宿主細胞因子C1

HCFC1
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4GO6、4N39、4N3A、4N3B、4N3C​​​​
識別子
エイリアス	HCFC1、CFF、HCF-1、HCF1、HFC1、MRX3、PPP1R89、VCAF、HCF、宿主細胞因子C1、XLID3、MAHCX
外部ID	OMIM : 300019 ; MGI : 105942 ;ホモロジーン: 3898 ;ジーンカード: HCFC1 ; OMA : HCFC1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト X染色体（ヒト）[ 1 ] バンド Xq28 始める 153,947,557 bp [ 1 ] 終わり 153,971,818 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト X染色体（マウス）[ 2 ] バンド X A7.3|X 37.52 cM 始める 72,986,398 bp [ 2 ] 終わり 73,009,963 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 上腕二頭筋腱 耳下腺 腹直筋の骨格筋組織 神経節隆起 下垂体前葉 乳首 心室帯 子宮体部 幽門 心臓の頂点 上位の表現 性器結節 胚の尾 胚葉上層 心室帯 下顎突出 胸腺 神経節隆起 胎児肝造血前駆細胞 上顎突出 体節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 DNA結合転写因子活性 転写コアクチベーター活性 クロマチン結合 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K8特異的） ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K5特異的） DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性（H4-K16特異的） カドヘリン結合 タンパク質-高分子アダプター活性 配列特異的な二本鎖DNA結合 細胞成分 細胞質 膜 SAGA型複合体 Set1C/COMPASS複合体 軸索 ソーマ MLL1複合体 樹状突起 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ複合体 核 核質 タンパク質含有複合体 生物学的プロセス 転写の制御、DNAテンプレート ウイルス潜伏状態からの解放 有機環状化合物に対する細胞反応 タンパク質の安定化 ミトコンドリアの組織 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 ヒストンH4-K5のアセチル化 遺伝子発現の正の調節 細胞周期の正の調節 細胞周期 ヒストンH4-K16のアセチル化 ウイルスプロセス ヒストンH4-K8のアセチル化 タンパク質含有複合体の組み立ての制御 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 RNAポリメラーゼIIによる転写 タンパク質の脱ユビキチン化 胚盤胞の孵化 クロマチン組織 転写の正の制御、DNAテンプレート 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 3054 15161 アンサンブル ENSG00000172534 ENSMUSG00000031386 ユニプロット P51610 Q61191 RefSeq (mRNA) NM_005334 NM_008224 RefSeq（タンパク質） NP_005325 NP_032250 場所（UCSC） 染色体X: 153.95 – 153.97 Mb 染色体X: 72.99 – 73.01 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

宿主細胞因子1（HCFC1、HCF1、またはHCF-1 ）は、 VP16アクセサリータンパク質としても知られ、^{[ 5 ]} 、ヒトではHCFC1遺伝子によってコードされるタンパク質です。^{[ 6 ] [ 7 ]}

構造

HCF1は高度に保存された宿主細胞因子ファミリーの一員であり、5つのケルチリピート、フィブロネクチン様モチーフ、そして6つのHCFリピートからなるタンパク質をコードしています。各リピートには高度に特異的な切断シグナルが含まれています。この核転写共調節因子は、6つの可能な部位のうち1つ以上でタンパク質分解により切断され、 N末端鎖と対応するC末端鎖が生成されます。このタンパク質の最終形態は、非共有結合したN末端鎖とC末端鎖で構成され、これらの鎖は静電気力によって相互作用します。

関数

HCF1は細胞周期の制御に関与するだけでなく、転写に関連する多くのプロセスにおいて調節的な役割を担っています。さらに、モデル生物を用いた研究では、HCF1が寿命決定因子である可能性が示唆されています。^{[ 8 ]}異なるタンパク質アイソフォームをコードする選択的スプライシングバリアントが報告されていますが、すべてのバリアントが完全に特徴付けられているわけではありません。^{[ 7 ]}

この遺伝子の変異はコバラミン代謝障害と関連している。^{[ 9 ]}

相互作用

宿主細胞因子 C1 は、以下と相互作用することが示されています。

• BAP1 , ^{[ 10 ]}
• CREB3 , ^{[ 11 ] [ 12 ]}
• GABPA , ^{[ 13 ]}
• HDAC1 , ^{[ 14 ]}
• HDAC2 , ^{[ 14 ]}
• MLL、^{[ 15 ]}
• OGT、^{[ 14 ]}
• PDCD2 , ^{[ 16 ]}
• POU2F1 , ^{[ 17 ] [ 18 ]}
• PPP1CA , ^{[ 19 ]}
• SIN3A、^{[ 14 ] [ 15 ]}
• SP1、^{[ 14 ] [ 20 ]}
• SUDS3 , ^{[ 14 ]}
• WDR5、^{[ 14 ] [ 15 ]}および
• ZBTB17 . ^{[ 21 ]}

参考文献

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さらに読む

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