16BO133
16BO133
ウイルスの分類この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: リボビリア
王国： オルタナウイルス科
門: ピスビリコタ
クラス： ピソニウイルス科
注文： ニドウイルス目
家族： コロナウイルス科
属: ベータコロナウイルス
亜属： サルベコウイルス
種：
ベータコロナウイルスパンデミック
歪み：
16BO133

16BO133は、韓国のキクガシラコウモリから発見されたSARS類似コロナウイルス（SL-COV）です。2019年に発表され、ゲノム配列が完全に解読されました。解読された韓国のSARSr-CoV株は、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス1型に属し、ゲノム配列の相同性は82.8%でした。

発見

16BO133ウイルスは2016年にオオキクガシラコウモリの口腔内から発見されました。このウイルス株のゲノムは29075ヌクレオチドです。SA​​RSr-CoVの中で、16BO133は2016年に発表され中国吉林省で発見されたJTMC15ウイルスに最も近いもので、ゲノム核酸配列の類似性は98.3％です。他のSARSr-CoVと比較して、これら2つのウイルスはORF7b末端のフレームシフト変異によりORF8系統を有しています。[ 1 ] [ 2 ] 16BO133ウイルスとSARS-CoVのゲノム核酸配列の類似性は82.8％です。[ 3 ]

韓国では過去にも他のSARSr-CoV株（B15-21ウイルスなど）が発見されているが、いずれも配列が解読されていない。[ 4 ] 16BO133ウイルスは、韓国で初めて完全に配列解読されたSARSr-CoV株である。[ 1 ]

系統発生

SARS-CoV-1および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は次のとおりです。

SARS-CoV-1関連コロナウイルス

BtCoV HKU3、SARS-CoV-1、Rhinolophus sinicusに対して 87.9% 、香港および広東[ 8 ]

LYRa11 、SARS-CoV-1、 Rhinolophus affinisに対して 90.9% 、宝山、雲南[ 9 ]

コウモリ SARS-CoV/Rp3、SARS-CoV-1 に対して 92.6%、Rhinolophus pearsoni、南寧、広西チワン族自治区[ 7 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_31C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum、陸豊、雲南[ 10 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_34C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum、陸豊、雲南[ 10 ]

SARS-CoV-2、SARS-CoV-1 に対して 79% [ 13 ]

参照

参考文献

  1. ^ a b Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK (2019). 「大韓民国で確認されたSARS様コウモリコロナウイルスの完全ゲノム解析」.ウイルス遺伝子. 55 (4): 545– 549. doi : 10.1007/s11262-019-01668-w . PMC  7089380. PMID 31076983  .
  2. ^ Xu L, Zhang F, Yang W, Jiang T, Lu G, He B, et al. (2016). 「中国のコウモリからの多様なアルファおよびベータコロナウイルスの検出と特徴づけ」Virol Sin . 31 ( 1): 69– 77. doi : 10.1007/s12250-016-3727-3 . PMC 7090707. PMID 26847648 .  
  3. ^ Na EJ, Lee SY, Kim HJ, Oem JK (2021). 「韓国産コウモリコロナウイルスとSARS-CoVおよび新たに出現したSARS-CoV-2との比較遺伝子解析」 . J Vet Sci . 22 (1): e12. doi : 10.4142 / jvs.2021.22.e12 . PMC 7850784. PMID 33522164 .  
  4. ^ Kim HK, Yoon SW, Kim DJ, Koo BS, Noh JY, Kim JH, 他 (2016). 「韓国産コウモリの糞便中における重症急性呼吸器症候群様、中東呼吸器症候群様コウモリコロナウイルスおよびH群ロタウイルスの検出」 . Transbound Emerg Dis . 63 (4): 365– 72. doi : 10.1111/tbed.12515 . PMC 7169817. PMID 27213718 .  
  5. ^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku (2019). 「大韓民国で同定されたSARS様コウモリコロナウイルスの完全ゲノム解析」 .ウイルス遺伝子. 55 (4): 545– 549. doi : 10.1007/s11262-019-01668-w . PMC 7089380. PMID 31076983 .  
  6. ^ Xu, L; Zhang, F; Yang, W; Jiang, T; Lu, G; He, B; Li, X; Hu, T; Chen, G; Feng, Y; Zhang, Y; Fan, Q; Feng, J; Zhang, H; Tu, C (2016年2月). 「中国のコウモリからの多様なアルファおよびベータコロナウイルスの検出と特徴づけ」 . Virologica Sinica . 31 (1): 69– 77. doi : 10.1007/s12250-016-3727-3 . PMC 7090707. PMID 26847648 .  
  7. ^ a b Li, W. (2005). 「コウモリはSARS様コロナウイルスの自然宿主である」 . Science . 310 (5748): 676– 679. Bibcode : 2005Sci...310..676L . doi : 10.1126/ science.11 ​​18391. ISSN 0036-8075 . PMID 16195424. S2CID 2971923 .   
  8. ^ a b Xing‐Yi Ge; Ben Hu; Zheng‐Li Shi (2015). 「コウモリのコロナウイルス」. Lin-Fa Wang; Christopher Cowled (編). 『コウモリとウイルス：新興感染症の新たなフロンティア』（初版）. John Wiley & Sons. pp.  127– 155. doi : 10.1002/9781118818824.ch5 .
  9. ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; et al. (2014). 「多様なアルファコロナウイルスの同定と、中国のコウモリから分離された新規重症急性呼吸器症候群様コロナウイルスのゲノム特性解析」 . J Virol . 88 (12): 7070–82 . doi : 10.1128/JVI.00631-14 . PMC 4054348. PMID 24719429 .  
  10. ^ a b Lau, Susanna KP; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes KH; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth SM; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. (2015). 「重症急性呼吸器症候群（SARS）コロナウイルスORF8タンパク質は、オオキクガシラコウモリ由来のSARS関連コロナウイルスから組換えによって獲得される」 . Journal of Virology . 89 (20): 10532– 10547. doi : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . PMC 4580176 . PMID 26269185 .   
  11. ^ a b Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. (2013). 「ACE2受容体を利用するコウモリ由来SARS様コロナウイルスの分離と特性解析」 . Nature . 503 (7477): 535–8 . Bibcode : 2013Natur.503..535G . doi : 10.1038/nature12711 . PMC 5389864. PMID 24172901 .  
  12. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; et al. (2016). 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスの直接の祖先に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスの分離と特性解析」 . Journal of Virology . 90 (6): 3253–6 . doi : 10.1128/JVI.02582-15 . PMC 4810638. PMID 26719272 .  
  13. ^ Ben, Hu; Hua, Guo; Peng, Zhou; Zheng-Li, Shi (2020). 「SARS-CoV-2とCOVID-19の特徴」 . Nature Reviews Microbiology . 19 (3​​): 141– 154. doi : 10.1038 / s41579-020-00459-7 . PMC 7537588. PMID 33024307 .  
  • ウィキスピーシーズにおける16BO133関連データ
「 https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=16BO133&oldid=1284840669」より取得