POLR2B

POLR2B
利用可能な構造 PDB オーソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 5IY9、5IYA、5IYC、5IYB、5IY7、5IY8、5IYD、5IY6​​​​​​
識別子
エイリアス	POLR2B、POL2RB、RPB2、hRPB140、hsRPB2、ポリメラーゼ（RNA）IIサブユニットB、RNAポリメラーゼIIサブユニットB
外部ID	オミム: 180661 ; MGI : 2388280 ;ホモロジーン: 722 ;ジーンカード: POLR2B ; OMA : POLR2B - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） キリスト 4番染色体（ヒト）[ 1 ] バンド 4q12 始める 56,977,722 bp [ 1 ] 終わり 57,031,158 bp [ 1 ]
遺伝子の位置（マウス） キリスト 5番染色体（マウス）[ 2 ] バンド 5|5 C3.3 始める 77,457,994 bp [ 2 ] 終わり 77,497,171 bp [ 2 ]
RNA発現パターン ブギー 人間 マウス（相同遺伝子） 上位の表現 鼻咽頭上皮 胚上皮 内皮細胞 中側頭回 脛骨 人間のペニス 歯肉上皮 ブロードマン野23 壁側胸膜 アキレス腱 上位の表現 球形嚢 耳板 耳小胞 原始的な条線 毛包 毛様体 尿管 性器結節 髄質集合管 蝸牛管の前庭膜 より多くの参照表現データ バイオGPS より多くの参照表現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 トランスフェラーゼ活性 DNA結合 ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性 リボヌクレオシド結合 RNAポリメラーゼII活性 クロマチン結合 金属イオン結合 DNA指向性5'-3' RNAポリメラーゼ活性 タンパク質結合 RNA結合 細胞成分 膜 RNAポリメラーゼII、コア複合体 核 核質 生物学的プロセス スプライソソームを介したmRNAスプライシング 体性幹細胞集団の維持 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング RNAポリメラーゼIIによる転写 ウイルス転写の正の制御 転写連動ヌクレオチド除去修復 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート RNA代謝プロセス miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 出典：Amigo / QuickGO
オーソログ 種 人間 ねずみ エントレズ 5431 231329 アンサンブル ENSG00000047315 ENSMUSG00000029250 ユニプロット P30876 Q8CFI7 RefSeq (mRNA) NM_001303269 NM_000938 NM_001303268 NM_153798 RefSeq（タンパク質） NP_000929 NP_001290197 NP_001290198 NP_722493 場所（UCSC） 4章: 56.98 – 57.03 MB 5番目の文字: 77.46 – 77.5 Mb PubMed検索 [ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
人間の表示/編集 マウスの表示/編集

DNA指向性RNAポリメラーゼIIサブユニットRPB2は、ヒトではPOLR2B遺伝子によってコードされる酵素である。^{[ 5 ] [ 6 ]}

この遺伝子は、真核生物においてメッセンジャーRNAの合成を担うポリメラーゼであるRNAポリメラーゼIIの2番目に大きいサブユニットをコードしています。このサブユニットは、少なくとも他の2つのポリメラーゼサブユニットと結合して、ポリメラーゼ活性部位におけるDNA鋳型と新たに合成されたRNAとの接触を維持する構造を形成します。^{[ 7 ]}

相互作用

POLR2BはPOLR2C、^{[ 8 ]} POLR2E、^{[ 8 ]} POLR2H ^{[ 8 ]}およびPOLR2Lと相互作用することが示されている。^{[ 8 ]}

参考文献

1. GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000047315 – Ensembl、2017年5月
2. GRCm38: Ensemblリリース89: ENSMUSG00000029250 – Ensembl、2017年5月
3. 「ヒトPubMedリファレンス：」。米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
4. 「マウスPubMedリファレンス：」米国国立医学図書館、国立生物工学情報センター。
5. Acker J, Wintzerith M, Vigneron M, et al. (1992年10月). 「ヒトRNAポリメラーゼII（またはB）の2番目に大きいサブユニットの一次構造」. J Mol Biol . 226 (4): 1295–9 . doi : 10.1016/0022-2836(92)91071-V . PMID 1518060 . 
6. Acker J, Mattei MG, Wintzerith M, et al. (1994年8月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット遺伝子の染色体局在」. Genomics . 20 (3): 496–9 . doi : 10.1006/geno.1994.1208 . PMID 8034326 . 
7. 「Entrez遺伝子：POLR2Bポリメラーゼ（RNA）II（DNA指向性）ポリペプチドB、140kDa」。
8. Acker J, de Graaff M, Cheynel I, et al. (1997年7月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」 . J. Biol. Chem . 272 (27). 米国: 16815–21 . doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ISSN 0021-9258 . PMID 9201987 .  

さらに読む

• Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」. J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7 . doi : 10.1007/BF02253352 . PMID  9570510 .
• Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御：Tat補因子と転写伸長」 . Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode : 1998CBio....8.R447Y . doi : 10.1016/ S0960-9822 (98)70289-1 . PMID  9651670. S2CID  15480646 .
• Romano G, Kasten M, De Falco G, et al. (2000). 「HIV tatトランス活性化経路遺伝子発現におけるCdk9とサイクリンT1の調節機能」. J. Cell. Biochem . 75 (3): 357– 68. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2- K . PMID  10536359. S2CID  43685090 .
• Marcello A, Zoppé M, Giacca M (2002). 「HIV-1 Tatトランスアクチベーターによる多様な転写制御モード」 . IUBMB Life . 51 (3): 175–81 . doi : 10.1080/152165401753544241 . PMID  11547919. S2CID  10931640 .
• Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (2007). 「HIV-1転写の制御：化学療法介入のための分子標的」 . Med Res Rev. 26 ( 5): 595– 625. doi : 10.1002/med.20081 . PMC  7168390. PMID 16838299  .
• Harrich D, McMillan N, Munoz L, et al. (2007). 「多様なTat相互作用は新たな抗レトロウイルス薬の標的につながるか？」Current Drug Targets . 7 (12): 1595–606 . doi : 10.2174/138945006779025338 . PMID  17168834 .
• Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, et al. (1992). 「HIV-1 Tatは細胞伸長因子と共存し、in vitroでプロセッシング因子として作用する」 . Genes Dev . 6 (4): 655–66 . doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID  1559613 .
• Southgate C, Zapp ML, Green MR (1990). 「新生RNAに別のタンパク質を介して結合したHIV-1 Tatタンパク質による転写活性化」Nature . 345 (6276): 640–2 . Bibcode : 1990Natur.345..640S . doi : 10.1038/345640a0 . PMID  2190099 . S2CID  4233742 .
• Zheng XM, Black D, Chambon P, et al. (1990). 「一般転写因子BTF3の相補DNAの配列決定と発現」. Nature . 344 (6266): 556–9 . Bibcode : 1990Natur.344..556Z . doi : 10.1038/344556a0 . PMID  2320128. S2CID  4227320 .
• Wu-Baer F, Sigman D, Gaynor RB (1995). 「RNAポリメラーゼIIのヒト免疫不全ウイルストランス活性化領域RNAへの特異的結合は細胞内補因子とTatによって制御される」 . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153–7 . Bibcode : 1995PNAS...92.7153W . doi : 10.1073/ pnas.92.16.7153 . PMC  41297. PMID  7638159 .
• Herrmann CH, Rice AP (1995). 「レンチウイルスTatタンパク質は、RNAポリメラーゼIIのラージサブユニットのカルボキシル末端ドメインを過リン酸化させる細胞性タンパク質キナーゼTAKと特異的に結合する：Tat補因子の候補」. J. Virol . 69 (3): 1612–20 . doi : 10.1128/JVI.69.3.1612-1620.1995 . PMC  188757. PMID  7853496 .
• Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). 「改良されたショットガンライブラリー構築のための「ダブルアダプター」法」Anal. Biochem . 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID  8619474 .
• Keen NJ, Gait MJ, Karn J (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Tatは活性化転写伸長複合体の不可欠な構成要素である」. Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 (6): 2505–10 . Bibcode : 1996PNAS...93.2505K . doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . PMC  39827. PMID  8637904 .
• Yang X, Herrmann CH, Rice AP (1996). 「ヒト免疫不全ウイルスTatタンパク質は生体内でTAKと特異的に会合し、その機能にはRNAポリメラーゼIIのカルボキシル末端ドメインを必要とする」 . J. Virol . 70 (7): 4576– 84. doi : 10.1128/JVI.70.7.4576-4584.1996 . PMC  190394. PMID  8676484 .
• Agostini I, Navarro JM, Rey F, et al. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス1型Vprトランスアクチベーター：プロモーター結合アクチベータードメインとの協調およびTFIIBへの結合」J. Mol. Biol . 261 (5): 599– 606. doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . PMID  8800208 .
• Zhou Q, Sharp PA (1996). 「Tat-SF1：HIV-1 Tatによる転写伸長の刺激における補因子」. Science . 274 ( 5287): 605–10 . Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID  8849451. S2CID  13266489 .
• Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, et al. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルスTatタンパク質によるトランス活性化にはRNAポリメラーゼIIのC末端ドメインが必要である」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11575–9 . Bibcode : 1996PNAS...9311575O . doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . PMC  38099. PMID  8876177 .
• Chun RF, Jeang KT (1996). 「ヒトレトロウイルス（ヒトT細胞リンパ球向性ウイルスIおよびHIV-1）の活性化転写におけるRNAポリメラーゼIIカルボキシル末端ドメインの要件」 . J. Biol. Chem . 271 (44): 27888–94 . doi : 10.1074/jbc.271.44.27888 . PMID  8910388 .