制するバイオコードを作成する試みがなされましたが、 [ 4 ] しかし、このミッションはこれまでのところ失敗しています[ 5 ]。 これは主にコミュニティ間で固く根付いた命名の伝統によるものです。)[ 6 ]
国際動物命名規約では、 ランクを 次のように定義しています。「命名上の目的で、分類階層における分類群 のレベル(例:命名上の目的では、すべての科は上科と亜科の間にある同じランクである)」。[ 7 ] このページの説明では、一般的に分類群がクレード (生物の単系統 群)であると想定していますが、これは動物規約や植物規約(藻類、菌類、植物の国際命名規約 )のどちらでも必須ではありません。また、生物学的命名法の専門家の中には、必須ではないと考える人もいます。[ 8 ] その場合、分類群の階層、つまりランクは、必ずしもクレードの階層を反映するとは限りません。
歴史 分類学における従来のアプローチは現象論的であり、外見、有機的構造、行動の類似性に基づいてグループ分けを行っていたが、20世紀後半に開発された2つの重要な新手法が分類学の実践を劇的に変えた。1つは分岐論の出現であり、これはドイツの 昆虫学者 ヴィリー・ヘニング の研究に端を発している。[ 9 ] 分岐論とは、生物が共通して持つ形質の割合( 類縁形質 と呼ばれる)に基づいて生物を分類する方法である。2つの生物が共有する形質の割合が高いほど、両者が共通の祖先からより最近に派生したと想定される。 2つ目は、遺伝子解析 に基づく分子系統学であり、多くのウイルス 、細菌 [ 10 ] 、古 細菌など、表現型の特徴がほとんどない場合に関係を解明できない場合や、胎盤哺乳類の主要分類群など、はるか昔に起こった急速な進化的放散で生じた分類群間の関係を解明する場合に特に有用な、多くの追加データを提供することができる 。[ 11 ]
メインランク カール・リンネは 、彼の画期的な著作『自然の体系』 の中で、界、綱、目、属、種、そして種の1つ下の階級に限定した分類尺度を用いていた。今日、命名法は命名法コード によって規制されている。分類上の主な階級は、界、門、綱、目、科、属、種の7つである。さらに、カール・ウーゼ によって提唱されたドメイン が、現在では基本的な階級として広く用いられている。ラテン語形としてはregio とdominiumの 両方が提案されており、2023年にラテン語形dominiumとして国際原核生物命名法コードに採用された 。 [ 12 ]
分類群は通常、正式名称が与えられる際に階級が割り当てられます。基本的な階級は種と属です。生物に種名が与えられる場合、それは属に割り当てられ、属名は種名の一部となります。
種名は二 名法とも呼ばれ、2つの語からなる名前です。例えば、ヒト属の動物学名はHomo sapiens です。これは通常、印刷時にはイタリック体で表記されますが、イタリック体が使用できない場合は下線が引かれます。この場合、Homo は属名で大文字で始まり、sapiens は種名で大文字ではありません。必ずしもそうとは限りませんが、一部の種には亜種小名が含まれます。例えば、現代人はHomo sapiens sapiens またはH. sapiens sapiens です。
動物命名法では、高等分類名は通常イタリック体にしないが、植物コード 、原核生物コード 、ウイルスコード、 生物コード 草案[ 4 ] 、および系統コード [ 2 ] では、すべての分類名(すべてのランク)をイタリック体にすることを推奨している。
動物学における順位 国際動物命名規約 には、上科、科、亜科、族、亜族、属、亜属、種、亜種の分類上の階級に関する規則がある。 [ 13 ]
国際動物命名規約は、学名を「科群名」、「属群名」、「種群名」に分類しています。規約では、これらのカテゴリーについて、以下の順位が明示的に規定されています。[ 13 ] :§29–31
家族グループ 上科(-oidea) 科 (-idae)亜科 (-inae)部族 (-ini)亜部族 (-ina) 属群 種群 規約の規則は、上科から亜種の階級に適用され、上科より上位の階級にはある程度適用される。「属群名」と「種群名」の間には、それ以上の階級は公式には認められておらず、そのため、Rana のような種群に属するこれらの群の分類群を命名する際に問題が生じる。[ 14 ] 動物学者は、ショウジョウバエ属のように多くの種を含む分類群において、亜属と種の間にある追加的な、しかし非公式な階級として、便宜上「種群」「種亜群」「種複合体」「上種」などの用語を追加すること が ある。 (「種群」を階級のカテゴリーとしてだけでなく、非公式の階級としても使用している点に注意してください。このため、アラン・デュボアは少なくとも2000年以降、「名目シリーズ」、「科シリーズ」、「属シリーズ」、「種シリーズ」(その他)などの代替表現を使用しています。[ 15 ] [ 14 ] )
上位の階級(科以上)では、下位を意味する接頭辞「infra」を階級に付加することで、下位の階級を表すことがあります。例えば、infraorder(亜目より下)やinfrafamily(亜科より下)のように表記されます。
動物学上の分類群の名前 種の階級より上の分類群には、一部に学名(一名)が存在します。 種の名前は通常、属名 と種小名の2つの部分(二名 法 )から成ります(例:Canis lupus )。属名と種小名の間に亜属名(括弧内)が挿入されることがあり、その場合は亜種の三名法と混同しないように注意が必要です。例えば、Lithobates (Aquarana) catesbeianusは、 Lithobates 属とAquarana 亜属に属する種を表します。[ 14 ] 亜種は、属名 + 種名 +亜種名の3つの部分(三 名法 )から構成されます(例:Canis lupus italicus )。種の下位には1つの階級しか存在しないため、階級を示す接続詞は不要であり、また使用されません。
植物学における地位 植物学上の階級は、生物を(多くの場合)その関係性に基づいて分類します(単系統性は、この用語自体も「 クレード 」という言葉も存在しないクレードには必須ではありません)。階級は界から始まり、門(または門)[ 16 ] 、綱、目、科、属、種へと続きます。各階級の分類群は、一般的に共通の特徴と進化の歴史を有しています。これらの階級を理解することは、分類学と生物多様性の研究に役立ちます。
ICNの順位[ 17 ] : 第3章 ランク タイプ サフィックス 王国(レグナム ) 主要な — 該当なし サブレグナム さらに遠く — 該当なし 部門(divisio )門(門) 主要な ‑phyta -mycota(菌類) 亜門(subdivision )または亜門 さらに遠く ‑phytina -mycotina (菌類) クラス(クラス ) 主要な ‑opsida (植物) ‑phyceae (藻類) ‑mycetes (菌類) サブクラス(サブクラス ) さらに遠く ‑idae (植物) ‑phycidae (藻類) - mycetidae (菌類) 秩序(オルド ) 主要な -エール 亜目(subordo ) さらに遠く -ineae 家族 主要な -aceae 亜科 さらに遠く オイデアエ 部族 二次 -eae 亜族 ( subtribus ) さらに遠く ‑inae 属(属) 主要な — 該当なし 亜属 さらに遠く — 該当なし セクション(セクション ) 二次 — 該当なし サブセクション(サブセクション ) さらに遠く — 該当なし シリーズ(シリーズ) 二次 — 該当なし サブシリーズ さらに遠く — 該当なし 種(種) 主要な — 該当なし 亜種 さらに遠く — 該当なし 品種(品種 ) 二次 — 該当なし 亜変種 さらに遠く — 該当なし フォーム(forma ) 二次 — 該当なし サブフォーム (サブフォーマ ) さらに遠く — 該当なし
国際栽培植物命名規約 には、栽培品種グループ 、栽培品種 、グレックス などの分類カテゴリーの定義があります。
ICN の規則は、主に家族階級以下の階層に適用され、家族階級以上の階層にもある程度適用されます。
植物分類群の名前 属以上の階級の分類群は、 1つの部分からなる植物名 (一名)を持ちます。種以上の階級(ただし属より下)の分類群は、2つの部分からなる植物名(二名 )を持ちます。種以下の分類群はすべて、3つの部分からなる植物名(種内名 )を持ちます。種内名の階級を示すには、「接続語」が必要です。例えば、Poa secunda subsp. juncifolia (subsp.はsubspeciesの略語)は、Poa secunda の亜種の名前です。[ 18 ]
雑種は、親子関係を示す「雑種式」によって指定されるか、または名前が付けられる。雑種名 が付けられた雑種には、同じ階級が適用され、接頭辞としてnotho (ギリシャ語で「雑種」)が付けられ、最高階級はnothogenusである。[ 19 ]
植物学上の階級の時代遅れの名称 古い出版物でその階級の異なる用語が使用されていたが、意図が明らかな場合は、植物命名法では特定の代替を指定します。
名前が「目の名前として意図されていたが、その順位を「order」の代わりに「cohors」(ラテン語で「cohort」の意味。[ 20 ] 生態学におけるこの用語の使用については、 cohort study も参照)、「nixus」、「alliance」、または「Reihe」などの用語で示して公表された場合(第17.2条)、目の名前として扱われます。 「家族」は、「秩序」(ordo)または「自然秩序」(ordo naturalis)の代わりに使用される場合もありますが、これは「秩序」の現代的な意味が意図されていない場合に限られます。(第18条2項) 「亜目」(suborder)の現代的な意味が意図されていなかった特定の状況においては、「亜科」(subfamily)が「亜目」(subordo)に置き換えられる。(第19条2項) 1890年1月1日より前の出版物において、種内階級が1つしか使用されていない場合、それは変種の階級とみなされます。(第37条4)これは、種内分類群をギリシャ文字α、β、γ、…で表記した出版物によく当てはまります。
例 以下に5種の分類を示します。遺伝学研究室でお馴染みのショウジョウバエ( Drosophila melanogaster )、ヒト (Homo sapiens )、メンデルが 遺伝学 の発見に用いたエンドウ豆 (Pisum sativum )、ベニテングタケ(Amanita muscaria ) 、そして大腸菌(Escherichia coli )。8つの主要な階級は太字で示し、さらにいくつかのマイナーな階級も示します。
表の注釈 表を簡潔にし、技術的な議論を避けるため、一般的な中間階級と一般的でない中間階級の一部は省略されています。例えば、ヨーロッパ、アフリカ、北アメリカ北部の哺乳類 [ a ] は、 Mammalia 綱、Cladotheria 群、Zatheria 亜群、Tribosphenida亜群、 Theria 亜綱、 Eutheria クレード、Placentalia クレードに属していますが、この表には Mammalia と Theria のみが記載されています。一般的に使用される Eutheria クレードと Placentalia クレードの両方が含まれている場合、「下階級」の階級はどちらなのか、もう一方の階級はどちらであるべきなのか、あるいはこの2つの名称はシノニムであるのかといった議論が生じる可能性があります。 上位分類群、特に中間のランクは、関係性に関する新しい情報が発見されるにつれて改訂される傾向がある。例えば、顕花植物は 門 (Magnoliophyta) から亜綱 (Magnoliidae) に格下げされ、上目 (superorder) が顕花植物の主要なグループを区別するランクとなった。[ 22 ] 霊長類の従来の分類 (哺乳類綱、獣亜綱、真獣亜綱、霊長類目) は、マッケナとベル (哺乳類綱、獣亜綱、ホロテリア下綱) などの新しい分類によって修正され、獣亜綱と霊長類目の間には、より低いランクが割り当てられている。これらの違いは、化石記録には利用可能なランクが少なく、分岐点が多いために生じる。 種の中にさらに単位が認められる場合がある。動物は亜種(例:Homo sapiens sapiens 、現代人)または形態 (例:Corvus corax varius morpha leucophaeus 、カラス)に分類される場合がある。植物は亜種(例:Pisum sativum subsp. sativum 、エンドウ豆)または変種(例:Pisum sativum var. macrocarpon 、スノーピー)に分類され、栽培植物には栽培品種 名が付けられる(例:Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird')。細菌は 菌株 (例:Escherichia coli O157:H7 、食中毒を 引き起こす可能性のある菌株)によって分類される場合がある。
名前の終了 属レベルより上位の分類群は、多くの場合、 タイプ属 に基づいて命名され、標準的な語尾が付けられます。これらの命名に用いられる語尾は、界(場合によっては門や綱)によって異なります。詳細は以下の表をご覧ください。
示されている発音は最も英語化されたもの です。ラテン語的な発音も一般的で、特に強勢のあるaは ではなくと発音されます。
ランク ウイルス [ 23 ] 細菌 と古細菌 [ 24 ] 胚植物 (植物 ) 藻類 (発汗促進剤 ) 菌類 動物 レルム -ビリア サブレルム -ヴィラ 王国 -ビラエ -アティ[ 25 ] サブ王国 -ヴィレテス 門 -ビリコタ -ota [ 26 ] -オフィタ[ 27 ] -mycota 亜門 -viricotina -フィティナ[ 27 ] -マイコティナ クラス -ビリテス -ia -opsida -phyceae -mycetes サブクラス -ウイルス科 -idae -phycidae 菌類 スーパーオーダー -anae 注文 -virales -ales -ida または -iformes 亜目 -virineae -ineae インフラオーダー -アリア スーパーファミリー -acea -oidea エピファミリー -oidae 家族 -ウイルス科 -aceae -idae 亜科 -virineae -oideae -inae インフラファミリー -奇数[ 28 ] 部族 -eae -ini サブ部族 -inae -ina インフラトライブ -ad または -iti 属 -ウイルス 亜属
表の注釈 植物学および菌類学において、科以下の学名は属名(その分類群のタイプ属 と呼ばれることもある)に基づいており、標準的な語尾が付いています。例えば、バラ科(Rosaceae )は、 Rosa 属にちなんで命名されており、科を表す標準的な語尾は「-aceae」です。科より上の学名も属名から派生したもの、または説明的な名前(Gymnospermae やFungi など)です。 動物については、上科までの分類群にのみ標準的な接尾辞が存在します。[ 29 ] AAAS [ 30 ] では、例えば目に対して-ida のような統一接尾辞が提案されています(ただし推奨はされていません) 。原生動物学者はこの方式を採用しているようです。多くの後生動物(高等動物)の目にもこのような接尾辞が用いられています。例えば、Hyolithida やNectaspida (Naraoiida) などです。 属名に基づいて名前を作るのは簡単ではないかもしれません。例えば、homo は属格hominis を持つため、 Homo 属(ヒト)はHominidae に属し、Homidae には属しません。 動物における上科、下科、下族の階級は、系統分岐の複雑さにより、通常よりも細かな区別が必要となる場合に用いられる。これらは上科より下位に位置するが、国際動物命名規約では規定されていないため、正式な標準的な語尾は存在しない。ここに挙げた接尾辞は規則的なものではあるが、非公式なものである。[ 31 ] ウイルス学では、ウイロイド 、サテライト核酸 、ビリフォーム の分類群の正式な語尾はウイルスと似ており、-vir-が -viroid- 、-satellit- 、-viriform- に置き換えられるだけです。[ 23 ] レルムとサブレルムの追加レベルは、それぞれ-viria と-vira で終わります。[ 23 ]
すべてのランク 分類学者は必要に応じていつでも自由に新しい階級を創設できるため、階級の数は不確定です。その際には、適用される命名規則 によって異なるいくつかの制約があります。
以下は、絶対的な順位を示す目的のみで、最も一般的なものから最も特殊なものの順に、人工的にまとめたものです(注記を参照)。[ 32 ] 髑髏と骨の記号(☠)でマークされた用語は特にウイルス学 で使用され、バイオハザード記号(☣︎)でマークされたものは細菌学で使用され、小花(✿)でマークされたものは 植物学 で使用され、傘(☂)でマークされたものは菌類学 で使用され、アスタリスク(*)でマークされたものは動物学で使用され、魚眼(◉)でマークされたものは 魚類学 で使用され、花(⚘)でマークされたものは鱗翅目学 で使用されます。
上級階級 ランク ドメイン エンパイア レルム ☠ [ 23 ] 王国 門 区分 ✿クラス 部門 * [ 33 ] レギオン * サブランク ハイパーキングダム 超王国 王国 サブ王国 インフラキングダム パルヴ王国 スーパークラス クラス サブクラス インフラクラス 下位階級 パルブクラス スーパーディビジョン* 分割* 区分* インフラディビジョン* スーパーレギオン* レギオン* サブレギオン* インフラレギオン*
中央階級 ランク コホート * [ 35 ] 注文 セクション* 家族 部族 属 サブランク メガコホート* スーパーコホート* コホート* サブコホート* インフラコホート* ギガファミリー* メガファミリー* 祖父母* ハイパーファミリー* スーパーファミリー エピファミリー* シリーズ⚘ グループ⚘ 家族 亜科 インフラファミリー
意義と問題点 ランク付けは主観的な相違に基づいて行われ、自然界における変異の段階的な性質を完全に反映するものではありません。これらの問題は、1969年にウィリー・ヘニングによって既に指摘されており、彼はランク付けの廃止を提唱しました [ 38 ] 。そして、この立場はわずか数年後にグラハム・C・D・グリフィスの支持を得ました[ 39 ] 。実際、これらのランク付けは固定主義的な文脈で提唱され、進化の到来によってこのシステムの基盤は弱体化しました。これは以前から認識されていました。1886年に出版されたアメリカ鳥類学会が採択した『北米鳥類命名法およびチェックリスト規約』 の序文には、「[ストリックランド規約が起草された]1842年には、リンネの体系が科学の永続的な遺産ではないことや、数年後には進化論が、 名前が付けられるべきものに対する人々の概念を根本的に変え、その基礎そのものを蝕むことになるなどとは、誰も疑っていなかったようだ」と記されている。[ 40 ] このようなランクは、ランクに基づく規約で要求されているという理由だけで使用されている。このため、一部の系統分類学者は、これを命名上のランク と呼ぶことを好む。[ 1 ] [ 6 ] ほとんどの場合、より高次の分類群は、最も包括的な分類群が必然的に最初に出現したという理由だけで、さらに過去に遡って出現する。[ 41 ] さらに、いくつかの主要な分類群(脊椎動物 や被子植物 など)の多様性は、他の分類群(菌類 、節足動物 、線虫 など)の多様性よりもよく知られていますが、これは他の分類群よりも多様だからではなく、他の分類群よりも簡単にサンプルを採取して研究できるため、または研究に対する関心と資金がより多く集まるためです。[ 42 ] [ 43 ]
これらの多くの階級の中で、最も基本的な(あるいは重要な)のは種であると考える分類学者は多いが、この見解は必ずしも普遍的ではない。[ 44 ] [ 45 ] [ 46 ] このように、種は必ずしも他の階級の分類群よりも明確に定義されているわけではなく、実際、絶滅によって生じた表現型のギャップを考慮すると、実際には逆の場合が多い。理想的には、分類群はクレード 、すなわち議論の対象となる生物の系統発生を表すことを意図しているが、これは 動物学 および植物学の 規約の要件ではない。[ 6 ]
すべての分類群に正式な階級を与える分類は、系統発生に関する知識を適切に反映することができない。階級に基づく(リンネの)命名法では、分類群名は階級に依存するため、階級のない分類群には名前を付けることができない。PhyloCodeの下で実施され、国際系統命名学会によってサポートされている系統命名法[47] [48]や、限定名の使用などの代替アプローチは 、この問題 を回避 し て いる。 [ 50 ] [ 51 ]分類学 上 の 階級 を 進化 樹に重ね合わせることの理論的な困難さは 、 ダーウィンの進化モデルによって例証される 境界パラドックス として現れる。
属、科、またはその他の高次分類群(種より上のカテゴリーの分類群)を構成する種の数に関する規則はない。[ 52 ] [ 53 ] 生物学者が入手可能なすべての情報に基づいて判断した自然なグループ(つまり、人為的ではなく、多系統的 ではないグループ)であるべきである。異なる門で同等にランク付けされた高次分類群は、起源の時期、表現型の特殊性、または含まれる低位の分類群の数の点で、必ずしも同等ではない(例えば、昆虫の科が何らかの形で軟体動物の科と進化的に比較できると想定するのは誤りである)。[ 53 ] [ 54 ] [ 6 ] 分類群をランク付けするために提唱されてきたすべての基準のうち、起源の年代が最も頻繁に提唱されてきた。ヴィリー・ヘニングは 1966年にこの方式を提案したが[ 9 ] 、 1969年に[ 38 ] 、この方式は機能しないと結論付け、絶対的な階級を廃止することを提案した。しかしながら、起源年齢(唯一の基準として、あるいは主要な基準の一つとして)を用いて分類群を階級化するという考え方は、タイムバンドリングという名称で存続しており、現在でも複数の著者によって提唱されている[ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] 。動物の場合、少なくとも門の 階級は通常、特定の体制 と関連付けられるが、これもまた恣意的な基準である。
謎めいた分類群 謎の分類群とは、より広い関係性が不明または定義されていない分類群のことである。[ 59 ]
ニモニック 分類階層を 記憶するのに役立つ記憶術はいくつかあります。例えば 、「キングフィリップ が グレートスパゲッティ の ために 来た 」などです。[ 60 ] (界、 門、綱 、目 、科 、属 、 種 )
参照
参考文献 ^ a b デュボア、アラン (2007). 「系統発生、分類学、命名法:分類カテゴリーと命名法上の階級の問題」 . Zootaxa . 1519 : 27–68 . doi : 10.11646/zootaxa.1519.1.3 . ^ a b カンティーノ、フィリップ D.デ・ケイロス、ケビン(2020)。 ファイロコード 。フロリダ州ボカラトン:CRC Press。 ISBN 978-0429821356 。^ 「藻類、菌類、植物の国際命名規約 - メルボルン規約」 IAPT-Taxon.org 2012 年。第2条および第3条。 2019年6月10日時点のオリジナルより アーカイブ。 2013年 4月28日 閲覧 。 ^ a b Greuter, W.; Garrity, G.; Hawksworth, DL; Jahn, R.; Kirk, PM; Knapp, S.; McNeill, J.; Michel, E.; Patterson, DJ; Pyle, R.; Tindall, BJ (2011). 「Draft BioCode (2011): Principles and Rules Regulating the Naming of Organisms」 . Taxon . 60 (1): 201– 212. Bibcode : 2011Taxon..60..201G . doi : 10.1002/tax.601019 . ISSN 0040-0262 . JSTOR 41059835 . ^ Labeda, David P.; Oren, Aharon (2008). 「国際原核生物分類学委員会;第11回国際細菌学・応用微生物学会議」 . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 58 (7): 1746– 1752. doi : 10.1099/ijs.0.2008/005082-0 . ISSN 1466-5034 . ^ a b c d ローリン、ミシェル(2023年8月3日) 『PhyloCodeの到来:生物学的命名法の継続的な進化 』CRC Press. ISBN 978-1-000-91257-9 。^ 国際動物命名法委員会(1999年)、 国際動物命名規約。第4版 、国際動物命名法信託、 2019年5月21日時点のオリジナルより アーカイブ 、 2015年 4月12日閲覧。 ^ Pavlinov, Igorʹ Ja (2021). 『分類学上の命名法:名前の持つ意味:歴史と理論』 (初版). ボカラトン: CRC Press. ISBN 978-1003182535 。^ a b ヘニング、ウィリー (1966). 系統分類学 . イリノイ大学出版局. ISBN 978-0-252-06814-0 。^ Martinez-Gutierrez, Carolina A; Aylward, Frank O (2021年8月26日). 「細菌と古細菌における系統発生シグナル、一致、そして不確実性」 . Molecular Biology and Evolution . 38 (12): 5514– 5527. doi : 10.1093/molbev/msab254 . ISSN 1537-1719 . PMC 8662615. PMID 34436605 . ^ Tarver, James E.; dos Reis, Mario; Mirarab, Siavash; Moran, Raymond J.; Parker, Sean; O'Reilly, Joseph E.; King, Benjamin L.; O'Connell, Mary J.; Asher, Robert J.; Warnow, Tandy; Peterson, Kevin J.; Donoghue, Philip CJ; Pisani, Davide (2016年1月5日). 「胎盤哺乳類の相互関係と系統学的推論の限界」 . Genome Biology and Evolution . 8 (2): 330– 344. doi : 10.1093/gbe/evv261 . hdl : 1983/64d6e437-3320-480d-a16c-2e5b2e6b61d4 . ISSN 1759-6653 . PMC 4779606 . PMID 26733575 . ^ Oren, A. (2023). 「原核生物命名規約の原則8、規則5b、8、15、33a、および付録7の修正による界とドメインのカテゴリーの追加」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 73 (11). Microbiology Society: 006123. doi : 10.1099/ijsem.0.006123 . ISSN 1466-5034 . PMID 37909283 . ^ a b 国際動物命名法委員会 (1999). 「用語集」. 国際動物命名規約 . ロンドン: 国際動物命名法信託. ISBN 0-85301-006-4 . 2021年9月3日時点のオリジナルよりアーカイブ 。2023年11月10日 閲覧。^ a b c Dubois, Alain (2007年2月1日). 「系統図からの分類群命名:教訓」 . Molecular Phylogenetics and Evolution . 42 (2): 317– 330. Bibcode : 2007MolPE..42..317D . doi : 10.1016/j.ympev.2006.06.007 . ISSN 1055-7903 . PMID 16949307 . ^ デュボア、アラン(2000年)「動物学におけるシノニムと関連リスト:一般的な提案と爬虫類学における例」『 デュメリリア 』 4 (2): 33-98 。 ^ jibran, jibran. 「ログイン ‹ 情報 metBotanical Ranks: 分類学の理解」メタディスクリプション:植物の多様性と進化を理解するために不可欠な、界から種までの植物分類の階層構造を探ります。説明 — WordPress」 . dev-information-meta-descrition.pantheonsite.io . 2024年 5月7日 閲覧 。 ^ 「藻類、菌類、植物の国際命名規約 - メルボルン規約」 IAPT-Taxon.org 2012 年。 2020年10月10日時点のオリジナルより アーカイブ 。 2013年 4月28日 閲覧。 ^ 「藻類、菌類、植物の国際命名規約 - メルボルン規約」 IAPT-Taxon.org 2012 年。第4.2条および第24.1条。 2018年8月3日時点のオリジナルより アーカイブ。 2018年 8月3日 閲覧 。 ^ 「藻類、菌類、植物の国際命名規約 - メルボルン規約」 IAPT-Taxon.org . 2012年。第3.2条および付録1、H.1~3条。 2020年10月10日時点のオリジナルより アーカイブ。 2013年 4月28日 閲覧 。 ^ Stearn, WT 1992.植物ラテン語:歴史、文法、統語論、用語、語彙、第4版 。デイビッドとチャールズ。 ^ Göker, Markus; Oren, Aharon (2024年1月22日). 「原核生物の2つのドメインと7つの界の名称の有効な公表」 . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 74 (1). Society for General Microbiology. doi : 10.1099/ijsem.0.006242 . ISSN 1466-5034 . PMID 38252124. 2024年 6月7日 閲覧 。 ^ Chase, MW; Reveal, JL (2009)「APG IIIに伴う陸上植物の系統分類」、 リンネ協会植物学誌 、 161 (2): 122– 127、 doi : 10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x ^ a b c d 「ICTVコード。第3.IV条、§3.23; 第3.V条、§§3.27-3.28。」 国際ウイルス分類委員会 。2018年10月。 2022年7月6日時点のオリジナルより アーカイブ。 2018年 11月28日 閲覧 。 ^ Oren, Aharon (2023). 「原核生物の国際命名規約. 原核生物規約(2022年改訂版)」 . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 73 (5a). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID 37219928 . ^ Oren, Aharon (2023年11月1日). 「原核生物命名規約の原則8、規則5b、8、15、33a、および付録7の修正による界とドメインのカテゴリーの追加」. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 73 (11). doi : 10.1099/ijsem.0.006123 . PMID 37909283 . ^ Whitman, William B.; Oren, Aharon; Chuvochina, Maria; da Costa, Milton S.; Garrity, George M.; Rainey, Fred A.; Rossello-Mora, Ramon; Schink, Bernhard; Sutcliffe, Iain; Trujillo, Martha E.; Ventura, Stefano (2018年3月1日). 「門を表す接尾辞-otaの提案。『原核生物命名規約に門の階級を含める提案』への補遺」 .国際系統進化微生物学ジャーナル . 68 ( 3): 967– 969. doi : 10.1099/ijsem.0.002593 . ISSN 1466-5034 . PMID 29458499 .^ a b 「藻類、菌類、植物の国際命名規約(深圳規約)」 IAPT-Taxon.org 2018 年。第16条。 2018年12月19日時点のオリジナルより アーカイブ。 2018年 12月19日 閲覧 。 ^ 例えば、カメ 亜科のChelodd科(Gaffney & Meylan 1988: 169)とBaenodd科(同上 、176)。 ^ ICZN記事29.2 ^ Pearse, AS (1936)動物学名。門、綱、目の一覧。セクションF用に作成。アメリカ科学振興協会。 2021年11月15日アーカイブ。アメリカ 科学 振興協会、p. 4 ^ Gaffney & Meylan (1988)より提供。 ^ 門と科の間の動物学上の階級の一般的な用法(多くの閏階級を含む)については、Carroll (1988) を参照。動物学におけるその他の閏階級については、特に Gaffney & Meylan (1988)、McKenna & Bell (1997)、Milner (1988)、Novacek (1986, cit. in Carroll 1988: 499, 629)、およびLambert (1990: 149, 159) に報告されているPaul Serenoによる 1986 年 の鳥盤類 恐竜の分類を参照。植物学上の階級(多くの閏階級を含む)については、Willis & McElwain (2002) を参照。 ^ これらは移動可能な階級であり、多くの場合、階級と軍団またはコホートの間に挿入されます。しかしながら、動物学上の階層構造における位置付けは大きく異なる場合があります。例として、ベントンによる脊椎動物の分類(2005年)を参照。2019年1月16日 アーカイブ 、Wayback Machine より。 ^ Cavalier-Smith, Thomas (2016年10月1日). 「ユーグレノゾアの高次分類と系統発生」 . European Journal of Protistology . 56 : 250–276 . doi : 10.1016/j.ejop.2016.09.003 . ISSN 0932-4739 . PMID 27889663 . ^ 動物学の分類では、コホートとそれに関連する階級群は、綱群と順序群の間に挿入される。コホートは、竜盤類 恐竜の亜目と科の間でも使用されてきた( Benton Archived 16 January 2019 at the Wayback Machine 2005)。植物学の分類では、コホート群は門群と綱群の間に挿入されることがあり、Willis & McElwain (2002: 100–101) を参照。また、目(Intern of Order)の階級で使用されることもあったが、現在では目(Order)の旧称とみなされている。藻類、菌類、植物の国際命名規約、メルボルン規約 2012、第17.2条を参照。 ^ a b c d e ギガ目(gigaorder)–メガ目(megaorder)–キャパックス目(capaxorder)–ハイパー目(およびミクロ目。ミクロ目は、おおよそパボーダー目に割り当てられる位置)という上位の序列は、少なくともカメ類では採用されている(Gaffney & Meylan 1988)。一方、マグナ目(magnorder)–グランド目(grandorder)–ミラー目(mirorder)という並行した序列は、近年影響力のある哺乳類の分類に登場している。出典からは、これら2つの序列が単一の動物学上の序列の中でどのように調整(または織り交ぜ)られるのかは不明である。以前、Novacek(1986)とMcKenna-Bell(1997)は、ミラー目とグランド目を目とスーパー目の間に挿入していたが、Benton(2005)は現在、これら2つの序列をスーパー目より上位に位置付けている。 ^ さらに、生物型(biovar) 、 形態型(morphovar) 、 細菌型(phagovar) 、 血清型( serovar )という用語は細菌株 (遺伝的変異体)を指します。これらは分類学上の階級ではなく、細菌の亜種を定義する可能性のある様々なグループ分けです。 ^ a b ヘニング、ウィリ (1969)。 Die Stammesgeschichte der Insekten 。フランクフルト・アム・マイン:クレーマー。 p. 436. ^ グリフィス、グラハムCD(1973年12月). 「生物学的分類におけるいくつかの基本的問題」 . 系統動物学 . 22 (4): 338– 343. doi : 10.2307/2412942 . ISSN 0039-7989 . JSTOR 2412942 . ^ アメリカ鳥類学会 (1886). アメリカ鳥類学会が採択した北米鳥類の命名法典およびチェックリスト;学会の分類および命名に関する委員会の報告書 . viii + 392頁. ^ Gingerich, PD (1987). 「進化と化石記録:パターン、速度、そしてプロセス」. Canadian Journal of Zoology . 65 (5): 1053– 1060. Bibcode : 1987CaJZ...65.1053G . doi : 10.1139/z87-169 . ^ Blaxter, Mark; Mann, Jenna; Chapman, Tom; Thomas, Fran; Whitton, Claire; Floyd, Robin; Abebe, Eyualem (2005年10月29日). 「DNAバーコードデータを用いた操作的分類単位の定義」 . Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 360 (1462): 1935– 1943. doi : 10.1098 / rstb.2005.1725 . hdl : 1842/4732 . ISSN 0962-8436 . PMC 1609233. PMID 16214751 . ^ Hibbett, David S.; Nilsson, R. Henrik; Snyder, Marc; Fonseca, Mario; Costanzo, Janine; Shonfeld, Moran (2005年8月1日). 「自動系統分類:ホモバシディオマイセテス(キノコ形成菌類)の例」 . Systematic Biology . 54 (4): 660– 668. doi : 10.1080/10635150590947104 . ISSN 1063-5157 . PMID 16126660 . ^ ミシュラー, ブレント・D.; ドノヒュー, マイケル・J. (1982). 「種の概念:多元主義の事例」 . 系統動物学 . 31 (4): 491– 503. doi : 10.2307/2413371 . ISSN 0039-7989 . JSTOR 2413371 . ^ ミシュラー、ブレント・D. (1999年7月9日). 「種の消滅か?」 . 『種』 . MITプレス: 307–316 . doi : 10.7551/mitpress/6396.003.0020 . ISBN 978-0-262-28635-0 。^ エレシェフスキー、マーク(2002年9月) 「リンネの階級:過ぎ去った時代の痕跡」 『 科学哲学 』 69 (S3): S305– S315. doi : 10.1086/341854 . ISSN 0031-8248 . ^ de Queiroz, Kevin; Gauthier, Jacques (1990年12月). 「系統発生は分類学の中心原理である:分類群名の系統学的定義」 . Systematic Zoology . 39 (4): 307. doi : 10.2307/2992353 . ISSN 0039-7989 . JSTOR 2992353 . ^ Sereno, Paul C. (1999年6月1日). 「系統分類学における定義:批判と根拠」 . Systematic Biology . 48 (2): 329– 351. doi : 10.1080/106351599260328 . ISSN 1076-836X . PMID 12066711 . ^ Laurin, Michel; Cantino, Philip D. (2004年9月). 「第一回国際系統命名会議:報告書」 . Zoologica Scripta . 33 (5): 475– 479. doi : 10.1111/j.0300-3256.2004.00176.x . ISSN 0300-3256 . ^ Kluge, NJ (1999). 「種を超えた分類群の代替命名法の体系。リンネ的およびポストリンネ的系統分類原理」 昆虫学レビュー . 79 (2): 133– 147. ^ Kluge, NJ (2010). 「六脚類の高等分類群の限定名」 . Bionomina . 1 (1): 15– 55. doi : 10.11646/bionomina.1.1.3 . ^ Stuessy, TF (2009).『植物分類学:比較データの体系的評価』 第2版. コロンビア大学出版局, p. 175. ^ a b Brusca, RC & Brusca, GJ (2003).無脊椎動物 . 第2版. マサチューセッツ州サンダーランド: Sinauer Associates, pp. 26–27. ^ Dubois, Alain; Ohler, Annemarie; Pyron, R. Alexander (2021年2月26日). 「動物学における系統分類学と命名法の新しい概念と方法、例えば現生両生類(Lissamphibia)の新しい系統分類学」 . Megataxa . 5 (1): 1– 738. doi : 10.11646/megataxa.5.1.1 . ISSN 2703-3090 . ^ Avise, John C.; Johns, Glenn C. (1999年6月22日). 「現存種の生物学的分類における標準化された時間的枠組みの提案」 . Proceedings of the National Academy of Sciences . 96 (13): 7358– 7363. Bibcode : 1999PNAS...96.7358A . doi : 10.1073/pnas.96.13.7358 . ISSN 0027-8424 . PMC 22090. PMID 10377419 . ^ Avise, John C.; Mitchell, Dale (2007年2月1日). 「分類学の標準化の時」 . Systematic Biology . 56 (1): 130– 133. doi : 10.1080/10635150601145365 . ISSN 1076-836X . PMID 17366143 . ^ Zhao, Rui-Lin; Zhou, Jun-Liang; Chen, Jie; Margaritescu, Simona; Sánchez-Ramírez, Santiago; Hyde, Kevin D.; Callac, Philippe; Parra, Luis A.; Li, Guo-Jie; Moncalvo, Jean-Marc (2016年5月1日). 「分岐時間を用いた分類学的ランクの標準化に向けて ― アガリクス分類体系再構築のための事例研究」 . 菌類多様性 . 78 (1): 239– 292. Bibcode : 2016FuDiv..78..239Z . doi : 10.1007/s13225-016-0357-x . ISSN 1878-9129 . ^ Lücking, R. (2019年5月4日). 「時間の濫用はやめよう! 厳密な時間的バンド分けは、菌類(地衣類を含む)およびその他の生物におけるランクベースの分類の未来ではない」 . Critical Reviews in Plant Sciences . 38 (3): 199– 253. Bibcode : 2019CRvPS..38..199L . doi : 10.1080/07352689.2019.1650517 . ISSN 0735-2689 . ^ 「よくある質問」 . PLANTSデータベース . 米国農務省. 2011年 6月12日 閲覧 。 ^ エヴァンス、ロッド・L. (2007). 『 Every Good Boy Deserves Fudge: The Book of Mnemonic Devices 』 ペンギン社. ISBN 978-1-4406-2207-6 . 2023年11月23日時点のオリジナルよりアーカイブ 。2023年11月23日 閲覧。
参考文献 クロワザ, レオン (1945年1月). 「高等分類単位の歴史と命名法」.トーリー植物学クラブ紀要 . 72 (1): 52– 75. doi : 10.2307/2481265 . JSTOR 2481265 .ベントン、マイケル・J. (2005). 『脊椎動物古生物学』 (第3版)オックスフォード: ブラックウェル. ISBN 9780632056378 。ブルミット, RK; パウエル, CE (1992). 『植物名著作集 』 キュー王立植物園. ISBN 0947643443 。 キャロル、ロバート・L. (1988). 『脊椎動物古生物学と進化』 ニューヨーク: WH Freeman & Co. ISBN 0716718227 。ギャフニー, ユージン・S. ; メイラン, ピーター・A. (1988). 「カメの系統発生」. ベントン, MJ (編). 『四肢動物の系統発生と分類 第1巻:両生類、爬虫類、鳥類』. オックスフォード: クラレンドン・プレス. pp. 157– 219.ランバート、デイヴィッド(1990年)『恐竜データブック 』オックスフォード:ファクト・オン・ファイル/大英博物館(自然史)。ISBN 0816024316 。 マルコム・C・マッケナ、スーザン・K・ベル編(1997年)『種レベル以上の哺乳類の分類 』ニューヨーク:コロンビア大学出版局、ISBN 0231110138 。 ミルナー、アンドリュー (1988). 「現生両生類の系統と起源」. ベントン, MJ (編). 『四肢動物の系統発生と分類』 第1巻:両生類、爬虫類、鳥類. オックスフォード: クラレンドン・プレス. pp. 59– 102. ノヴァチェク、マイケル・J. (1986). 「レプティックス科食虫類の頭骨と真獣類哺乳類の高次分類」アメリカ自然史博物館紀要 (183): 1-112 . セレノ、ポール・C. (1986). 「鳥盤類恐竜の系統発生」ナショナルジオグラフィック・ リサーチ2 : 234–256 . ウィリス, KJ; マクエルウェイン, JC (2002). 『植物の進化 』 オックスフォード大学出版局. ISBN 0198500653 。