ザミロン・ヴィロファージ
ザミロン・ヴィロファージ
2つのザミロン・ヴィロファージ（挿入図）は、関連する巨大ウイルスであるメガウイルスとスケールを合わせたものである[ 1 ]
ウイルスの分類この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: バリドナビリア
王国： バンフォードヴィラエ
門: プレプラスミウイルス
クラス： ウィロファビリセテス
注文： ミビダウイルス科
家族： スプートニビロウイルス科
属: スプートニクウイルス
種：
スプートニクウイルス・ザミロネンセ

ザミロン・ヴィロファージ（Zamilon ）は、原生生物に感染し、複製にヘルパーウイルスを必要とする小型DNAウイルスのグループであるヴィロファージであり、サテライトウイルスの一種である。[ 2 ] 2013年にチュニジアで発見され、アカンサメーバ・ポリファーガ・アメーバに感染するザミロンは、最初に発見されたヴィロファージであるスプートニクに最もよく似ている。名前はアラビア語で「隣人」を意味する。[ 3 ]その球形粒子は直径50～60 nmで、約17 kbの環状二本鎖DNAゲノムを含み、20個のポリペプチドをコードすると予測される。関連株であるザミロン2が北米で特定されている。

既知のヴィロファージはすべて、巨大DNAウイルス科ミミウイルス科のヘルパーウイルスと関連している。ザミロンのヘルパーウイルスの範囲は限られており、 ミミウイルスに似たミミウイルス科の系統BとCのウイルスにはサポートされるが、系統Aのウイルスにはサポートされない。これは、 CRISPR-Cas経路に類似した、 MIMIVIRE（ミミウイルス・ヴィロファージ耐性エレメント）と呼ばれるヘルパーウイルスの原始的な免疫システムの結果であると思われる。[ 4 ]スプートニク・ヴィロファージとは異なり、ザミロンはヘルパーウイルスの複製を阻害しないようである。

ザミロンは2013年、チュニジアの土壌サンプルから分離された巨大ウイルスMont1に共感染したアカンサメーバ ポリファーガアメーバで発見されました。 [ 2 ] [ 3 ] [ 5 ] 2015年の時点で、ザミロンは物理的に分離された3つのヴィロファージの1つで、他の3つはスプートニクとマウイルスです。他のいくつかのヴィロファージ DNA はメタゲノミクスを使用して発見されていますが、物理的に特徴付けられていません。[ 2 ] [ 6 ]関連株であるザミロン 2 は、 2015年に北米のポプラ材チップバイオリアクターのメタゲノム解析によって発見されました。 [ 7 ]別のヴィロファージであるリオネグロもスプートニクと密接に関連しています。[ 2 ]

分類学

ザミロン・ヴィロファージは、国際ウイルス分類委員会によってスプートニクウイルス科スプートニクウイルス属スプートニクウイルス・ザミロネンセ種に分類されている。[ 8 ] [ 9 ]

ウイルス学

ザミロンのビリオンは球形で、直径は50～60 nmであり、スプートニクやマウイルスのビリオンと外観が似ている。[ 3 ]その環状二本鎖DNAゲノムは、17,276 塩基対の長さである。[ 2 ] [ 3 ]ヴィロファージは通常、粒子の直径が40～80 nmで、ゲノムは17～30 kbである。[ 2 ]ザミロンに最も近縁のヴィロファージはスプートニクであり、ザミロンの配列の一部はスプートニクとは逆になっているものの、76%の配列同一性を共有している。[ 2 ] [ 3 ]ザミロンのDNAは、アデニン塩基とチミン塩基が豊富で、グアニン塩基とシトシン塩基の割合は29.7%である。[ 3 ]

オープンリーディングフレーム

ザミロンゲノムには、長さが222塩基から2337塩基までのオープンリーディングフレーム（ORF）が20個含まれていると予測される。予測された20の産物のうち、15個はスプートニクのものと類似しており、3つはミミウイルス科と類似している。ミミウイルス科には、2つがメガウイルス・チレンシスと、もう1つがムムモウウイルス・モンベのトランスポビロンと類似している。さらに、ザミロンのORFの1つはマウイルスと、もう1つはオーガニックレイクのビロファージおよびファエオシスティス・グロボーサのビロファージと類似しており、どちらもアメーバではなく藻類に関連している。残りの予測産物2つは、他の既知のタンパク質と限定的な類似性を示している。産物の推定機能には、トランスポザーゼ、ヘリカーゼ、インテグラーゼ、システインプロテアーゼ、DNAプライマーゼ-ポリメラーゼ、DNAパッケージングATPase酵素、主要およびマイナーカプシドタンパク質、構造タンパク質、コラーゲン様タンパク質がある。[ 3 ] ORF6はスプートニクの主要カプシドタンパク質と非常によく似ており、二重の「ジェリーロール」構造を持っています。[ 3 ] [ 10 ]

ORF [ a ]予測サイズ（アミノ酸） 関連商品 類似度（％） 予測される機能
1 111 なし – –
2 73 なし – –
3 135 メガウイルス チレンシスmg3 遺伝子産物 67 –
4 221 スプートニク・ヴィロファージ2の推定IS3ファミリートランスポザーゼAタンパク質 40 推定トランスポザーゼ
5 376 スプートニク・ヴィロファージ2のマイナービリオンタンパク質 66 マイナービリオンタンパク質
6 609 スプートニクのヴィロファージカプシドタンパク質V20 86 カプシドタンパク質
7 442 スプートニクのヴィロファージV21 70 –
8 81 ムムウイルス monve 仮説タンパク質 tv_L8 72 –
9 778 スプートニクのヴィロファージV13 67 推定ヘリカーゼ
10 168 スプートニク・ヴィロファージV11 53 –
11 247 スプートニク・ヴィロファージV10 58 推定インテグラーゼ
12 175 スプートニクのヴィロファージV9 77 –
13 184 スプートニクのヴィロファージV8 71 構造タンパク質
14 241 スプートニクのヴィロファージV7 80 –
15 305 スプートニク・ヴィロファージV6 75 コラーゲン様タンパク質
16 121 スプートニク・ヴィロファージV5 59 –
17 133 スプートニク・ヴィロファージV4 55 –
18 245 スプートニク・ヴィロファージV3 81 DNAパッケージングATPase
19 147 メガウイルスチレンシスmg664遺伝子産物 50 –
20 147 スプートニク・ヴィロファージV1 60 –

ライフサイクルとヘルパーウイルス

他のすべてのヴィロファージと同様に、ザミロンは、宿主として機能するヘルパーのウイルス工場内の細胞質で複製する。 [ 3 ]ザミロンは、ポリメラーゼB遺伝子配列によって系統Cに分類されるミミウイルス様ミミウイルス科のMont1に関連して最初に単離された。その後、このヴィロファージは、系統Bの2つのミミウイルス科のMoumouvirusおよびMonve 、および系統CのTerra1およびCourdo11に関連して複製できることが示されたが、系統Aに分類されるミミウイルスやママウイルスとは関連して複製することはできない。 [ 3 ] [ 11 ]これは、ミミウイルス科のどのミミウイルス様メンバーとも関連して複製できるスプートニクとは異なる。[ 3 ]

ザミロンは、ヘルパーウイルスの複製能力を著しく阻害することも、宿主アメーバ細胞を溶解することもないようです。ヘルパーウイルスはザミロン存在下で異常なビリオンを高率に形成しましたが、ヴィロファージの非存在下でも同程度の異常なビリオンが観察されました。 [ 3 ]これはまた、ヘルパーウイルスの感染性を低下させ、アメーバの溶解を阻害し、異常なミミウイルス科ビリオンの増加率と関連するスプートニクとは異なります。[ 2 ] [ 3 ]スプートニクとザミロンの両方を単離したベルナール・ラ・スコラとその同僚は、もしこれが確認されれば、「ヴィロファージの概念に疑問を投げかける」と述べており、ヴィロファージはヘルパーウイルスに有害な影響を与える点で他のほとんどのサテライトウイルスとは区別されると考えられてきました。[ 3 ]

参考文献

  1. ^すべてのデータはGaia et al . [ 3 ]より
  1. ^ Duponchel, S. and Fischer, MG (2019)「Viva lavidaviruses! Five features of virophages that parasitize gigant DNA viruses.」 PLoS pathogens , 15 (3). doi : 10.1371/journal.ppat.1007592 .この資料は、クリエイティブ・コモンズ表示4.0国際ライセンスの下で利用可能なこの情報源からコピーされました。
  2. ^ a b c d e f g h Krupovic M, Kuhn JH, Fischer MG (2016)、「ヴィロファージとサテライトウイルスの分類システム」Archives of Virology、161 (1): 233– 47、doi : 10.1007/s00705-015-2622-9、hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F、PMID 26446887 
  3. ^ a b c d e f g h i j k l m n o Gaia M、Benamar S、Boughalmi M、Pagnier I、Croce O、Colson P、Raoult D、La Scola B (2014)、「ザミロン、ミミウイルス科の宿主特異性を備えた新規なウイルスファージ」、PLOS One、9 (4) e94923、Bibcode : 2014PLoSO...994923G、doi : 10.1371/journal.pone.0094923、PMC 3991649、PMID 24747414  
  4. ^ Levasseur A、Bekliz M、Chabrière E、Ponrotti P、La Scola B、Raoult D (2016)、「MIMIVIRE は、ウイルスファージに対する耐性を与えるミミウイルスの防御システムです」、Nature、531 (7593): 249–252、Bibcode : 2016Natur.531..249L、doi : 10.1038/nature17146、PMID 26934229、S2CID 4382855  
  5. ^ Boughalmi M, Saadi H, Pagnier I, Colson P, Fournous G, Raoult D, La Scola B (2013)「チュニジア環境におけるミミウイルス科およびマルセイユウイルス科の巨大ウイルスのハイスループット分離」Environmental Microbiology , 15 (7): 2000– 7, doi : 10.1111/1462-2920.12068 , PMID 23298151 
  6. ^ Yutin N, Kapitonov VV, Koonin EV (2015)、「動物腸内メタゲノム由来のハイブリッドウイルスファージの新ファミリー」、Biology Direct、10 :19、doi : 10.1186/s13062-015-0054-9、PMC 4409740、PMID 25909276  
  7. ^ Bekliz M, Verneau J, Benamar S, Raoult D, La Scola B, Colson P (2015)、「バイオリアクターメタゲノムから組み立てられた新しいザミロン様ヴィロファージ部分ゲノム」、Frontiers in Microbiology、6 :1308、doi : 10.3389/fmicb.2015.01308、PMC 4661282、PMID 26640459  
  8. ^ 「ウイルス分類：2024年版」国際ウイルス分類委員会。 2025年3月16日閲覧。
  9. ^ 「分類群の歴史：種：スプートニクウイルス・ザミロネンセ（2024年版、MSL #40）」国際ウイルス分類委員会。 2025年3月16日閲覧。
  10. ^ Zhang X, Sun S, Xiang Y, Wong J, Klose T, Raoult D, Rossmann MG (2012) 「3.5Å解像度におけるヴィロファージSputnikの構造」、米国科学アカデミー紀要、109 (45): 18431–36、Bibcode : 2012PNAS..10918431Z、doi : 10.1073/pnas.1211702109、PMC 3494952、PMID 23091035  
  11. ^ Aherfia S、La Scola B、Pagniera I、Raoult D、Colson P (2014)、「拡大するマルセイユウイルス科」、ウイルス学、466–467 : 27–37、doi : 10.1016/j.virol.2014.07.014、PMID 25104553 
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