| CYFIP2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 別名 | CYFIP2、PIR121、細胞質FMR1相互作用タンパク質2、EIEE65、DEE65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | OMIM : 606323 ; MGI : 1924134 ; HomoloGene : 7936 ; GeneCards : CYFIP2 ; OMA : CYFIP2 - オーソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
細胞質FMR1相互作用タンパク質2は、ヒトではCYFIP2遺伝子によってコードされているタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]細胞質FMR1相互作用タンパク質は1253アミノ酸長のタンパク質であり、マウスのタンパク質と99%の配列同一性を持つ高度に保存されている。[ 5 ] [ 7 ]主に脳組織、白血球、腎臓で発現している。[ 8 ]
相互作用
CYFIP2はFMR1と相互作用することが示されています。[ 5 ] [ 9 ] CYFIP2はp-53誘導性タンパク質であり[ 10 ]、脆弱X精神遅滞タンパク質とも相互作用します。[ 11 ]
RNA編集
このタンパク質のpre- mRNAはRNA編集の対象となります。[ 12 ]編集部位は以前、dbSNPの一塩基多型(rs3207362)として記録されていました。[ 12 ]
タイプ
AからIへのRNA編集は、RNAに作用するアデノシンデアミナーゼ(ADAR)ファミリーによって触媒されます。ADARは、pre-mRNAの二本鎖領域内のアデノシンを特異的に認識し、イノシンに脱アミノ化します。イノシンは細胞の翻訳機構によってグアノシンとして認識されます。ADARファミリーにはADAR1~3の3つのメンバーがあり、酵素活性を持つのはADAR1とADAR2のみです。ADAR3 は脳において調節的な役割を果たしていると考えられています。ADAR1とADAR2は組織で広く発現していますが、ADAR3は脳に限定されています。RNAの二本鎖領域は、編集部位の近傍領域の残基と、通常は隣接するイントロン内の残基との塩基対形成によって形成されますが、エクソン配列の場合もあります。編集領域と塩基対を形成する領域は、編集相補配列(ECS)として知られています
部位
このタンパク質のpre-mRNAに編集部位が見つかりました。この置換はヒトおよびマウスにおいてアミノ酸位置320内で起こります。このpre-mRNAには、二本鎖RNA領域の可能性は検出されていません。[ 12 ] ADARに必要な二本鎖領域は予測されていません。免疫沈降実験およびRNA干渉により、ADAR2がこの部位の主な編集酵素であり、ADAR1はマイナーな役割を担っている可能性が高いことが示されています。[ 13 ] [ 14 ]
規制
編集は組織によって異なる制御を受けているようです。編集レベルが最も高いのは小脳で、ヒトの肺、前立腺、子宮の組織では編集頻度が低くなっています。編集頻度は組織によって30~85%の範囲で変化します。[ 12 ] [ 13 ] { [ 14 ]加齢とともにCYFIP2の編集が減少するという証拠がいくつかあります。[ 15 ]
保全
この遺伝子のpre-mRNAの編集は、マウスとニワトリで検出されています。[ 12 ]
RNA編集の影響
構造
編集によりコドンが変化し、リジンの代わりにグルタミン酸が翻訳されるようになります。[ 12 ]
機能
現在のところ不明ですが、編集はこのタンパク質のアポトーシス機能の調節に役割を果たしている可能性があります。このタンパク質はp53誘導性であるため、アポトーシス促進性があると考えられています。また、ADAR1ノックアウトマウスではアポトーシスの増加が見られ、編集が細胞プロセスの調節に関与している可能性を示唆しています。[ 10 ] [ 12 ]
参考文献
- ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000055163 – Ensembl、2017年5月
- ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000020340 – Ensembl、2017年5月
- ^ 「ヒトPubMedリファレンス:」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ 「マウスPubMedリファレンス:」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
- ^ a b c Schenck A, Bardoni B, Moro A, Bagni C, Mandel JL (2001年7月). 「脆弱X遺伝子疾患タンパク質(FMRP)と相互作用し、FMRP関連タンパク質FXR1PおよびFXR2Pと選択的に相互作用する高度に保存されたタンパク質ファミリー」 . Proc Natl Acad Sci USA . 98 (15): 8844–9 . Bibcode : 2001PNAS...98.8844S . doi : 10.1073 /pnas.151231598 . PMC 37523. PMID 11438699 .
- ^ 「Entrez Gene: CYFIP2 細胞質 FMR1 相互作用タンパク質 2」。
- ^ 「GRIA4 遺伝子 - GeneCards | GRIA4 タンパク質 | GRIA4 抗体」。
- ^ Su AI, Wiltshire T, Batalov S, et al. (2004年4月). 「マウスおよびヒトのタンパク質をコードするトランスクリプトームの遺伝子アトラス」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 (16): 6062–7 . Bibcode : 2004PNAS..101.6062S . doi : 10.1073 / pnas.0400782101 . PMC 395923. PMID 15075390 .
- ^ Bardoni B, Castets M, Huot ME, Schenck A, Adinolfi S, Corbin F, Pastore A, Khandjian EW, Mandel JL (2003年7月). 「FMRP(脆弱X染色体精神遅滞タンパク質)と相互作用する新規タンパク質82-FIPは、細胞周期依存的な細胞内局在を示す」 . Hum. Mol. Genet . 12 (14): 1689–98 . doi : 10.1093/hmg/ddg181 . PMID 12837692 .
- ^ a b Saller E, Tom E, Brunori M, et al. (1999年8月). 「121F変異体p53によるアポトーシス誘導の増加」 . EMBO J. 18 (16): 4424–37 . doi : 10.1093/emboj/18.16.4424 . PMC 1171517. PMID 10449408 .
- ^ Schenck, A., Bardoni, B., Moro, A., Bagni, C., Mandel, J.-L. (2001) Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 98, 8844-8849.
- ^ a b c d e f g Levanon EY, Hallegger M, Kinar Y, Shemesh R, Djinovic-Carugo K, Rechavi G, Jantsch MF, Eisenberg E (2005). 「進化的に保存されたヒトにおけるアデノシンからイノシンへのRNA編集標的」 Nucleic Acids Res . 33 (4): 1162–8 . doi : 10.1093/nar/gki239 . PMC 549564 . PMID 15731336 .
- ^ a b Riedmann EM, Schopoff S, Hartner JC, Jantsch MF (2008年6月). 「新規同定標的におけるADARを介したRNA編集の特異性」 . RNA . 14 ( 6): 1110–8 . doi : 10.1261/rna.923308 . PMC 2390793. PMID 18430892 .
- ^ a b Nishimoto Y, Yamashita T, Hideyama T, Tsuji S, Suzuki N, Kwak S (2008年6月). 「新規A-to-I編集位置における編集因子の決定」Neurosci. Res . 61 (2): 201–6 . doi : 10.1016/j.neures.2008.02.009 . PMID 18407364 . S2CID 26923552 .
- ^ Nicholas A, de Magalhaes JP, Kraytsberg Y, Richfield EK, Levanon EY, Khrapko K (2010年6月). 「ヒト脳におけるA-to-I mRNA編集の加齢に伴う遺伝子特異的変化」 . Mech. Ageing Dev. 131 (6): 445–7 . doi : 10.1016/j.mad.2010.06.001 . PMC 2915444. PMID 20538013 .
外部リンク
- UCSCゲノムブラウザにおけるヒトCYFIP2ゲノムの位置とCYFIP2遺伝子の詳細ページ
さらに詳しい情報
- 丸山 憲一、菅野 誠 (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ) : 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298
- 北村 哲、北村 泰、米澤 和 他(1996年)。 「Nck の SH3 ドメインと会合するタンパク質、p125Nap1 の分子クローニング」。生化学。生物物理学。解像度共通。219 (2): 509–14 .土井: 10.1006/bbrc.1996.0264。hdl : 20.500.14094/D1001555。PMID 8605018。
- 鈴木雄三、中川吉智、丸山健、他 (1997). 「全長エンリッチドcDNAライブラリーおよび5'末端エンリッチドcDNAライブラリーの構築と特性解析」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Witke W, Podtelejnikov AV, Di Nardo A, et al. (1998). 「マウス脳において、プロフィリンIとプロフィリンIIはエンドサイトーシス経路およびアクチンアセンブリーの制御因子と関連する」 . EMBO J. 17 ( 4): 967– 76. doi : 10.1093/emboj/17.4.967 . PMC 1170446. PMID 9463375 .
- Saller E, Tom E, Brunori M, et al. (1999). 「121F変異体p53によるアポトーシス誘導の増加」 . EMBO J. 18 ( 16): 4424–37 . doi : 10.1093/ emboj /18.16.4424 . PMC 1171517. PMID 10449408 .
- 広沢正之、永瀬毅、石川功、他 (2000). 「ヒト脳由来サイズ分画cDNAライブラリーからGeneMark解析により選別されたcDNAクローンの特性評価」 DNA Res . 6 (5): 329–36 . doi : 10.1093/dnares/6.5.329 . PMID 10574461 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 . Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). 「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログ作成に向けて:ヒトcDNAをコードする新規完全タンパク質500種の配列決定と解析」. Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Eden S, Rohatgi R, Podtelejnikov AV, et al. (2002). 「Rac1とNckによるWAVE1誘導性アクチン核形成の制御機構」. Nature . 418 ( 6899): 790–3 . Bibcode : 2002Natur.418..790E . doi : 10.1038/nature00859 . PMID 12181570. S2CID 4350733 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000以上のヒトおよびマウスの完全長cDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Salazar MA, Kwiatkowski AV, Pellegrini L, et al. (2004). 「bin/amphiphysin/RvsおよびDbl相同ドメインを含む新規タンパク質Tubaは、ダイナミンとアクチン細胞骨格の調節を結びつける」 . J. Biol. Chem . 278 (49): 49031–43 . doi : 10.1074/jbc.M308104200 . PMID 14506234 .
- Brajenovic M, Joberty G, Küster B, et al. (2004). 「ヒトParタンパク質複合体の包括的プロテオーム解析により、相互接続されたタンパク質ネットワークが明らかになる」 . J. Biol. Chem . 279 (13): 12804–11 . doi : 10.1074/jbc.M312171200 . PMID 14676191 .
- Innocenti M, Zucconi A, Disanza A, et al. (2004). 「Abi1はWAVE2シグナル伝達複合体の形成と活性化に必須である」Nat. Cell Biol . 6 (4): 319–27 . doi : 10.1038 / ncb1105 . PMID 15048123. S2CID 22767022 .
- Mayne M, Moffatt T, Kong H, et al. (2004). 「CYFIP2は多発性硬化症患者のCD4+細胞に多く存在し、T細胞接着に関与している」 . Eur. J. Immunol . 34 (4): 1217–27 . doi : 10.1002/eji.200324726 . PMID 15048733 .
- Jin J, Smith FD, Stark C, et al. (2004). 「細胞骨格制御と細胞組織化に関与するin vivo 14-3-3結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベース解析」 . Curr. Biol . 14 (16): 1436–50 . Bibcode : 2004CBio...14.1436J . doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). 「NIH完全長cDNAプロジェクト:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)の現状、品質、および拡大」. Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). 「ORFeomeから生物学へ:機能ゲノミクスパイプライン」. Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .
- Levanon EY, Hallegger M, Kinar Y, et al. (2005). 「アデノシンからイノシンへのRNA編集における進化的に保存されたヒト標的」 . Nucleic Acids Res . 33 (4): 1162–8 . arXiv : q-bio/0502045 . doi : 10.1093/nar/ gki239 . PMC 549564. PMID 15731336 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップの構築に向けて」Nature . 437 (7062): 1173–8 . Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .