RBBP5

RBBP5
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 3P4F、4X8N、4X8P、5F6K、5F6L
識別子
エイリアス	RBBP5、RBQ3、SWD1、網膜芽細胞腫結合タンパク質5、RB結合タンパク質5、ヒストンリジンメチルトランスフェラーゼ複合体サブユニット
外部ID	オミム: 600697 ; MGI : 1918367 ;ホモロジーン: 3709 ;ジーンカード: RBBP5 ; OMA : RBBP5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 染色体1（ヒト）[ 1 ] バンド 1q32.1 始める 205,086,142 bp [ 1 ] 終わり 205,122,015 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 染色体1（マウス）[ 2 ] バンド 1|1 E4 始める 132,405,103 bp [ 2 ] 終わり 132,433,397 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 口腔粘膜細胞 二次卵母細胞 睾丸 生殖腺 アキレス腱 ランゲルハンス島 神経節隆起 心室帯 子宮内膜間質細胞 単球 上位の表現 手 顆頭 窩 接合子 三叉神経節 耳石器官 胚の尾 卵形嚢 網膜の神経層 性器結節 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 メチル化ヒストン結合 タンパク質結合 ヒストンメチルトランスフェラーゼ活性（H3-K4特異的） ヒストンリジンN-メチルトランスフェラーゼ活性 細胞成分 MLL1複合体 核小体 MLL3/4複合体 核 核質 ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体 Set1C/COMPASS複合体 生物学的プロセス エストロゲンへの反応 ヒストンH3-K4のメチル化 転写の制御、DNAテンプレート 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞応答 β-カテニン-TCF複合体の組み立て 翻訳後タンパク質修飾 巨核球分化の制御 クロマチン組織 出典：Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5929 213464 アンサンブル ENSG00000117222 ENSMUSG00000026439 ユニプロット Q15291 Q8BX09 RefSeq (mRNA) NM_001193272 NM_001193273 NM_005057 NM_172517 NM_001357486 NM_001357487 RefSeq（タンパク質） NP_001180201 NP_001180202 NP_005048 NP_766105 NP_001344415 NP_001344416 場所（UCSC） 1章: 205.09 – 205.12 MB 1 章: 132.41 – 132.43 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
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網膜芽細胞腫結合タンパク質5は、ヒトではRBBP5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

関数

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、普遍的に発現する核タンパク質であり、WDリピートタンパク質の高度に保存されたサブファミリーに属する。これは、細胞増殖を制御する網膜芽細胞腫タンパク質に直接結合するいくつかのタンパク質の中に見出される。コードされるタンパク質は、E1A結合ポケットBを介して、低リン酸化網膜芽細胞腫タンパク質と優先的に相互作用する。^{[ 6 ]}

相互作用

RBBP5 は以下と相互作用することが示されています。

• ASCL2 , ^{[ 7 ]}
• MLL、^{[ 8 ]}
• MLL3、^{[ 7 ]} および
• NCOA6 . ^{[ 7 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000117222 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000026439 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Saijo M, Sakai Y, Kishino T, Niikawa N, Matsuura Y, Morino K, Tamai K, Taya Y (1995年6月). 「網膜芽細胞腫タンパク質に結合するヒトタンパク質の分子クローニングと染色体マッピング」. Genomics . 27 (3): 511–9 . doi : 10.1006/geno.1995.1084 . PMID 7558034 . 
6. 「Entrez Gene: RBBP5 網膜芽細胞腫結合タンパク質5」。
7. Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC, Lee JW (2003年1月). 「活性化シグナルコインテグレーター2は、トリソラックス群タンパク質のサブセットを含む新規定常状態複合体に属する」 . Molecular and Cellular Biology . 23 (1): 140–9 . doi : 10.1128/mcb.23.1.140-149.2003 . PMC 140670. PMID 12482968 .  
8. Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (2004年7月). 「白血病プロトオンコプロテインMLLはメニンとSET1様ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体を形成し、Hox遺伝子発現を制御する」 . Molecular and Cellular Biology . 24 (13): 5639–49 . doi : 10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004 . PMC 480881. PMID 15199122 .  

さらに読む

• ヒリアー・LD、レノン・G、ベッカー・M、ボナルド・MF、チアペリ・B、チッソー・S、ディートリッヒ・N、デュビューク・T、ファヴェッロ・A、ギッシュ・W、ホーキンス・M、ハルトマン・M、クカバ・T、レイシー・M、ル・M、ル・N、マーディス・E、ムーア・B、モリス・M、パーソンズ・J、プランゲ・C、リフキン・L、ロールフィング・T、シェレンバーグ・K、ベントソアレス M、タン F、ティエリー メグ J、トレバスキス E、アンダーウッド K、ウォルドマン P、ウォーターストン R、ウィルソン R、マーラ M (1996 年 9 月)。「280,000 個のヒト発現配列タグの生成と分析」。ゲノム研究。6 (9): 807–28 .土井: 10.1101/gr.6.9.807。PMID  8889549。
• 鈴木裕、角田隆、瀬瀬Ｊ、平裕、水島菅野Ｊ、畑裕、太田隆、磯貝隆、田中隆、中村裕、陶山Ａ、坂木裕、森下裕、大久保Ｋ、菅野Ｓ（2001年5月）。「1031種類のヒト遺伝子の潜在的なプロモーター領域の同定と特性評価」。ゲノム研究。11 (5): 677–84 .土井: 10.1101/gr.gr-1640r。PMC  311086。PMID  11337467。
• Goo YH, Sohn YC, Kim DH, Kim SW, Kang MJ, Jung DJ, Kwak E, Barlev NA, Berger SL, Chow VT, Roeder RG, Azorsa DO, Meltzer PS, Suh PG, Song EJ, Lee KJ, Lee YC, Lee JW (2003年1月). 「活性化シグナルコインテグレーター2は、トリソラックス群タンパク質のサブセットを含む新規定常状態複合体に属する」 . Molecular and Cellular Biology . 23 ( 1): 140–9 . doi : 10.1128/MCB.23.1.140-149.2003 . PMC  140670. PMID  12482968 .
• Hughes CM, Rozenblatt-Rosen O, Milne TA, Copeland TD, Levine SS, Lee JC, Hayes DN, Shanmugam KS, Bhattacharjee A, Biondi CA, Kay GF, Hayward NK, Hess JL, Meyerson M (2004年2月). 「メニンはトリソラックスファミリーヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体およびhoxc8遺伝子座と関連する」 . Molecular Cell . 13 (4): 587–97 . doi : 10.1016/S1097-2765(04)00081-4 . PMID  14992727 .
• 横山 明、王 Z、ワイソッカ J、サンヤル M、オーフィエロ DJ、北林 郁、ヘラー W、クリアリー ML (2004年7月). 「白血病プロトオンコプロテインMLLはメニンとSET1様ヒストンメチルトランスフェラーゼ複合体を形成し、Hox遺伝子発現を制御する」 .分子細胞生物学. 24 (13): 5639–49 . doi : 10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004 . PMC  480881. PMID  15199122 .
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• Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006年11月). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、in vivo、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」 . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016 / j.cell.2006.09.026 . PMID  17081983. S2CID  7827573 .