国際ヒトエピゲノムコンソーシアム
国際ヒトエピゲノムコンソーシアム（IHEC）は、2010年に設立された科学組織であり、エピゲノミクス分野における世界的な取り組みの調整を支援しています。[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ]当初の目標は、さまざまな種類の正常および疾患関連のヒト細胞型から少なくとも1,000の参照（ベースライン）ヒトエピゲノムを生成することでした。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
構造と資金調達
IHECの運営は、正会員（国および地域の科学助成機関）から資金提供を受けており、参加する助成機関やエピゲノムマッピングプロジェクトの科学者やその他の専門家が主にボランティアとして人員を配置している。[ 8 ]
現在のIHEC加盟国
- カナダ保健研究機構（カナダ）[ 9 ]
- 欧州委員会（EU）[ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ]
- 連邦教育研究省、ドイツ航空宇宙センター内のプロジェクト管理機関（ドイツ）[ 15 ] [ 16 ]
- シンガポールゲノム研究所（シンガポール）[ 17 ]
- 香港エピゲノミクスプロジェクト（香港）[ 18 ] [ 19 ]
- 日本医療研究開発機構（日本）[ 20 ]
- 国立衛生研究所（韓国）
- 国立衛生研究所：ロードマップエピゲノミクスプログラム[ 21 ]およびDNA要素百科事典（ENCODE）プロジェクト（米国）
さらに、IHECの目標を支持する国や機関は、プロジェクトにまだ全額の資金提供をしていないが、メンバーが時間と専門知識を提供している組織である。[ 22 ]
- 欧州腫瘍学研究所、FIRC分子腫瘍学財団研究所、イタリア工科大学、ゲノム科学センター（イタリア）
- 国立研究機関（フランス）
- 国立保健医療研究評議会（オーストラリア）
- 英国の資金提供者連合：医学研究会議、バイオテクノロジー・生物科学研究会議、英国がん研究機構、ウェルカム・トラスト（英国）
IHECの監督は、正会員組織によって指名された執行委員会によって行われます。[ 23 ]この委員会は、参加プロジェクトの科学的リーダーやエピジェネティクス分野のリーダーで構成される国際科学運営委員会、そしてデータコーディネーションセンターと緊密に連携しています。また、参加研究プロジェクトのメンバーで構成されるワーキンググループからも専門知識が提供されています。
IHECは、国際がんゲノムコンソーシアム（ICGC）[ 24 ] ENCODE、[ 25 ] [ 26 ]およびゲノムと健康のための世界同盟[ 27 ]などの他の大規模な国際ゲノミクスプロジェクトと相互作用し、その取り組みを調整しています。委員会と作業部会のメンバー、およびIHECに関与する他の個人は、加盟国が持ち回りで主催するイベントで毎年会合を開いています。[ 28 ]ほとんどの会議は科学シンポジウムと併せて開催され、そのいくつかはIHEC以外の科学者や時には一般の人々に公開されています。
目標
IHECの究極の目的は、エピゲノムが世代を超えて、そして環境に応じて人類集団をどのように形作ってきたかを明らかにすることです。[ 25 ] [ 29 ] IHECの活動の第一段階では、健康なヒト細胞と病気のヒト細胞、および特定のヒト疾患に関連する限られた数のモデル生物から少なくとも1,000の参照エピゲノムの生成を調整します。最初の焦点は、幹細胞性、不死、増殖、分化、老化、ストレスなどの細胞の状態に置かれています。各サンプルの参照エピゲノムは、DNAメチル化と主要な調節性ヒストン修飾の高解像度マップと、転写されたすべての遺伝子（タンパク質コード遺伝子と非コードRNA / 小さなRNA）の種類と発現レベルに関する対応情報で構成されています。[ 30 ] 生成されたデータは、IHECデータポータル、[ 31 ] [ 32 ]欧州ゲノムフェノムアーカイブ（EGA）、[ 33 ]およびその他の場所を通じて研究コミュニティに無料で公開されます。[ 34 ] [ 25 ] [ 35 ]
さらに、参加している研究プロジェクトでは、新しいエピゲノミクスと関連するバイオインフォマティクス手法の開発に取り組んでいます。
2016年11月、カナダ、欧州連合のBLUEPRINTコンソーシアム、ドイツのエピゲノムプログラム「DEEP」、日本、シンガポール、米国のIHECメンバーは、Cell Pressなどのジャーナルに41本の共同論文を発表しました。[ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] [ 39 ]これらの論文には、分子生物学と計算手法の説明に加えて、正常生物学と疾患生物学に関する新しい研究が含まれていました。[ 40 ] [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ]
参照
参考文献
- ^ 「エピゲノムの時代」 Nature 463 ( 7281): 587. 2010年2月. Bibcode : 2010Natur.463Q.587 . doi : 10.1038 /463587a .
- ^ Abbott, Alison (2010年2月1日). 「ゲノム上のマークをマッピングするプロジェクトが始動」 Nature 463 ( 7281): 596– 597. doi : 10.1038/463596b .
- ^ Bae, JB (2013). 「国際ヒトエピゲノムコンソーシアムの展望」 . Genomics Inform . 11 (1): 7– 14. doi : 10.5808/GI.2013.11.1.7 . PMC 3630389. PMID 23613677 .
- ^ McDermott, Charlie. 「BioNews - ヒトエピゲノムプロジェクト開始」 BioNews . 2010年12月28日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ 「フランス：ヒトエピゲノムコンソーシアムが第一歩を踏み出す」 2010年3月5日。2015年7月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^金井 八重; 新井 恵理 (2014). 「ヒトがんの多層オミクス解析：国際ヒトエピゲノムコンソーシアムの活動に基づくバイオマーカーと創薬ターゲットの探索」 . Frontiers in Genetics . 5. doi : 10.3389/fgene.2014.00024 . PMC 3924033 .
- ^ GmbH, Eurice. 「IHECについて · IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ GmbH, Eurice. 「IHEC加盟国・IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「CEEHRC概要 - CIHR」 .カナダ保健研究所. 2011年6月15日. 2025年5月31日閲覧。
- ^ 「EU、健康研究の新たな領域開拓に3000万ユーロを投資」欧州委員会、2011年10月3日。2011年10月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^「幹細胞から血液細胞への旅が明らかに：BLUEPRINT研究は血液細胞の生成を制御するイベントをカタログ化します」。
- ^「血液幹細胞によって白血球が形成される仕組みのカタログ」。
- ^ Abbott, Alison (2011年9月28日). 「ヨーロッパ、ヒトエピゲノムのマッピングへ」 . Nature . 477 (7366): 518. Bibcode : 2011Natur.477..518A . doi : 10.1038/477518a .
- ^ GmbH, Eurice. 「IHEC、2つの新しい欧州メンバープロジェクトを歓迎 | IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ "Deutsche Beteiligung am International Human Epigenome Consortium (IHEC)" [ドイツの国際ヒトエピゲノムコンソーシアム（IHEC）への参加] www.gesundheitsforschung-bmbf.de (ドイツ語). 2017年7月12日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2025年5月31日閲覧。
- ^ 「プロジェクト | DEEP」 . www.deutsches-epigenom-programm.de . 2025年5月31日閲覧。
- ^ "シンガポール・IHEC" . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ GmbH, Eurice. 「IHEC、香港エピゲノミクス・プロジェクトをコンソーシアムの新メンバーとして歓迎 | IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「香港エピゲノミクスプロジェクト」epihk.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「国際ヒトエピゲノムコンソーシアム（IHEC）｜外部機関との連携・協力｜国立研究開発法人日本医療研究開発機構」 www.amed.go.jp . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「Roadmap Epigenomics Project - Home」 . www.roadmapepigenomics.org . 2021年4月8日時点のオリジナルよりアーカイブ。2017年7月18日閲覧。
- ^ Eurice GmbH.「IHEC Members · IHEC」Wayback Machineで2013年10月8日にアーカイブ。
- ^ GmbH, Eurice. 「IHECワーキンググループ·IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2017年6月23日閲覧。
- ^「ゲノム医療 | 認可 | がんゲノム配列解析とエピゲノムマッピングプロジェクトの相乗効果と競争」Wayback Machineに2014年6月28日アーカイブ。
- ^ a b c Eurice GmbH. 「目的」 .
- ^ Perry, Ann (2014年6月25日). 「動物ゲノムの深掘り」 . Bovine Veterinarian . 2015年7月9日時点のオリジナルよりアーカイブ。
- ^ 「ホーム | Global Alliance for Genomics and Health」genomicsandhealth.org . 2017年7月18日閲覧。
- ^ Eurice GmbH.「ニュース+イベント · IHEC」 .
- ^スタネンバーグ、ヘンドリック G.;アブリニャーニ、セルジオ。アダムズ、デイビッド。アルメイダ、メラニー・デ。アルトゥッチ、ルチア。アミン、ヴィレン。アミット、イド。アントナラキス、スティリアノス E.アパリシオ、サミュエル (2016-11-17)。「国際ヒトエピゲノムコンソーシアム: 科学的協力と発見のための青写真」。セル。167 (5): 1145–1149。土井: 10.1016/j.cell.2016.11.007。hdl : 2445/124834。ISSN 0092-8674。PMID 27863232。
- ^ GmbH, Eurice. 「Protocols and Standards · IHEC」 . ihec-epigenomes.org . 2018年10月12日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2025年5月31日閲覧。
- ^ 「データポータル | IHEC」 . epigenomesportal.ca . 2017年6月23日閲覧。
- ^デビッド・ビジョルド;モライス、デヴィッド・アンダーソン・デリマ。ゴーティエ、キャロル。コート、カトリーヌ。カロン、マキシム。クワン、トニー。チェン、クアン・チョン。ラパール、ジョナサン。マルコヴィッツ、アレクセイ・ノーデル (2016-11-23)。「国際ヒトエピゲノムコンソーシアムデータポータル」。細胞システム。3 (5): 496–499.e2。土井：10.1016/j.cels.2016.10.019。ISSN 2405-4712。PMID 27863956。
- ^ 「IHECが共同で発表した論文」 EGAブログ。 2017年6月23日閲覧。
- ^ Eurice GmbH.「IHECについて」 .
- ^「IHECデータポータル」。
- ^ 「コンソーシアム：IHEC」 . Cell Press . 2017年6月23日閲覧。
- ^ Cell編集チーム (2016年11月17日). 「ヒトエピゲノミクスにおける進歩の宝庫」 . Cell . 167 (5): 1139. doi : 10.1016/j.cell.2016.11.001 . ISSN 0092-8674 . PMID 27863229 .
- ^ 「ウェブ上のエピジェネティクス：2016年のトップエピジェネティクスストーリー - エピジェネティクス」。エピジェネティクス。 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「エピジェネティクスに関する40以上の新論文が出版｜The Scientist Magazine®」 The Scientist . 2017年6月23日閲覧。
- ^ Chin, Neo Chai (2016年11月18日). 「シンガポールの科学者、自閉症研究のブレークスルーに貢献」 . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「国際コンソーシアムメンバーによるがんエピゲノム知見の報告」 GenomeWeb 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「エピゲノムコンソーシアムの研究チームが免疫応答エピジェネティクスに取り組む」 GenomeWeb . 2017年6月23日閲覧。
- ^ 「血液細胞の遺伝子変異が一般的な疾患に与える影響」 Medical XPress . 2016年11月23日. 2017年6月23日閲覧。
