CCR4-Not
ヒトCNOT1-CNOT2-CNOT3モジュールの構造（PDB 4C0D）。[ 1 ]

炭素カタボライト抑制4—ネガティブオンTATA -less、またはCCR4 - Notは、遺伝子発現において機能する多タンパク質複合体です。 [ 2 ] [ 3 ]この複合体は、ポリ(A) 3′-5′エキソヌクレアーゼおよびユビキチンリガーゼの両方として複数の酵素活性を持っています。[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] CCR4-Notのエキソヌクレアーゼ活性は、ほぼすべての真核生物のmRNAの3'末端にあるポリ(A)テールを短縮します。[ 8 ]この複合体は、転写を制御する核と、翻訳リボソームおよびRNAプロセシングボディに関連する細胞質の両方に存在します。[ 2 ] [ 3 ]哺乳類細胞において、Ccr4は細胞周期の調節、クロマチン修飾、転写開始の活性化と阻害、転写伸長の制御、RNA輸出、核RNA監視、核内DNA損傷修復に機能する。Ccr4-Not複合体は細胞質におけるmRNAの分解とタンパク質の品質管理に重要な役割を果たしている。[ 9 ]

サブユニット

ヒトCCR4-Not複合体は、構造的（非触媒的）サブユニットと、エキソヌクレアーゼ活性およびE3リガーゼ活性を有するサブユニットから構成される。ヒトサブユニットの一部は出芽酵母において保存されているが、全てではない。[ 10 ] 酵母において、この複合体は9つのコアサブユニットから構成され、Ccr4（炭素分解産物抑制）、Cafタンパク質（Ccr4関連因子）（Caf1、Caf40、Caf130）、およびNotタンパク質（Not1、Not2、Not3、Not4、Not5）から構成される。[ 11 ]

サブユニット分子量 (kDa) [A]主な特徴
CNOT1267非触媒機能を持つ「足場」。胚性幹細胞の維持に関連する。[ 12 ]
CNOT260構造成分。胚性幹細胞の維持に関連している。[ 12 ]
CNOT382構造成分。胚性幹細胞の維持に関連している。[ 13 ] [ 12 ]
CNOT464E3ユビキチンリガーゼとして活性がある。[ 7 ]
CNOT663ポリアデニル化されたmRNA基質を優先的に選択する3′-5′エキソヌクレアーゼ。[ 5 ]ヒトにはCNOT6Lという相同遺伝子がある。
CNOT733CNOT8と部分的に重複する3′-5′エキソヌクレアーゼ。 [ 4 ]
CNOT8343′-5′エキソヌクレアーゼ[ 4 ]
CNOT934非触媒機能を果たす。[ 14 ]
CNOT1082真菌には存在しないCNOT11とモジュールを形成する非触媒サブユニット。[ 15 ]
CNOT1155真菌には存在しないCNOT10とモジュールを形成する非触媒サブユニット。[ 15 ]

Uniprot からのヒトサブユニットの分子量 。

参照

参考文献

  1. ^ Boland, Andreas; Chen, Ying; Raisch, Tobias; Jonas, Stefanie; Kuzuoğlu-Öztürk, Duygu; Wohlbold, Lara; Weichenrieder, Oliver; Izaurralde, Elisa (2013-10-13). 「ヒトCCR4-NOT複合体のNOTモジュールの構造と組み立て」Nature Structural & Molecular Biology 20 ( 11). Springer Science and Business Media LLC: 1289– 1297. doi : 10.1038/nsmb.2681 . ISSN  1545-9993 . PMID  24121232 . S2CID  24288483 .
  2. ^ a b Collart, Martine A. (2016-01-29). 「Ccr4-Not複合体は真核生物の遺伝子発現の重要な制御因子である」. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA . 7 (4). Wiley: 438–454 . doi : 10.1002/wrna.1332 . ISSN 1757-7004 . PMC 5066686. PMID 26821858 .   
  3. ^ a bミラー, ジェイソン E.; リース, ジョセフ C. (2012-03-15). 「Ccr4-Not複合体：真核細胞のコントロールフリーク」 .生化学と分子生物学の批評的レビュー. 47 (4). Informa UK Limited: 315– 333. doi : 10.3109 / 10409238.2012.667214 . ISSN 1040-9238 . PMC 3376659. PMID 22416820 .   
  4. ^ a b c Aslam, Akhmed; Mittal, Saloni; Koch, Frederic; Andrau, Jean-Christophe; Winkler, G. Sebastiaan (2009). Wickens, Marvin (編). 「Ccr4–Not デアデニラーゼサブユニットCNOT7とCNOT8は重複する役割を持ち、細胞増殖を調節する」 . Molecular Biology of the Cell . 20 (17). American Society for Cell Biology (ASCB): 3840– 3850. doi : 10.1091 /mbc.e09-02-0146 . ISSN 1059-1524 . PMC 2735483. PMID 19605561 .   
  5. ^ a b Chen J, Chiang YC, Denis CL (2002年3月). 「3′-5′ポリ(A)RNAおよびssDNAエキソヌクレアーゼであるCCR4は、細胞質デアデニラーゼの触媒成分である」 . EMBO J. 21 ( 6): 1414–26 . doi : 10.1093/ emboj /21.6.1414 . PMC 125924. PMID 11889047 .  
  6. ^ 「Entrez Gene: CNOT6 CCR4-NOT転写複合体、サブユニット6」。
  7. ^ a bアルバート、トーマス K.;半沢博之;アイオワ州イヴォンヌ州レグテンバーグ。デ・ルーウェ、マージョリン・J.ファン・デン・フーベル、フィオナAJ。コラート、マルティーヌ A.ボーレンス、ロルフ。ティマーズ、H.Th.マーク (2002-02-01)。「CCR4-NOT転写抑制因子複合体内のユビキチン-タンパク質リガーゼサブユニットの同定」。EMBO ジャーナル。21 (3)。ワイリー: 355–364 .土井: 10.1093/emboj/21.3.355。ISSN 0261-4189。PMC 125831。PMID 11823428。   
  8. ^ Stowell, James AW; Webster, Michael W.; Kögel, Alexander; Wolf, Jana; Shelley, Kathryn L.; Passmore, Lori A. (2016-11-15). 「Ccr4-Not複合体とYTHドメインタンパク質Mmi1による標的脱アデニル化の再構成」 . Cell Reports . 17 (8): 1978– 1989. doi : 10.1016/j.celrep.2016.10.066 . ISSN 2211-1247 . PMC 5120349. PMID 27851962 .   
  9. ^ Chalabi Hagkarim, Nafiseh; Grand, Roger J. (2020-10-29). 「Ccr4–Not複合体の調節特性」 . Cells . 9 ( 11): 2379. doi : 10.3390/cells9112379 . ISSN 2073-4409 . PMC 7692201. PMID 33138308 .   
  10. ^ Albert, TK (2000-02-01). 「酵母CCR4-NOT複合体サブユニットのヒト相同遺伝子の単離と特性評価」 . Nucleic Acids Research . 28 (3). Oxford University Press (OUP): 809– 817. doi : 10.1093 /nar/28.3.809 . ISSN 1362-4962 . PMC 102560. PMID 10637334 .   
  11. ^ Collart, Martine A (2003-08-14). 「Ccr4-Not複合体による酵母における遺伝子発現の包括的制御」 . Gene . 313 : 1–16 . doi : 10.1016/S0378-1119(03)00672-3 . ISSN 0378-1119 . PMID 12957374 .  
  12. ^ a b c Zheng, Xiaofeng; Dumitru, Raluca; Lackford, Brad L.; Freudenberg, Johannes M.; Singh, Ajeet P.; Archer, Trevor K.; Jothi, Raja; Hu, Guang (2012-04-09). 「Cnot1、Cnot2、およびCnot3はマウスおよびヒトES細胞のアイデンティティを維持し、胚体外分化を阻害する」 . Stem Cells . 30 (5). Wiley: 910– 922. doi : 10.1002/stem.1070 . ISSN 1066-5099 . PMC 3787717. PMID 22367759 .   
  13. ^ Hu, G.; Kim, J.; Xu, Q.; Leng, Y.; Orkin, SH; Elledge, SJ (2009-04-01). 「ゲノムワイドRNAiスクリーニングにより自己複製に必要な新たな転写モジュールが同定された」 . Genes & Development . 23 (7). Cold Spring Harbor Laboratory: 837– 848. doi : 10.1101 / gad.1769609 . ISSN 0890-9369 . PMC 2666338. PMID 19339689 .   
  14. ^ Pavanello, Lorenzo; Hall, Benjamin; Airhihen, Blessing; Winkler, Gerlof Sebastiaan (2018-11-09). 「CNOT1およびCNOT9の中央領域はCcr4–Notヌクレアーゼモジュールによる脱アデニル化を促進する」 . Biochemical Journal . 475 (21). Portland Press Ltd.: 3437– 3450. doi : 10.1042/bcj20180456 . ISSN 0264-6021 . PMID 30309886. S2CID 52962278 .   
  15. ^ a b Mauxion, Fabienne; Prève, Brigitte; Séraphin, Bertrand (2013). 「C2ORF29/CNOT11とCNOT10はCCR4-NOT複合体の新たなモジュールを形成する」 . RNA Biology . 10 (2). Informa UK Limited: 267– 276. doi : 10.4161/rna.23065 . ISSN 1547-6286 . PMC 3594285. PMID 23232451 .   
「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=CCR4-Not&oldid=1301004479」から取得