ファンシー
ファンシー
利用可能な構造
PDBヒトUniProt検索：PDBe RCSB
識別子
エイリアスFANCE、FACE、FAE、ファンコニ貧血相補群E、FA相補群E
外部IDオミム: 613976 ; MGI : 1920025 ;ホモロジーン: 11066 ;ジーンカード：FANCE ; OMA : FANCE - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

2178

72775

アンサンブル

ENSG00000112039

ENSMUSG00000007570

ユニプロット

Q9HB96

該当なし

RefSeq (mRNA)

NM_021922

NM_001163819 NM_001163820 NM_028348

RefSeq（タンパク質）

NP_068741

該当なし

場所（UCSC）6章: 35.45 – 35.47 Mb17章: 28.53 – 28.55 Mb
PubMed検索[ 3 ][ 4 ]
ウィキデータ
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ファンコニ貧血相補群Eタンパク質は、ヒトではFANCE遺伝子によってコードされているタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]ファンコニ貧血相補群（FANC）には現在、FANCA、FANCB、FANCC、FANCD1（BRCA2とも呼ばれる）、FANCD2、FANCE、FANCF、FANCG、およびFANCLが含まれる。ファンコニ貧血は、細胞遺伝学的不安定性、DNA架橋剤に対する過敏症、染色体切断の増加、およびDNA修復の欠陥を特徴とする遺伝的に異質な劣性疾患である。ファンコニ貧血相補群のメンバーは配列の類似性を共有していないが、共通の核タンパク質複合体への組み立てによって関連している。この遺伝子は相補群Eのタンパク質をコードしている。[ 7 ]

FANCEタンパク質（およびFANCC、FANCF、FANCG）を含む核複合体は、FANCD2タンパク質をモノユビキチン化したアイソフォームに活性化するために必須である。[ 8 ]正常な非変異細胞では、FANCD2はDNA損傷に反応してモノユビキチン化される。FANCEはFANCC とともに、この反応の基質アダプターとして機能する。[ 9 ]活性化FANCD2タンパク質は、電離放射線誘発性病巣および減数分裂染​​色体のシナプトネマ複合体においてBRCA1（乳がん感受性タンパク質） と共局在する。活性化FANCD2タンパク質は、減数分裂組換えの開始前に機能し、おそらくシナプス用の染色体を準備するため、またはその後の組換えイベントを制御するためであると考えられる。[ 8 ]

遺伝子発現

FANCEは151の臓器で発現しており、最も高いレベルは女性の生殖腺で発現していると言われている。[ 10 ]

染色体位置

この遺伝子の位置は6p21.31で、pは6番染色体の短腕の21.31番目の位置である[ 11 ]

分子レベルでの位置は、6番染色体の塩基対35,452,339から35,467,106である（ホモサピエンスアノテーションリリース109、GRCh38.p12）[ 11 ]

タンパク質の特性

FAの主な複合体には、主に8つのFAタンパク質からなる核多サブユニット複合体が含まれています。[ 12 ]これにより、DNA損傷または重複圧を受けてFANCD2に1本のユビキチン鎖が追加されます。[ 13 ]

FANCCの収集において、FANCEは核内およびコア複合体の形成において重要な役割を果たします。FANCEの特徴として、ユビキチン化されたFANCD2、BRCA2、そして構築された核フォーカスと会合できることが挙げられます。また、FANCEはFANCD2と直接結合する唯一のタンパク質であり、FAコア複合体とFANCD2の間に必要な結合を提供します。[ 14 ]

FANCEの構造は、その表面にFANCD2との結合に重要なエピトープを有しています。アミノ酸分析では、反復ヘリックスモチーフの存在は明らかではありませんでした。

タンパク質構造

13本のαヘリックス、13本の10ヘリックス、βストランドを含まない。長球状ではなく、70Åのnサイズを持つ。幅30Å、厚さ20Å。N末端からC末端にかけて右手方向に連続的に折り畳まれる。C末端にヘリックスがあるため、識別は容易である。[ 14 ]

関数

これはDNAの架橋を修復し、FANCCの核内蓄積に必要であり、FA複合体とFANCD2の間に重要な橋渡しをします。[ 15 ]

FANCE欠損マウスでは卵母細胞数の減少と減数分裂前期Iの破壊が見られ[ 16 ]、 FANCEが減数分裂に重要な役割を果たしていることを示している。

アプリケーション

  • FANCEはウエスタンブロット法やIHC-P （免疫組織化学）に応用されており、ウエスタンブロット法では予測分子量が58kDaであり、IHC-Pの開始前にクエン酸緩衝液pH6で抗原回収が行われた。[ 15 ]
  • FANCEは遺伝子マッピング、特にホモ接合性マッピングにも用いられ、3つのDNA細胞と融合することで、DNA架橋剤であるマイトマイシンC（シグマ社製）の複合剤に対する感受性の算出に役立ちます。また、マイクロサテライトマーカーD6S422およびD6S1610 [ 17 ]を用いたリンキングも検討します。これにより、染色体6p上のFANCE領域が特定されます。[ 17 ]
  • 免疫ブロット法では、FANCE-L348MおよびFANCE-E263K変異体はFA-E EUFA409 LCLの核膜に分裂を示し、FANCEが推定核局在シグナルを持っているにもかかわらず、主に核内に限定されていることが示された[ 18 ] 。 [ 19 ]

相互作用

FANCE は以下と相互作用することが示されています:

参考文献

  1. ^ a b c GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000112039 – Ensembl、2017年5月
  2. ^ a b c GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000007570 – Ensembl、2017年5月
  3. ^ 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  4. ^ 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
  5. ^ Joenje H、Lo ten Foe JR、Oostra AB、van Berkel CG、Rooimans MA、Schroeder-Kurth T、Wegner RD、Gille JJ、Buchwald M、Arwert F (1995 年 9 月)。「相補性分析によるファンコニ貧血患者の分類: 5 番目の遺伝的サブタイプの証拠」。血。86 (6): 2156–60 .土井: 10.1182/blood.V86.6.2156.bloodjournal8662156。PMID 7662964。 
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さらに読む

  • PDBe-KBのUniProt : Q9HB96 (ファンコニ貧血グループ E タンパク質)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
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