LYRa11
LYRa11
ウイルスの分類この分類を編集する
（ランク外）: ウイルス
レルム: リボビリア
王国： オルタナウイルス科
門: ピスビリコタ
クラス： ピソニウイルス科
注文： ニドウイルス目
家族： コロナウイルス科
属: ベータコロナウイルス
亜属： サルベコウイルス
種：
ベータコロナウイルスパンデミック
歪み：
LYRa11

LYRa11は、 2011年に中国雲南省宝山でアカキクガシラコウモリのサンプルから同定されたSARS類似コロナウイルス（SL-COV）です。このウイルス株のゲノムは29,805塩基長で、 SARSの発生を引き起こしたSARS-CoVの全ゲノム配列との相同性は91%です。2014年に発表されました。[ 1 ] SARS-CoVやSARS-CoV-2と同様に、LYRa11ウイルスはACE2を受容体として細胞に感染します。[ 2 ]

系統発生

SARS-CoV-1および関連コロナウイルスの全ゲノム配列に基づく系統樹は次のとおりです。

SARS-CoV-1関連コロナウイルス

BtCoV HKU3、SARS-CoV-1、Rhinolophus sinicusに対して 87.9% 、香港および広東[ 6 ]

LYRa11 、SARS-CoV-1、 Rhinolophus affinisに対して 90.9% 、宝山、雲南[ 7 ]

コウモリ SARS-CoV/Rp3、SARS-CoV-1 に対して 92.6%、Rhinolophus pearsoni、南寧、広西チワン族自治区[ 5 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_31C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum、陸豊、雲南[ 8 ]

コウモリ SL-CoV YNLF_34C、SARS-CoV-1 に対して 93.5%、Rhinolophus ferrumequinum、陸豊、雲南[ 8 ]

SARS-CoV-2、SARS-CoV-1 に対して 79% [ 11 ]

参照

参考文献

  1. ^ He B; Zhang Y; Xu L; Yang W; Yang F; Feng Y; et al. (2014). 「多様なアルファコロナウイルスの同定と、中国のコウモリから分離された新規重症急性呼吸器症候群様コロナウイルスのゲノム特性解析」 . J Virol . 88 (12): 7070–82 . doi : 10.1128/ JVI.00631-14 . PMC  4054348. PMID  24719429 .
  2. ^ HL、ウェルズ;レトコ、M;ラッソ、G;セビデ、B;ンジザ、J;ビャルガバ、DK;ナバレッテ＝マシアス、私。リャン、Ｅ；他。 （2021年）。「コロナウイルス亜属サルベコウイルス内でのACE2使用の進化の歴史」。ウイルスの進化。7 (1) veab007。土井：10.1093/ve/veab007。ISSN 2057-1577。PMC 7928622。PMID 33754082。   
  3. ^ Kim, Yongkwan; Son, Kidong; Kim, Young-Sik; Lee, Sook-Young; Jheong, Weonhwa; Oem, Jae-Ku (2019). 「大韓民国で同定されたSARS様コウモリコロナウイルスの完全ゲノム解析」 .ウイルス遺伝子. 55 (4): 545– 549. doi : 10.1007/s11262-019-01668-w . PMC 7089380. PMID 31076983 .  
  4. ^ Xu, L; Zhang, F; Yang, W; Jiang, T; Lu, G; He, B; Li, X; Hu, T; Chen, G; Feng, Y; Zhang, Y; Fan, Q; Feng, J; Zhang, H; Tu, C (2016年2月). 「中国のコウモリからの多様なアルファおよびベータコロナウイルスの検出と特徴づけ」 . Virologica Sinica . 31 (1): 69– 77. doi : 10.1007/s12250-016-3727-3 . PMC 7090707. PMID 26847648 .  
  5. ^ a b Li, W. (2005). 「コウモリはSARS様コロナウイルスの自然宿主である」 . Science . 310 (5748): 676– 679. Bibcode : 2005Sci...310..676L . doi : 10.1126/ science.11 ​​18391. ISSN 0036-8075 . PMID 16195424. S2CID 2971923 .   
  6. ^ a b Xing‐Yi Ge; Ben Hu; Zheng‐Li Shi (2015). 「コウモリのコロナウイルス」. Lin-Fa Wang; Christopher Cowled (編). 『コウモリとウイルス：新興感染症の新たなフロンティア』（初版）. John Wiley & Sons. pp.  127– 155. doi : 10.1002/9781118818824.ch5 .
  7. ^ He, Biao; Zhang, Yuzhen; Xu, Lin; Yang, Weihong; Yang, Fanli; Feng, Yun; et al. (2014). 「多様なアルファコロナウイルスの同定と、中国のコウモリから分離された新規重症急性呼吸器症候群様コロナウイルスのゲノム特性解析」 . J Virol . 88 (12): 7070–82 . doi : 10.1128/JVI.00631-14 . PMC 4054348. PMID 24719429 .  
  8. ^ a b Lau, Susanna KP; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes KH; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth SM; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. (2015). 「重症急性呼吸器症候群（SARS）コロナウイルスORF8タンパク質は、オオキクガシラコウモリ由来のSARS関連コロナウイルスから組換えによって獲得される」 . Journal of Virology . 89 (20): 10532– 10547. doi : 10.1128/JVI.01048-15 . ISSN 0022-538X . PMC 4580176 . PMID 26269185 .   
  9. ^ a b Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; et al. (2013). 「ACE2受容体を利用するコウモリ由来SARS様コロナウイルスの分離と特性解析」 . Nature . 503 (7477): 535–8 . Bibcode : 2013Natur.503..535G . doi : 10.1038/nature12711 . PMC 5389864. PMID 24172901 .  
  10. ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; et al. (2016). 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスの直接の祖先に密接に関連する新規コウモリコロナウイルスの分離と特性解析」 . Journal of Virology . 90 (6): 3253–6 . doi : 10.1128/JVI.02582-15 . PMC 4810638. PMID 26719272 .  
  11. ^ Ben, Hu; Hua, Guo; Peng, Zhou; Zheng-Li, Shi (2020). 「SARS-CoV-2とCOVID-19の特徴」 . Nature Reviews Microbiology . 19 (3​​): 141– 154. doi : 10.1038 / s41579-020-00459-7 . PMC 7537588. PMID 33024307 .  
  • WikispeciesのLYRa11関連データ
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