ノカルディア科

ノカルディア科
ノカルジア・アステロイデスのコロニー
科学的分類この分類を編集する
ドメイン： 細菌
王国： バチラッティ
門: 放線菌類
クラス： 放線菌
注文： 結核菌類
家族： ノカルディア科カステラーニとチャーマーズ 1919 （承認リスト 1980）[ 1 ]
タイプ属
ノカルジア
トレヴィサン 1889 (承認リスト 1980)
属[ 2 ]
同義語
  • ホヨセリ科Salam et al . 2020年
  • トミテラ科Salam et al . 2020年

ノカルジア科は、土壌や水中によく見られる好気性、非選好性、高G+C、グラム陽性放線菌の科です。 [ 3 ]この科の菌は南極の土壌から分離されています。[ 4 ] ノカルジア科には、糸状の球菌や、まれに断片化して柵状に広がる形態の菌が存在し、[ 5 ]糸状の菌は真菌の菌糸に似た分岐した形態パターンで成長します。[ 6 ]

ゲノミクス

ノカルディア科は、16S rRNAおよびタンパク質に基づく系統樹の両方において、コリネバクテリア目内の単系統群を形成している。[ 7 ] [ 8 ]ノカルディア属およびロドコッカス属に特有の保存されたシグネチャインデルおよび保存されたシグネチャタンパク質が数多く特定されており、2つの属間の密接な関係を裏付けている。[ 8 ]最近では、16S rRNAシグネチャヌクレオチドおよび化学分類マーカーに基づき、ゴルドニア属、スケルマニア属、ウィリアムシア属、ミリシア属、およびスマラグディコッカス属をノカルディア科に追加するという提案がなされている。[ 7 ] [ 9 ]しかし、提案されているノカルディア科改訂版の完全配列決定されたメンバーであるノカルディア、ロドコッカス、およびゴルドニアに共通する保存されたシグネチャインデルまたはタンパク質は見つかっていない。[ 8 ]

病原性能力

いくつかの種は動物に定着し、ノカルジア属とロドコッカス属はヒトや家畜に感染を引き起こす可能性があります。[ 10 ]ノカルジア症は魚類（海水魚を含む）にとっても深刻な健康問題です。[ 11 ]この科の多くの菌はミコール酸を細胞壁に取り込むため、ノカルジア属は抗酸菌染色後に顕微鏡で観察するとマイコバクテリアと間違われることがあります。 [ 12 ]

環境への影響

廃水の泡立ち

ノカルジア属は、下水処理中に活性汚泥中に発生する泡の蓄積の原因となることが多い。[ 6 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] 生物学的泡立ちは水処理プロセスにおいて問題となる可能性があり、泡の蓄積は廃水に界面活性剤を添加することで軽減される。[ 16 ] [ 17 ]

炭化水素のバイオレメディエーション

土壌ノカルジア科は炭化水素（例えば石油蒸留物）を分解することができ、環境流出に対する生物修復剤として提案されている。 [ 18 ]

命名法の変更

1980年代には、ミクロポリスポラ属に分類されていたノカルジア科の全ての種が、ストレプトスポランジア科のノカルジア属またはノノムラエア属、あるいはシュードノカルディア科のサッカロポリスポラ属に移された。[ 19 ] これにより、この属の正式な地位は事実上終了したが、古い研究論文ではこの属の名前が残っている。

参考文献

  1. ^ Castellani A, Chalmers AJ (1919).熱帯医学マニュアル（第3版）. ニューヨーク：Williams, Wood and Co.
  2. ^ Euzéby JP, Parte AC. 「Nocardiaceae」 .原核生物名一覧（LPSN） . 2022年6月25日閲覧。
  3. ^ Stackebrandt, E., Rainey, FA, NL Ward-Rainey. 1997.新しい階層的分類システムの提案, Actinobacteria classis nov . Int. J. Syst. Bacteriol., 1997, 47 :479-491.2011年5月15日アーカイブ, Wayback Machine
  4. ^ Aislabie, J.南極の氷のない地域における生態系プロセス。「南極スコット基地付近の石油汚染土壌における炭化水素分解細菌」257ページ。
  5. ^ Kulich, SM、WA Pasculle.最終診断 - Rhodococcus equiによる肺炎、肺門リンパ節炎、敗血症。ピッツバーグ大学医学部。2007年10月20日閲覧。
  6. ^ a b Bitton, G.廃水微生物学. 「泡沫微生物学」229ページ。
  7. ^ a b Ludwig, W.; Euzéby, J.; Schumann, P.; Busse, HJR; Trujillo, ME; Kämpfer, P.; Whitman, WB (2012). 「放線菌門のロードマップ」. Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology . p. 1. doi : 10.1007/978-0-387-68233-4_1 . ISBN 978-0-387-95043-3。
  8. ^ a b c Gao, B.; Gupta, RS (2012). 「放線菌門の主要系統群の系統学的枠組みと分子シグネチャー」 . Microbiology and Molecular Biology Reviews . 76 (1): 66– 112. doi : 10.1128/MMBR.05011-11 . PMC 3294427. PMID 22390973 .  
  9. ^ Zhi, X.-Y.; Li, W.-J.; Stackebrandt, E. (2009). 「構造と16S rRNA遺伝子配列に基づく放線菌綱の上位分類の定義の最新化、2つの新亜目と4つの新科の提案、および既存の上位分類群の記載修正」 . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 59 (3): 589– 608. doi : 10.1099/ijs.0.65780-0 . PMID 19244447 . 
  10. ^ Castellani, A. および AJ Chalmers. 1919.『熱帯医学マニュアル』第3版、Williams Wood and Co.、ニューヨーク、p. 1040。
  11. ^オースティン、ブライアン、ドーン・A・オースティン。2016年。「好気性グラム陽性桿菌と球菌 -細菌性魚類病原体における、シュプリンガー・インターナショナル・パブリッシング・スイス、p.125-135
  12. ^ノカルジア：牛にとって深刻な問題. プレゼンテーション画像：aids-images.ch. 2007年10月20日閲覧。
  13. ^ Blackall, LL, Tandoi, V., Jenkins, D. 1991.活性汚泥由来のNocardia amaraeの連続培養研究とNocardiaの泡沫制御への影響. Archived 2011-05-20 at the Wayback Machine Res. J. Water Pollution Cont. Fed. 63 :44-50.
  14. ^ Pitt, P., D. Jenkins. 1990.活性汚泥中のノカルジアの原因と制御 （ 2011年5月20日アーカイブ、 Wayback Machine） . Res. J. Water Pollution Cont. Fed. 62 :143-150.
  15. ^ Blackall, LL 1994.活性汚泥およびバイオフィルムプロセスにおける微生物Archived 2011-05-20 at the Wayback Machine . Water Sci. Technol. 29 :35-44.
  16. ^ Shao, YJ, Starr, M., Kaporis, K., Kim, HS, Jenkins, D. 1997.ノカルジアの泡立ち問題に対するポリマー添加の解決策Water Enviro. Res., 69 :25-27.
  17. ^ Ho, CF, Jenkins, D. 1991活性汚泥中のノカルジアの泡立ちに対する界面活性剤の影響Archived 2011-05-20 at the Wayback Machine . Water Sci. Tech. 23 :879-887.
  18. ^ Aislabie, J., McLeod, M., and R. Fraser.南極ロス諸島属領土壌における炭化水素の生分解性の可能性. Appl. Microbiol. Biotechnol. 49 :210-214.
  19. ^ LPSNのMicropolyspora ; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) moves to the DSMZ」 . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607– 5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .
「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Nocardiaceae&oldid=1266033527」より取得