SHC014-CoV

SHC014-CoV
ウイルスの分類この分類を編集する
(ランク外): ウイルス
レルム: リボビリア
王国: オルタナウイルス科
門: ピスビリコタ
クラス: ピソニウイルス科
注文: ニドウイルス目
家族: コロナウイルス科
属: ベータコロナウイルス
亜属: サルベコウイルス
種:
歪み:
SHC014-CoV
同義語[ 1 ]
  • コウモリSARS様コロナウイルスRsSHC014

SHC014-CoVは、キクガシラコウモリ(キクガシラコウモリ科)に感染するSARSコロナウイルス(SL-COV)です。中国雲南省昆明市で発見されました。SL-CoV Rs3367と同時に発見されたSHC014-CoVは、ヒト細胞株に直接感染することが示された最初のコウモリSARS様コロナウイルスでした。ヒト細胞に感染したRs3367株は、コウモリSARS様コロナウイルスWIV1と命名されました。[ 2 ]

発見

2011年4月から2012年9月にかけて、武漢ウイルス研究所の研究者らは、昆明市(中国南西部雲南省)のチャイニーズキクガシラコウモリRhinolophus sinicus )のコロニー から、肛門スワブとコウモリの糞便サンプルを117個採取した。117個のサンプルのうち27個(23%)に7種類のSARSに似たコロナウイルスの分離株が含まれていた。その中には、RsSHC014とRs3367と呼ばれるこれまで知られていなかった2種類が含まれていた。[ 2 ]

ウイルス学

2013年、コウモリSARS様コロナウイルスRs3367がヒトHeLa細胞株に直接感染することが示されました。これは、実験室でコウモリSARS様コロナウイルスがヒト細胞に感染した初めての事例でした。ヒト細胞に感染したRs3367株は、「コウモリSARS様コロナウイルスWIV」と命名されました。[ 2 ]

2015年、ノースカロライナ大学チャペルヒル校と武漢ウイルス研究所は、逆遺伝学を用いてSHC014の表面タンパク質とSARSコロナウイルスの骨格からなるキメラウイルスを作成し、SHC014がヒトHeLa細胞株に感染できることを示す研究を行った。 [ 3 ] [ 4 ]

系統発生

SARS-CoV-1および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は次のとおりです。

SARS-CoV-1関連コロナウイルス

BtCoV HKU3、SARS-CoV-1、Rhinolophus sinicusに対して 87.9% 、香港および広東[ 8 ]

LYRa11 、SARS-CoV-1、 Rhinolophus affinisに対して 90.9% 宝山雲南[ 9 ]

コウモリ SARS-CoV/Rp3、SARS-CoV-1 に対して 92.6%、Rhinolophus pearsoni南寧広西チワン族自治区[ 7 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_31C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum陸豊雲南[ 10 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_34C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum陸豊雲南[ 10 ]

SARS-CoV-2、SARS-CoV-1 に対して 79% [ 13 ]

参照

参考文献

  1. ^ 「分類ブラウザ(コウモリSARS様コロナウイルスRsSHC014)」 www.ncbi.nlm.nih.gov . 2021年1月5日閲覧
  2. ^ a b c Ge XY, Li JL, Yang XL, Chmura AA, Zhu G, Epstein JH, et al. (2013年11月). 「ACE2受容体利用するコウモリ由来SARS様コロナウイルスの分離と特性解析」 . Nature . 503 (7477): 535–8 . Bibcode : 2013Natur.503..535G . doi : 10.1038/nature12711 . PMC 5389864. PMID 24172901 .  
  3. ^ Menachery VD, Yount BL, Debbink K, Agnihothram S, Gralinski LE, Plante JA, et al. (2015年12月). SARSに類似したコウモリコロナウイルスのクラスターはヒトへの感染可能性を示唆」 . Nature Medicine . 21 (12): 1508–13 . doi : 10.1038/nm.3985 . PMC 4797993. PMID 26552008 .  
  4. ^ Butler D (2015年11月12日). 「人工コウモリウイルス、危険な研究をめぐる議論を巻き起こす」Nature . doi : 10.1038/nature.2015.18787 . S2CID 182338924 . 
  5. ^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku (2019). 「大韓民国で同定されたSARS様コウモリコロナウイルスの完全ゲノム解析」 .ウイルス遺伝子. 55 (4): 545– 549. doi : 10.1007/s11262-019-01668-w . PMC 7089380. PMID 31076983 .  
  6. ^ Xu, L; Zhang, F; Yang, W; Jiang, T; Lu, G; He, B; Li, X; Hu, T; Chen, G; Feng, Y; Zhang, Y; Fan, Q; Feng, J; Zhang, H; Tu, C (2016年2月). 「中国のコウモリからの多様なアルファおよびベータコロナウイルスの検出と特徴づけ」 . Virologica Sinica . 31 (1): 69– 77. doi : 10.1007/s12250-016-3727-3 . PMC 7090707. PMID 26847648 .  
  7. ^ a b Li, W. (2005). 「コウモリはSARS様コロナウイルスの自然宿主である」 . Science . 310 (5748): 676– 679. Bibcode : 2005Sci...310..676L . doi : 10.1126/ science.11 ​​18391. ISSN 0036-8075 . PMID 16195424. S2CID 2971923 .   
  8. ^ a b Xing‐Yi Ge; Ben Hu; Zheng‐Li Shi (2015). 「コウモリのコロナウイルス」. Lin-Fa Wang; Christopher Cowled (編). 『コウモリとウイルス:新興感染症の新たなフロンティア』(初版). John Wiley & Sons. pp.  127– 155. doi : 10.1002/9781118818824.ch5 .
  9. ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; et al. (2014). 「多様なアルファコロナウイルスの同定と、中国のコウモリから分離された新規重症急性呼吸器症候群様コロナウイルスのゲノム特性解析」 . J Virol . 88 (12): 7070–82 . doi : 10.1128/JVI.00631-14 . PMC 4054348. PMID 24719429 .  
  10. ^ a b Lau, Susanna KP; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes KH; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth SM; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. (2015). 「重症急性呼吸器症候群(SARS)コロナウイルスORF8タンパク質は、オオキクガシラコウモリ由来のSARS関連コロナウイルスから組換えによって獲得される」 . Journal of Virology . 89 (20): 10532– 10547. doi : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . PMC 4580176 . PMID 26269185 .   
  11. ^ a b Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. (2013). 「ACE2受容体利用するコウモリ由来SARS様コロナウイルスの分離と特性解析」 . Nature . 503 (7477): 535–8 . Bibcode : 2013Natur.503..535G . doi : 10.1038/nature12711 . PMC 5389864. PMID 24172901 .  
  12. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; et al. (2016). 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスの直接の祖先に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスの分離と特性解析」 . Journal of Virology . 90 (6): 3253–6 . doi : 10.1128/JVI.02582-15 . PMC 4810638. PMID 26719272 .  
  13. ^ Ben, Hu; Hua, Guo; Peng, Zhou; Zheng-Li, Shi (2020). 「SARS-CoV-2とCOVID-19の特徴」 . Nature Reviews Microbiology . 19 (3​​): 141– 154. doi : 10.1038 / s41579-020-00459-7 . PMC 7537588. PMID 33024307 .  

参考文献