コロナウイルス科
コロナウイルス科
コロナウイルス
コロナウイルスの種類の図、電子顕微鏡写真、ゲノム。
ウイルスの分類この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: リボビリア
王国： オルタナウイルス科
門: ピスビリコタ
クラス： ピソニウイルス科
注文： ニドウイルス目
亜目: コルニドビリネ科
家族： コロナウイルス科
亜科と属

コロナウイルス科は、魚類、両生類、鳥類、哺乳類に感染するエンベロープを持つプラス鎖RNAウイルスの科です。このグループには、レトウイルス亜科、オルソコロナウイルス亜科、ピトウイルス亜科が含まれます。オルソコロナウイルス亜科に属するウイルスはコロナウイルスとして知られています。

ウイルスゲノムの長さは26～32キロベースです。粒子は通常、大きな（約20ナノメートル）棍棒状または花びら状の表面突起（「ペプロマー」または「スパイク」）で覆われており、球状粒子の電子顕微鏡写真では太陽コロナを思わせる像を形成します。[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]

ウイルス学

コロナウイルスの複製サイクル

ゲノムの 5' 末端と 3' 末端には、それぞれキャップとポリ A 領域がある。小胞体(ER) またはゴルジ体の膜から出芽して得られるウイルスエンベロープには、スパイク (S) タンパク質と膜 (M) タンパク質として知られる、ウイルス特有の 2種類の糖タンパク質が必ず含まれる。スパイクタンパク質は大きな表面突起 (ペプロマーと呼ばれることもある) を構成し、膜タンパク質は 3 回貫通の膜タンパク質である。トロウイルスおよび選ばれたコロナウイルスのサブセット (特にベータコロナウイルス属のサブグループ A のメンバー) は、S で構成されるペプロマーに加​​えて、ヘマグルチニン エステラーゼタンパク質で構成される 2 つ目のタイプの表面突起を持っている。もう一つの重要な構造タンパク質はリン酸化タンパク質ヌクレオカプシドタンパク質（N）であり、ゲノムRNAを囲むヌクレオカプシドのらせん対称性を担っています。[ 4 ] 4番目で最も小さいウイルス構造タンパク質はエンベロープタンパク質（E）として知られており、ウイルスの出芽に関与していると考えられています。[ 5 ]

遺伝子組換えは、少なくとも2つのウイルスゲノムが同一の感染宿主細胞内に存在する場合に発生する可能性があります。RNA組換えは、コロナウイルスの進化における主要な原動力であると考えられます。組換えは、CoV種内の遺伝的変異、CoV種が宿主から宿主へ移動する能力、そして稀に新規CoVの出現を決定づける可能性があります。[ 6 ] CoVにおける組換えの正確なメカニズムは不明ですが、ゲノム複製中のテンプレートスイッチが関与していると考えられます。[ 6 ]

分類学

ヒトに病原性のある種を含むコロナウイルス科の分類

コロナウイルス科は、3つの亜科、6つの属、28の亜属、54の種で構成されています。[ 7 ]追加の種は保留中または暫定的です。[ 8 ]科の亜科と属を以下に列挙します（- virinae は亜科、- virus は属を示します）。[ 7 ]

コロナウイルス

コロナウイルスはオルトコロナウイルス科（Orthocoronavirinae）の一般名であり、以前はコロナウイルス科と呼ばれていた。[ 10 ] [ 11 ]コロナウイルスは哺乳類や鳥類に病気を引き起こす。ヒトでは、このウイルスは呼吸器感染症を引き起こす。4種類のヒトコロナウイルスは通常は風邪の軽い症状を引き起こすが、3種類はより重篤な病気を引き起こし、致命的となることが知られている。SARSを引き起こすSARS-CoV-1、MERSを引き起こすMERS-CoV、COVID-19を引き起こすSARS-CoV-2である。[ 12 ]症状は種によって異なり、ニワトリでは上気道疾患を引き起こし、ウシやブタでは下痢を引き起こす。SARS-CoV-2以外には、ヒトコロナウイルス感染症を予防または治療するワクチンや抗ウイルス薬はない。これらは、プラスセンスの一本鎖RNAゲノムとらせん対称のヌクレオカプシドを持つエンベロープウイルスである。コロナウイルスのゲノムサイズは約26～32キロベースで、 RNAウイルスとしては最大級の大きさです（最近プラナリアで発見された41キロベースニドウイルスに次ぐものです）。[ 13 ]

宿主種を色で示したコロナウイルス科の系統樹

参考文献

  1. ^アルファルーク、ハリド・O.アル・フーフィー、サリ TS;アーメド、サムラインBM;シャバナ、モナ。アーメド、アーメド。アルカタニ、サード S.アルカタニ、アリ S.アルカタニ、アリ M.ラマダン、アブデルラフマン M.アーメド、モハメド E.アリ、ヘイヤム S.バシール、アディル。デヴェサ、イエス。カルドン、ローザ A.イブラヒム、ムンタセル E.シュワルツ、ローラン。レシュキン、ステファン・J.（2021年5月21日）。「新型コロナウイルス感染症（COVID-19）の病因と管理」。生体異物学ジャーナル。11 (2): 77–93。土井: 10.3390/jox11020006。PMC  8163157。PMID  34063739。
  2. ^ King, Andrew MQ; Adams, Michael J.; Carstens, Eric B.; Lefkowitz, Elliot J. 編 (2012-01-01). 「ニドウイルス目」 .ウイルス分類学. Elsevier. pp.  784– 794. doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00066-5 . ISBN 978-0-12-384684-6. PMC  7150239 . S2CID  218627729 . 2020年6月8日閲覧.
  3. ^ Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. (2018-11-01). 「新科アビソウイルス科およびコロナウイルス科の姉妹群であるアルファレトウイルス属のメタトランスクリプトームニドウイルス様ゲノムの記述と初期特性評価」 . Virology . 524 : 160–171 . doi : 10.1016 /j.virol.2018.08.010 . ISSN 0042-6822 . PMC 7112036. PMID 30199753 .   
  4. ^ McBride R, van Zyl M, Fielding BC (2014年8月). 「コロナウイルスのヌクレオカプシドは多機能タンパク質である」 .ウイルス. 6 ( 8): 2991– 3018. doi : 10.3390/v6082991 . PMC 4147684. PMID 25105276 .  
  5. ^シューマン、デワルド;フィールディング、バートラム C. (2019 年 12 月)。「コロナウイルスエンベロープタンパク質：最新の知識」。ウイルス学ジャーナル。16 (1): 69.土井: 10.1186/s12985-019-1182-0。PMC 6537279。PMID 31133031。  
  6. ^ a b Su, S; Wong, G; Shi, W; Liu, J; Lai, ACK; Zhou, J; Liu, W; Bi, Y; Gao, GF (2016年6月). 「コロナウイルスの疫学、遺伝子組換え、および病原性」 . Trends Microbiol . 24 (6): 490– 502. doi : 10.1016/ j.tim.2016.03.003 . PMC 7125511. PMID 27012512 .  
  7. ^ a b「ウイルス分類：2024年版」国際ウイルス分類委員会。 2025年4月4日閲覧。
  8. ^ Gorbalenya A, Baker S, Baric R, de Groot R, Drosten C, Gulyaeva A, Haagmans B, Lauber C, Leontovich A, Neuman B, Penzar D, Perlman S, Poon L, Samborskiy D, Sidorov I, Sola I, Ziebuhr J (2020). 「重症急性呼吸器症候群関連コロナウイルス：2019-nCoVの分類とSARS-CoV-2の命名」 . Nature Microbiology . 5 (4): 536– 44. doi : 10.1038/s41564-020-0695-z . PMC 7095448. PMID 32123347 .  
  9. ^ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (2019年3月). 「中国におけるコウモリコロナウイルス」 .ウイルス. 11 ( 3): 210. doi : 10.3390/v11030210 . PMC 6466186. PMID 30832341 .  
  10. ^ "2017.012-015S" (xlsx) .国際ウイルス分類委員会 (ICTV) . 2018年10月. 2019年5月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2020年1月24日閲覧。
  11. ^ 「ICTV分類の歴史：オルソコロナウイルス科」国際ウイルス分類委員会（ICTV） . 2020年1月24日閲覧。
  12. ^ 「2019～2020年新型コロナウイルス（重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2）パンデミック：アメリカ国際医学会・世界救急医学会学術会議による多分野COVID-19ワーキンググループ合同コンセンサスペーパー」 ResearchGate 。 2020年5月16日閲覧。
  13. ^ Saberi A, Gulyaeva AA, Brubacher JL, Newmark PA, Gorbalenya AE (2018年11月). Stanley P (編). 「プラナリアニドウイルスがRNAゲノムサイズの限界を拡大」 . PLOS Pathogens . 14 (11) e1007314. doi : 10.1371/journal.ppat.1007314 . PMC 6211748. PMID 30383829 .  
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