左:結合していないアプタマー。右:標的タンパク質に結合したアプタマー。タンパク質は黄色で示されている。標的タンパク質に結合した際に形状が変化するアプタマーの部分は青色で、変化しない部分はオレンジ色で示されている。タンパク質に接触するアプタマーの部分は赤色で強調表示されている。 乳がん 細胞を、がん細胞上のバイオマーカー に選択的に結合し、健常細胞には結合しないアプタマーと共存させます。アプタマーは、紫外線 下で赤く光る分子であるAlexa Fluor 594に結合しています。この検査により、医師や研究者は 患者の組織サンプル 中のがん細胞を特定することができます。アプタマーは、 特定の標的分子 または標的分子ファミリーに結合する人工のssDNA、RNA、XNA、またはペプチドのオリゴマーです。アプタマーはさまざまな親和性(K D はpMからμMの範囲)を示し、[ 1 ] [ 2 ] さまざまな レベル のオフ ターゲット 結合を 伴い 、 [ 3 ] 化学抗体 として分類 さ れる こと もあります。アプタマーと抗体は多くの同じ用途に使用できますが、主にオリゴヌクレオチド であるアプタマーの核酸ベースの構造は、 タンパク質 である抗体のアミノ酸 ベースの構造とは大きく異なります。この違いにより、いくつかの目的ではアプタマーが抗体よりも適した選択肢となる場合があります(抗体の置換を 参照)。
アプタマーは生物学研究や医療検査に用いられています。複数のアプタマーを単一の アッセイ に組み合わせることで、サンプル中の多数の異なるタンパク質を測定することができます。 疾患の分子マーカーの特定 に使用できるほか、薬剤 、薬物送達システム 、制御放出システムとして機能することができます。また、その他の 分子工学的 課題 にも利用されています。
アプタマーのほとんどは、 SELEX法 に由来します。SELEX法は、膨大な種類のDNA配列からなるプールから有用なアプタマーを見つけるための試験管実験です。このプロセスは、 自然選択 、指向性進化、あるいは人為選択によく似ています。SELEX法では、研究者は約 1000兆 もの異なるランダムに生成されたDNAまたはRNA断片 からなる初期DNAライブラリから、最適なアプタマーを繰り返し選択します。SELEX法の後、研究者はアプタマーの化学的性質を 変異させ たり変更したりして再度選択を行うか、合理的な設計 プロセスを用いて改良を行う場合があります。SELEX法以外の アプタマー発見方法も存在します。
研究者は、さまざまな有益な機能を実現するためにアプタマーを最適化しています。最も重要な機能は、選択したターゲットへの特異的かつ高感度な結合です。 血清検査やアプタマー治療薬のように、アプタマーが体液にさらされる場合 、DNAやRNAを破壊する酵素 による消化 に耐えることが重要になることがよくあります。治療用アプタマーは、体内からゆっくりと排出される ように変更する必要があることがよくあります。ターゲットに結合すると形状が劇的に変化する アプタマーは、センサーのオン/オフを切り替える分子スイッチとして有用です。一部のアプタマーは、 バイオセンサー に収まるように、または生物学的サンプルの検査 に使用できるように設計されています。アプタマーが事前に定義されたレベル または結合速度を達成することが有用な場合もあります。既知のアプタマーを生成するために使用される 合成 の収率は、配列が長くなると急速に低下するため、[ 4 ] 研究者は、製造コストを削減するために、アプタマーを最小限の結合配列に切り詰めることがよくあります。
語源 「アプタマー」という言葉は、アンドリュー・D・エリントン とジャック・ショスタック がこのテーマに関する最初の論文で用いた造語です。彼らは正確な定義を示しておらず、「 ラテン語の aptus (適合する)にちなんで、これらの個々のRNA配列を『アプタマー』と名付けました」と述べています。 [ 5 ]
しかし、この言葉自体は、ギリシャ 語のἅπτω (接続する、適合する、ホメロス(紀元前8世紀頃)[ 6 ] [ 7 ] )とμέρος( より大きなものの一部)に由来しています。[ 8 ]
分類 典型的なアプタマーは、DNA、RNA、XNA、またはペプチドの組み合わせの多様性 を利用して、特定の標的分子または標的分子ファミリーに対する強力かつ特異的な結合を実現する合成リガンドです。アプタマーは 、「化学抗体」または「抗体模倣体」 に分類されることもあります。[ 9 ] しかし、ほとんどのアプタマーは分子量が6~30 kDaと小さく、抗体の150 kDaの大きさとは対照的です。また、典型的な抗体が2つの抗原結合領域を持つのに対し、アプタマーは1つの結合部位しか持ちません。
歴史 ノーベル賞受賞者であり、SELEX とアプタマーの発明者の 1 人であるジャック・ショスタック。 1967年に初めて応用されて以来、[ 10 ] 指向性進化法は、新たな特性や機能を持つ生体分子の 開発に用いられてきました。初期の例としては、バクテリオファージQbetaの 複製システムの改変や、切断 活性を改変したリボザイム の創製などが挙げられます。[ 11 ]
1990年に、2つのチームが独立してSELEX( Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment )法を開発、発表し、RNAアプタマーを生成しました。ラリー・ゴールドの研究室では、 T4 DNAポリメラーゼに対するRNA リガンドを選択するプロセスにSELEXという用語を使用しました [ 12 ] 。ジャック・ショスタック の研究室では、さまざまな有機染料 に対するRNAリガンドを選択しました[ 5 ] [ 13 ]。 2 年後、ショスタックの研究室とギリアド・サイエンシズは 、互いに独立して、in vitro選択スキームを使用して、それぞれ有機染料 [ 14 ] とヒトトロンビン [ 15 ] のDNAアプタマーを生成しました。2001年に、SELEXはエリントン研究室のJ・コリン・コックスによって自動化され、数週間に及ぶ選択実験の期間がわずか3日に短縮されました[ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]
2002年、ロナルド・ブレーカー とエフゲニー・ヌドラー が率いる2つの研究グループは、核酸をベースとした遺伝子調節因子である リボスイッチ の存在を初めて決定的に証明する証拠を発表しました。リボスイッチは、これまでその存在が疑われていました。リボスイッチは、アプタマーと同様の分子認識特性を有しています。この発見は、地球上の生命の起源 における段階として想定されていたRNAワールド仮説 を裏付けるものとなりました。[ 19 ]
プロパティ
構造 アプタマーの複雑で多様な二次構造と三次構造は、このアプタマーの二次構造の模式図で示されており、これにより、アプタマーは標的に強力かつ特異的に結合することができる。GC塩基とAT塩基を繋ぐ黒い線で相補的塩基対 が見える。これは核酸の特徴であり、抗体のアミノ酸には存在しない。アプタマーがこれらの独特な構造を形成する際に役立つ。この塩基対に依存するヘアピン領域(赤)は、異なる温度におけるアプタマーの安定性を高める。この図では、アプタマー塩基に対する化学修飾の例も示している。耐久性を高める2つの人工塩基は黄色で示されている。ビオチン分子は ストレプトアビジン に極めて強力に結合するため、アプタマーを他の分子やセンサーおよびアッセイの表面にアンカーすることができる。 アプタマーのほとんどは、20〜100塩基 および3〜20 kDa の特定のオリゴマー配列に基づいています。機能強化のため、またはより大きな人工分子システムとの適合性のために化学修飾されているものもあります。 DNA、RNA、XNA 、およびペプチド アプタマーの化学的性質はそれぞれ、保存安定性、血清 または生体内で の耐久性、特異性および感度、コスト、生成、増幅、および特性評価の容易さ、およびユーザーへの親しみやすさの点で、異なるプロファイルを提供できます。通常、DNAベースおよびRNAベースのアプタマーは免疫原性が 低く、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR) で増幅可能で、複雑な二次構造 および三次構造 を持っています。[ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] DNAベースおよびXNAベースのアプタマーは優れた保存安定性を示します。 XNAベースのアプタマーは、結合親和性を高めたり、血清または 生体内 での耐久性を高めたりするために、追加の化学的多様性を導入できます。
遺伝的にコード化されたアミノ酸が 22種類、天然に存在するアミノ酸が500種類以上存在するため、ペプチドアプタマー や抗体は、DNAやRNAの4つの核酸に比べて、単位長さあたりの潜在的な組み合わせの多様性がはるかに大きい。[ 24 ] 核酸塩基またはバックボーンの化学修飾は、標準的な核酸塩基の化学的多様性を増加させる。[ 25 ]
スプリットアプタマーは、分子切れ によって2つに分断された、より大きな親アプタマーの断片である2本以上のDNA鎖で構成されています。[ 26 ] 各構成鎖の標的への結合能力は、切れ目の位置と娘鎖の二次構造に依存します。[ 27 ] 標的分子の存在は、DNA断片の結合を促進します。これはバイオセンサーの基礎として利用できます。[ 28 ] 組み立てられた2本の別々のDNA鎖は、1本の鎖に 連結することができます。
未修飾アプタマーは血流 から速やかに消失し、半減期 は数秒から数時間である。これは主に、アプタマーを物理的に破壊するヌクレアーゼ 分解と、アプタマーの低分子量および低分子化による 腎臓 からのクリアランスによるものである。2'-フッ素置換ピリミジン やポリエチレングリコール (PEG)結合などのいくつかの修飾により、血清中半減期は数日から数週間に及ぶ。PEG化により、 生体内で の腎臓によるクリアランスを防ぐのに十分な質量とサイズを付加することができる。未修飾アプタマーは凝固 障害の治療に使用できる。クリアランスとヌクレアーゼによる消化の問題は、ヌクレアーゼ濃度が低くクリアランス速度も遅い眼に適用した場合には軽減される。 [ 29 ] 血清からの迅速なクリアランスは、生体内 診断画像 などの一部の用途にも有用である。[ 30 ]
エボラ感染に関連するタンパク質と結合するように設計されたアプタマー[ 31 ] に関する研究では、標的タンパク質であるEBOV sGPへの結合能力について、単離された3つのアプタマーの比較が行われました。これらのアプタマーは配列も構造も異なりますが、EBOVとSUDVのsGP、そしてEBOV GP1.2に対して驚くほど類似した相対的親和性を示しています。特に、これらのアプタマーはGP遺伝子産物に対して高い特異性を示しました。特に、1つのアプタマーは電気化学センサーの認識要素として効果的であることが証明され、溶液中のsGPとGP1.2、そして膜コンテキスト内のGP1.2の検出を可能にしました。この研究の結果は、タンパク質表面の特定の領域がアプタトロピック特性を持つという興味深い可能性を示唆しています。このような部位の主要な特徴を特定し、アプタマーの3D構造予測を向上させることで、タンパク質上のアプタマー相互作用部位の予測精度を向上させる可能性が秘められています。これは、タンパク質に高い親和性で結合する可能性が高いアプタマーを特定するのに役立つだけでなく、アプタマー結合に大きな影響を与える可能性のあるタンパク質変異の解明にも役立つ可能性があります。アプタマーとタンパク質間の構造に基づく相互作用に関する包括的な理解は、アプタマーとタンパク質の結合の計算予測可能性を向上させるために不可欠です。さらに、最終的には実験的なSELEXプロトコルの必要性を排除する可能性も秘めています。
ターゲット アプタマーの標的には、小分子や重金属 イオン、タンパク質などのより大きなリガンド、さらには細胞全体が含まれる。[ 32 ] [ 33 ] これらの標的には、リゾチーム 、[ 34 ] トロンビン 、[ 35 ] [ 36 ] ヒト免疫不全ウイルストランスアクティングエレメント (HIV TAR)、[ 37 ] ヘミン 、[ 38 ] インターフェロンγ 、[ 39 ] 血管内皮増殖因子 (VEGF)、[ 40 ] [ 41 ] 前立腺特異抗原 (PSA)、[ 42 ] [ 43 ] ドーパミン 、[ 44 ] および非古典的な癌遺伝子である 熱ショック因子1 (HSF1)が含まれる。 [ 45 ]
アプタマーは、癌細胞、 [ 46 ] プリオン 、[ 47 ] 細菌、[ 48 ] ウイルスに対して生成されています。アプタマーの標的ウイルスには、インフルエンザA型 およびB型 ウイルス、[ 49 ] 呼吸器合胞体ウイルス (RSV)、[ 49 ] SARSコロナウイルス (SARS-CoV)[ 49 ] およびSARS-CoV-2 [ 50 ] が含まれます。
アプタマーは、環境科学の プロテオミクスに特に有用である可能性がある。[ 51 ] 抗体は、他のタンパク質と同様に、核酸よりも配列決定が難しい。また、細胞培養 によって生成されたり、動物の血清から採取されたりするため、維持と製造にコストがかかり、常に汚染のリスクがある。このため、あまり研究されていないタンパク質や種に関心のある研究者は、企業が関心のある標的に対する抗体を製造、維持、または適切に品質検証しないことに気付くかもしれない。[ 52 ] 対照的に、アプタマーは配列が簡単で、正確な構造をデジタル形式で保存し、必要に応じて合成できるため、維持にコストがかからない。このため、資金不足の生物学研究対象の研究ツールとして、より経済的に実現可能となる可能性がある。アプタマーは、テオフィリン( お茶 に含まれる)[ 53 ] やアブシジン酸 (植物免疫ホルモン)などの植物化合物用に存在する。 [ 54 ] キノコ を標的としたアプタマーの例として、α-アマニチン(致死性の テングタケ 中毒を引き起こす毒素)に対するアプタマーが開発されている。[ 55 ]
アプタマーの用途は、大まかにセンシング、治療、試薬製造、エンジニアリングのカテゴリーに分類できます。センシング用途は、環境、生物医学、疫学 、バイオセキュリティ 、基礎研究の用途で重要であり、アプタマーはアッセイ、イメージング法、診断アッセイ、バイオセンサーのプローブとして機能します。[ 32 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58] [59 ] [ 60 ] 治療 用途や 精密医療 では、アプタマーは薬剤として、[ 61 ] 標的薬物送達 媒体として、[ 62 ] 制御放出メカニズムとして、および小分子[ 63 ] およびタンパク質のハイスループットスクリーニング による薬剤発見用 試薬として機能することができます。[ 64 ] [ 65 ] アプタマーは、タンパク質生産のモニタリング、品質管理、精製に応用されています。[ 66 ] [ 67 ] [ 68 ] これらは、DNAポリメラーゼを強化してPCRの信頼性を高めるなど、タンパク質を改変する方法として分子工学の用途で機能することができる。[ 69 ] [ 70 ] [ 71 ] [ 72 ]
アプタマーの親和性はダイナミックレンジと検出限界にも影響するため、高濃度の標的分子を分析する場合には親和性の低いアプタマーが望ましい場合がある。[ 73 ] アフィニティークロマトグラフィーは、アプタマーなどの親和性試薬が標的に結合して放出する能力にも依存し、親和性が低いと標的分子の放出が促進される可能性がある。[ 74 ] したがって、特定のアプリケーションによってアプタマー親和性の有効範囲が決まる。
抗体補充 アプタマーは、多くのバイオテクノロジー 用途で抗体の代わりに使用できます。[ 75 ] [ 52 ] 実験室研究および臨床診断では、酵素結合免疫吸着測定法 (ELISA) 、[ 76 ] ウエスタンブロット 、[ 77 ] 免疫組織化学 (IHC) 、[ 78 ] フローサイトメトリー などのアプタマーベースの免疫測定法で使用できます。 [ 79 ] 治療 薬 としては 、 リガンド の アゴニストまたは アンタゴニスト として 機能 すること ができ ます 。 [ 80 ]抗体 はよく 知ら れ た技術で市場も確立されていますが、アプタマーはほとんどの研究者にとって比較的新しい技術であり、アプタマーは重要な研究ターゲットのほんの一部に対してのみ生成されています。[ 81 ] 抗体とは異なり、未修飾アプタマーは血清中のヌクレアーゼ分解や生体内での 腎クリアランスの影響を受けやすくなります。アプタマーは抗体に比べてサイズと質量がはるかに小さいため、特定の用途に最適なアプタマーを選択する上で重要な要素となる可能性があります。アプタマーが特定の用途に利用可能である場合、抗体に比べてアプタマーの利点としては、免疫原性が低い可能性、複製性が高いこと、コストが低いこと、 in vitro 選択条件による制御レベルが高いこと、そして耐久性、特異性、感度を効率的に設計できることなどが挙げられます。[ 82 ]
さらに、アプタマーは研究動物の使用削減 にも貢献します。[ 83 ] 抗体は初期の発見やポリクローナル抗体 の生産において動物に依存することがよくありますが、アプタマーの選択と生産は通常、動物に依存しません。しかし、ファージディスプレイ法では、 in vitroで 抗体を選択し、その後モノクローナル 細胞株から生産することで、動物の使用を完全に回避できます。[ 84 ]
治療薬の制御放出 アプタマーはタンパク質などの分子に可逆的に結合する能力を持つことから、成長因子 などの治療用生体分子の制御放出 を促進するためのアプタマーの利用への関心が高まっています。これは、結合強度を調整して成長因子を受動的に放出する[ 85 ] だけでなく、アプタマーと相補的なオリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーション [ 86 ] や細胞牽引力によるアプタマーのアンフォールディング [ 87 ] などのメカニズムによる能動的な放出によっても実現できます。
組織工学アプリケーション 特定の分子と可逆的に結合する能力で知られるアプタマーは、3Dバイオプリンティング 組織において、血管新生 を促進する成長因子を正確に送達するために使用されています。[ 88 ] [ 89 ] この制御された送達により、成長因子を 適切な場所と時間に放出することができ、局所的かつ複雑な血管ネットワークの形成が促進されます。さらに、成長因子の放出を時間経過とともに調整することで、これらのネットワークの特性を微調整できるため、このアプローチは血管新生した人工組織を作成するための強力なツールとなります。
アプタビッド AptaBiD(アプタマー促進バイオマーカー発見)は、アプタマーをベースにしたバイオマーカー 発見法である。[ 90 ]
ペプチドアプタマー ほとんどのアプタマーはDNA、RNA、またはXNAに基づいていますが、ペプチドアプタマー[ 91 ] は特定の標的分子に結合するように選択または設計された人工タンパク質です。
構造 ペプチドアプタマーは、タンパク質骨格上に提示される可変配列の1つ以上のペプチドループから構成される。ペプチド アプタマーの「頭部」が、固有の配列を持つ二本鎖DNAの「尾部」に共有結合した、オタマジャクシと呼ばれる誘導体は、DNA尾部のPCR(例えば、定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応 )によって、混合物中の希少標的分子を定量することができる。[ 92 ] アプタマー可変領域を形成するペプチドは、骨格と同じポリペプチド鎖の一部として合成され、骨格への結合によってN末端 とC末端 が制約される。この二重の構造的制約により、可変領域がとり得る3D構造の多様性は低下し[ 93 ] 、この構造多様性の低下により、標的との相互作用によって可変領域が均一な構造をとる際に、 分子結合 のエントロピーコストが低下する。
選択 最も一般的なペプチドアプタマー選択システムは酵母 ツーハイブリッドシステムです。ペプチドアプタマーは、 ファージディスプレイや mRNAディスプレイ 、リボソームディスプレイ、バクテリアディスプレイ 、酵母 ディスプレイ などの表面ディスプレイ技術によって構築されたコンビナトリアルペプチドライブラリ からも選択できます。これらの実験手順はバイオパニング とも呼ばれます。コンビナトリアルペプチドライブラリからパニングされたすべてのペプチドは、MimoDB データベースに保存されています。[ 94 ] [ 95 ]
アプリケーション ペプチドアプタマーのライブラリは、「変異原」として用いられてきました。研究者は、異なるペプチドアプタマーを発現するライブラリを細胞集団に導入し、所望の表現型 を選択し、その表現型を引き起こすアプタマーを同定します。研究者は次に、これらのアプタマーをベイトとして用い、例えば酵母ツーハイブリッドスクリーニングにおいて、これらのアプタマーが標的とする細胞タンパク質を同定します。このような実験により、アプタマーが結合する特定のタンパク質と、アプタマーが阻害して表現型を引き起こすタンパク質相互作用が特定されます。[ 96 ] [ 97 ] さらに、適切な機能部位で誘導体化されたペプチドアプタマーは、標的タンパク質に特異的な 翻訳後修飾を 引き起こしたり、標的タンパク質の細胞内局在を変化させたりすることができます。[ 98 ]
このアッセイでは、2種類の異なるアプタマー(VとI)がそれぞれのタンパク質標的(VEGFとIFN-γ)を検出する能力を試験します。Apt1、Apt2、Apt3、Apt4というラベルは、結合強度の降順で並んでいます(つまり、Apt1が最も強いアプタマーです)。DD、AD、DA、AAという文字は、それぞれ異なる人工塩基対の組み合わせを持つことを意味します。これが結合強度の違いを生み出します。「-」の列にはタンパク質が含まれず、「+」の列にはタンパク質が含まれます。タンパク質を含むアプタマー(+)とタンパク質を含まないアプタマー(-)をゲルのウェルにロードし、列のレーンに沿って移動させます。標的が存在する場合、アプタマーの電荷 とタンパク質の質量により、アプタマーは結合してよりゆっくりと移動します。標的が存在しない場合、結合していないアプタマーはレーンの端まで素早く移動します。「+」バンドと「-」バンドの位置の差が「移動度シフト」です。これにより、研究者はタンパク質の有無を検出できます。左端のVレーンとIレーンの濃いバンドは、アプタマーと標的タンパク質の結合が強いほど、サンプル中の標的タンパク質の一定量で標的タンパク質を検出しやすくなることを示しています。下の画像では、ゲル中の変性 尿素 が、より弱いIアプタマーにおけるアプタマーと標的タンパク質の結合を阻害していることが示されています。これは、アプタマーとタンパク質の結合が移動度シフトを引き起こしたことを示しています。
産業界と研究コミュニティ アプタマーをベースにした商用製品や企業には、医薬品マクゲン(ペガプタニブ) [ 99 ] や臨床診断会社ソマロジック [ 100 ] などがある。アプタマー研究コミュニティの専門団体である国際アプタマー協会(INSOAP)は、このテーマに特化したジャーナル 「アプタマー」 を発行している。Apta-index [ 101 ] は、 700種類以上のアプタマーをカタログ化し、注文プロセスを簡素化する最新のデータベースである。
参照
参考文献 ^ Rhodes, Andrew; Smithers, Nick; Chapman, Trevor; Parsons, Sarah; Rees, Stephen (2001-10-05). 「MCP-1に対する拮抗RNAアプタマーの生成と特性評価」 . FEBS Letters . 506 (2): 85– 90. Bibcode : 2001FEBSL.506...85R . doi : 10.1016/S0014-5793(01)02895-2 . ISSN 0014-5793 . PMID 11591377. S2CID 36797240 . ^ Stoltenburg, Regina; Nikolaus, Nadia; Strehlitz, Beate (2012-12-30). 「Capture-SELEX:アミノグリコシド系抗生物質に対するDNAアプタマーの選択」 . Journal of Analytical Methods in Chemistry . 2012 e415697. doi : 10.1155/2012/415697 . ISSN 2090-8865 . PMC 3544269. PMID 23326761 . ^ Crivianu-Gaita V, Thompson M (2016年11月). 「アプタマー、抗体scFv、抗体Fabフラグメント:最も汎用性の高いバイオセンサー生体認識要素3種の概要と比較」 Biosensors & Bioelectronics . 85 : 32– 45. doi : 10.1016/j.bios.2016.04.091 . PMID 27155114 . ^ 「DNAオリゴヌクレオチド合成」 ミリポアシグマ. 2022年 7月4日 閲覧 。 ^ a b Ellington AD, Szostak JW (1990年8月). 「特異的リガンドに結合するRNA分子のin vitro選択」. Nature . 346 ( 6287): 818– 822. Bibcode : 1990Natur.346..818E . doi : 10.1038/346818a0 . PMID 1697402. S2CID 4273647 . ^ "ἅπτω" 、 Βικιλεξικό (ギリシャ語)、 2023-03-12、2024-03-21 取得 ^ "Οδύσσεια/φ - Βικιθήκη" . el.wikisource.org (ギリシャ語) 。 2024 年 3 月 21 日 に取得 。 ^ "μέρος" 、 ウィクショナリー、無料辞書 、 2023-05-31、2024-03-21 取得 ^ Zhou G, Wilson G, Hebbard L, Duan W, Liddle C, George J, Qiao L (2016年3月). 「 アプタマー :がん治療における有望な化学抗体」 . Oncotarget . 7 (12): 13446– 13463. doi : 10.18632/oncotarget.7178 . PMC 4924653. PMID 26863567. S2CID 16618423 . ^ Mills DR, Peterson RL, Spiegelman S (1967年7月). 「自己複製核酸分子を用いた細胞外ダーウィン実験」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 58 (1): 217– 224. Bibcode : 1967PNAS...58..217M . doi : 10.1073 / pnas.58.1.217 . PMC 335620. PMID 5231602 . ^ Joyce GF (1989年10月). 「触媒RNAの増幅、変異、および選択」. Gene . 82 (1): 83– 87. doi : 10.1016/0378-1119(89)90033-4 . PMID 2684778 . ^ Tuerk C, Gold L (1990年8月). 「指数関数的エンリッチメントによるリガンドの系統的進化:バクテリオファージT4 DNAポリメラーゼに対するRNAリガンド」. Science . 249 (4968): 505– 510. Bibcode : 1990Sci...249..505T . doi : 10.1126/science.2200121 . PMID 2200121 . ^ Stoltenburg R, Reinemann C, Strehlitz B (2007年10月). 「SELEX ― 高親和性核酸リガンドを生成する革新的な手法」. Biomolecular Engineering . 24 (4): 381– 403. doi : 10.1016/j.bioeng.2007.06.001 . PMID 17627883 . ^ Ellington AD, Szostak JW (1992年2月). 「特異的なリガンド結合構造に折り畳まれる一本鎖DNA分子のin vitro選択」. Nature . 355 ( 6363): 850– 852. Bibcode : 1992Natur.355..850E . doi : 10.1038/355850a0 . PMID 1538766. S2CID 4332485 . ^ Bock LC, Griffin LC, Latham JA, Vermaas EH, Toole JJ (1992年2月). 「ヒトトロンビンに結合し阻害する一本鎖DNA分子の選択」. Nature . 355 ( 6360): 564– 566. Bibcode : 1992Natur.355..564B . doi : 10.1038/355564a0 . PMID 1741036. S2CID 4349607 . ^ Cox JC, Ellington AD (2001年10月). 「抗タンパク質アプタマーの自動選択」. Bioorganic & Medicinal Chemistry . 9 (10): 2525– 2531. doi : 10.1016/s0968-0896(01)00028-1 . PMID 11557339 . ^ Cox JC, Rajendran M, Riedel T, Davidson EA, Sooter LJ, Bayer TS, et al. (2002年6月). 「アプタマー配列の自動取得」. コンビナトリアルケミストリー&ハイスループットスクリーニング . 5 (4): 289– 299. doi : 10.2174/1386207023330291 . PMID 12052180 . ^ Cox JC, Hayhurst A, Hesselberth J, Bayer TS, Georgiou G, Ellington AD (2002年10月). 「in vitroで翻訳されたタンパク質標的に対するアプタマーの自動選択:遺伝子からアプタマーへ」 . Nucleic Acids Research . 30 (20): 108e–108. doi : 10.1093/nar/gnf107 . PMC 137152. PMID 12384610 . ^ Breaker RR (2012年2月). 「 リボスイッチとRNAワールド」 . Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 4 (2) a003566. doi : 10.1101/cshperspect.a003566 . PMC 3281570. PMID 21106649 . ^ スヴィゲリ R、ドッシ N、トニオーロ R、ミランダ=カストロ R、デ=ロス=サントス=アルバレス N、ロボ=カスタニョン MJ (2018 年 9 月)。 「深共晶溶媒における抗グルテン DNA アプタマーの選択」。 アンゲヴァンテ・ケミー 。 57 (39): 12850–12854 。 ビブコード : 2018AngCh.13013032S 。 土井 : 10.1002/ange.201804860 。 hdl : 10651/49996 。 PMID 30070419 。 S2CID 240281828 。 ^ Neves MA, Reinstein O, Saad M, Johnson PE (2010年12月). 「熱力学および変異研究によるコカイン結合アプタマーの二次構造要件の定義」. 生物理化学 . 153 (1): 9– 16. doi : 10.1016/j.bpc.2010.09.009 . PMID 21035241 . ^ Baugh C, Grate D, Wilson C (2000年8月). 「2.8 マラカイトグリーンアプタマーの結晶構造」. Journal of Molecular Biology . 301 (1): 117– 128. doi : 10.1006/jmbi.2000.3951 . PMID 10926496 . ^ Dieckmann T, Fujikawa E, Xhao X, Szostak J, Feigon J (1995). 「溶液中におけるRNAおよびDNAアプタマーの構造研究」. Journal of Cellular Biochemistry . 59 : 13– 81. doi : 10.1002/jcb.240590703 . S2CID 221833821 . ^ Mascini M, Palchetti I, Tombelli S (2012年2月). 「核酸およびペプチドアプタマー:基礎と生体分析的側面」. Angewandte Chemie . 51 (6): 1316– 1332. Bibcode : 2012ACIE...51.1316M . doi : 10.1002/anie.201006630 . PMID 22213382 . ^ Lipi F, Chen S, Chakravarthy M, Rakesh S, Veedu RN (2016年12月). 「化学修飾核酸アプタマーのin vitro進化:長所と短所、そして包括的な選択戦略」 . RNA Biology . 13 (12): 1232– 1245. doi : 10.1080/15476286.2016.1236173 . PMC 5207382. PMID 27715478 . ^ Chen A, Yan M, Yang S (2016). 「スプリットアプタマーとサンドイッチアプタセンサーへの応用」 . TrAC Trends in Analytical Chemistry . 80 : 581–593 . doi : 10.1016/j.trac.2016.04.006 . ^ Kent AD, Spiropulos NG, Heemstra JM (2013年10月). 「小分子結合DNAスプリットアプタマーの設計のための一般的なアプローチ」. 分析化学 . 85 (20): 9916– 9923. doi : 10.1021/ac402500n . PMID 24033257 . ^ Debiais M, Lelievre A, Smietana M, Müller S (2020年4月). 「先進バイオセンサー開発のためのアプタマーと核酸酵素の分割」 . Nucleic Acids Research . 48 (7): 3400– 3422. doi : 10.1093/nar/ gkaa132 . PMC 7144939. PMID 32112111 . ^ Drolet DW, Green LS, Gold L, Janjic N (2016年6月). 「眼に適合:眼疾患におけるアプタマー」 . Nucleic Acid Therapeutics . 26 (3): 127– 146. doi : 10.1089/nat.2015.0573 . PMC 4900223. PMID 26757406 . ^ Wang AZ, Farokhzad OC (2014年3月). 「アプタマーベースの分子イメージングの最新動向」 . Journal of Nuclear Medicine . 55 (3): 353– 356. doi : 10.2967/jnumed.113.126144 . PMC 4110511. PMID 24525205 . ^ バナジー、S.マサチューセッツ州ヘマト。シャバム、S.五西、A.デバラコンダ、S.ジャン、N.げきやなげ、C.ディラード、JA;モーリー、W.シュロトリヤ、P.他。構造的には異なるが機能的には類似:エボラウイルス可溶性糖タンパク質およびGP1、2に特異的なアプタマーとその電気化学的センシングへの応用。内部。 J.Mol.科学。 2023、24、4627。 https://doi.org/10.3390/ijms24054627 ^ a b Kaur H, Shorie M (2019年6月). 「臨床および環境診断用途向けナノマテリアルベースのアプタセンサー」 . Nanoscale Advances . 1 (6): 2123– 2138. Bibcode : 2019NanoA...1.2123K . doi : 10.1039/C9NA00153K . PMC 9418768. PMID 36131986 . ^ Mallikaratchy P (2017年1月). 「 哺乳類 細胞表面抗原に対するアプタマーを同定するための複合標的SELEX法の進化」 . Molecules . 22 (2): 215. doi : 10.3390/molecules22020215 . PMC 5572134. PMID 28146093 . ^ Potty AS, Kourentzi K, Fang H, Jackson GW, Zhang X, Legge GB, Willson RC (2009年2月). 「DNAアプタマーと血管内皮細胞増殖因子との相互作用の生物物理学的特性評価」. Biopolymers . 91 ( 2): 145– 156. doi : 10.1002/bip.21097 . PMID 19025993. S2CID 23670 . ^ Long SB, Long MB, White RR, Sullenger BA (2008年12月). 「トロンビンに結合したRNAアプタマーの結晶構造」 . RNA . 14 ( 12): 2504– 2512. doi : 10.1261/rna.1239308 . PMC 2590953. PMID 18971322 . ^ Kohn, Eric M.; Konovalov, Kirill; Gomez, Christian A.; Hoover, Gillian N.; Yik, Andrew Kai-hei; Huang, Xuhui; Martell, Jeffrey D. (2023-08-02). 「タンパク質結合親和性を高めた末端アルキン修飾DNAアプタマー」 . ACS Chemical Biology . 18 (9): 1976– 1984. doi : 10.1021/acschembio.3c00183 . ISSN 1554-8929 . PMID 37531184 . ^ Darfeuille F, Reigadas S, Hansen JB, Orum H, Di Primo C, Toulmé JJ (2006年10月). 「RNAヘアピンを標的とするアプタマーは、相補的オリゴヌクレオチドと比較して特異性が向上する」. 生化学 . 45 (39): 12076– 12082. doi : 10.1021/bi0606344 . PMID 17002307 . ^ Liu M, Kagahara T, Abe H, Ito Y (2009). 「ペルオキシダーゼ活性を有するヘミン結合DNAアプタマーの直接in vitro選択」. 日本化学会誌 . 82 : 99–104 . doi : 10.1246/bcsj.82.99 . ^ Min K, Cho M, Han SY, Shim YB, Ku J, Ban C (2008年7月). 「RNAおよびDNAアプタマーを用いたインターフェロン-γの簡便かつ直接的な電気化学的検出」. Biosensors & Bioelectronics . 23 (12): 1819– 1824. doi : 10.1016/j.bios.2008.02.021 . PMID 18406597 . ^ Ng EW, Shima DT, Calias P, Cunningham ET, Guyer DR, Adamis AP (2006年2月). 「ペガプタニブ:眼血管疾患に対する標的抗VEGFアプタマー」. Nature Reviews. Drug Discovery . 5 (2): 123– 132. doi : 10.1038 / nrd1955 . PMID 16518379. S2CID 8833436 . ^ Moghadam, Fatemeh Mortazavi; Rahaie, Mahdi (2019年5月). 「二価アプタマー上に形成された超粒子銅ナノクラスターに基づく VEGF165 検出のためのシグナルオンナノバイオセンサー」 . Biosensors and Bioelectronics . 132 : 186–195 . doi : 10.1016/j.bios.2019.02.046 . PMID 30875630. S2CID 80613434 . ^ Savory N, Abe K, Sode K, Ikebukuro K (2010年12月). 「遺伝的アルゴリズムを用いた前立腺特異抗原に対するDNAアプタマーの選択とセンシングへの応用」. Biosensors & Bioelectronics . 26 (4): 1386– 1391. doi : 10.1016/j.bios.2010.07.057 . PMID 20692149 . ^ Jeong S, Han SR, Lee YJ, Lee SW (2010年3月). 「活性前立腺特異抗原に特異的なRNAアプタマーの選択」. Biotechnology Letters . 32 (3): 379– 385. doi : 10.1007/s10529-009-0168-1 . PMID 19943183 . S2CID 22201181 . ^ Walsh R, DeRosa MC (2009年10月). 「RNAドーパミンアプタマーのDNAホモログにおける機能保持」. 生化学および生物理学的研究通信 . 388 (4): 732– 735. Bibcode : 2009BBRC..388..732W . doi : 10.1016/j.bbrc.2009.08.084 . PMID 19699181 . ^ Salamanca HH, Antonyak MA, Cerione RA, Shi H, Lis JT (2014). 「強力なRNAアプタマーによるヒト癌細胞における熱ショック因子1の阻害」 . PLOS ONE . 9 (5) e96330. Bibcode : 2014PLoSO...996330S . doi : 10.1371/journal.pone.0096330 . PMC 4011729. PMID 24800749 . ^ Farokhzad OC, Karp JM, Langer R (2006年5月). 「がん標的のためのナノ粒子-アプタマーバイオコンジュゲート」. 薬物送達に関する専門家の意見 . 3 (3): 311– 324. doi : 10.1517 / 17425247.3.3.311 . PMID 16640493. S2CID 37058942 . ^ Proske D, Gilch S, Wopfner F, Schätzl HM, Winnacker EL, Famulok M (2002年8月). 「プリオンタンパク質特異的アプタマーはPrPSc形成を減少させる」. ChemBioChem . 3 (8): 717– 725. doi : 10.1002/1439-7633(20020802)3:8<717::AID - CBIC717>3.0.CO;2-C . PMID 12203970. S2CID 36801266 . ^ Kaur H, Shorie M, Sharma M, Ganguli AK, Sabherwal P (2017年12月). 「病原性大腸菌O78:K80:H11検出のためのブリッジ型鉄筋グラフェン機能化アプタセンサー」. Biosensors & Bioelectronics . 98 : 486–493 . doi : 10.1016/j.bios.2017.07.004 . PMID 28728009 . ^ a b c Asha K, Kumar P, Sanicas M, Meseko CA, Khanna M, Kumar B (2018年12月). 「呼吸器ウイルス感染症に対する核酸ベースの治療薬の進歩」 . Journal of Clinical Medicine . 8 (1): 6. doi : 10.3390/jcm8010006 . PMC 6351902. PMID 30577479 . ^ Schmitz A, Weber A, Bayin M, Breuers S, Fieberg V, Famulok M, Mayer G (2021年4月). 「RBD非依存的なメカニズムで擬似ウイルス感染 を 阻害するSARS-CoV-2スパイク結合DNAアプタマー」 . Angewandte Chemie . 60 (18): 10279– 10285. doi : 10.1002/anie.202100316 . PMC 8251191. PMID 33683787 . ^ Dhar P, Samarasinghe RM, Shigdar S (2020年4月). 「抗体、ナノボディ、アプタマー ― 非モデル種のプロテオーム解読に最適なのはどれか?」 国際分子 科学 ジャーナル 21 (7): 2485. doi : 10.3390/ijms21072485 . PMC 7177290 . PMID 32260091 . ^ a b Bauer M, Strom M, Hammond DS, Shigdar S (2019年11月). 「あなたができることなら、私ももっとうまくできる:臨床診断アプリケーションにおいてアプタマーは抗体に取って代わることができるか?」 . Molecules . 24 ( 23): 4377. doi : 10.3390/molecules24234377 . PMC 6930532. PMID 31801185 . ^ Feng S, Chen C, Wang W, Que L (2018年5月). 「テオフィリン検出のためのアプタマーナノポア対応マイクロセンサー」 . Biosensors & Bioelectronics . 105 : 36–41 . doi : 10.1016/j.bios.2018.01.016 . PMID 29351868 . ^ Song C (2017). 「マイクロ流体キャピラリーインターフェースを備えた光アプタマーベースセンサーを用いた植物ホルモンアブシシン酸(ABA)の検出」. 2017 IEEE 第30回国際マイクロ電気機械システム会議(MEMS) . pp. 370– 373. doi : 10.1109/MEMSYS.2017.7863418 . ISBN 978-1-5090-5078-9 . S2CID 20781208 .^ Muszyńska K、Ostrowska D、Bartnicki F、Kowalska E、Bodaszewska-Lubaś M、Hermanowicz P、他。 (2017年)。 「テングタケ由来のα-アマニチンに結合するDNAアプタマーの選択と解析」 。 アクタ ビオキミカ ポロニカ 。 64 (3): 401–406 . 土井 : 10.18388/abp.2017_1615 。 PMID 28787470 。 S2CID 3638299 。 ^ Penner G (2012年7月). 「アプタマーベースの診断検査の商業化」 (PDF) . NeoVentures . ^ Wei H, Li B, Li J, Wang E, Dong S (2007年9月). 「非修飾金ナノ粒子プローブを用いたアプタマーベースの簡便かつ高感度なタンパク質比色センシング」. Chemical Communications (36): 3735– 3737. doi : 10.1039/B707642H . PMID 17851611 . ^ Cheng H, Qiu X, Zhao X, Meng W, Huo D, Wei H (2016年3月). 「生体中のK(+)とプロトポルフィリンIXの同時モニタリングのための機能性核酸プローブ」. 分析化学 . 88 (5): 2937– 2943. doi : 10.1021/acs.analchem.5b04936 . PMID 26866998 . ^ Xiang Y, Lu Y (2011年7月). 「個人用血糖測定器と機能性DNAセンサーを用いた様々な分析対象物質の定量化」 . Nature Chemistry . 3 (9): 697– 703. Bibcode : 2011NatCh ...3..697X . doi : 10.1038/nchem.1092 . PMC 3299819. PMID 21860458 . ^ Agnivo Gosai、Brendan Shin Hau Yeah、Marit Nilsen-Hamilton、Pranav Shrotriya、「アプタマー機能化ナノ多孔膜を用いた高濃度アルブミン存在下でのラベルフリートロンビン検出」、 Biosensors and Bioelectronics 、第126巻、2019年、pp. 88–95、 ISSN 0956-5663 、 doi : 10.1016/j.bios.2018.10.010 。 ^ Amero P, Khatua S, Rodriguez-Aguayo C, Lopez-Berestein G (2020年10月). 「アプタマー:新規治療薬と神経腫瘍学における潜在的役割」 . Cancers . 12 ( 10): 2889. doi : 10.3390/cancers12102889 . PMC 7600320. PMID 33050158 . ^ Fattal E, Hillaireau H, Ismail SI (2018年9月 ). 「治療薬と薬物送達におけるアプタマー」. Advanced Drug Delivery Reviews . 134 : 1–2 . doi : 10.1016/j.addr.2018.11.001 . PMID 30442313. S2CID 53562925 . ^ Hafner M, Vianini E, Albertoni B, Marchetti L, Grüne I, Gloeckner C, Famulok M (2008). 「蛍光偏光法でスクリーニングした小分子によるタンパク質結合アプタマーの置換」 Nature Protocols . 3 (4): 579– 587. doi : 10.1038/nprot.2008.15 . PMID 18388939 . S2CID 4997899 . ^ Huang Z, Qiu L, Zhang T, Tan W (2021-02-03). 「DNAナノテクノロジーとアプタマーの統合による生物学および生物医学応用」 . Matter . 4 (2): 461– 489. doi : 10.1016/j.matt.2020.11.002 . ISSN 2590-2385 . S2CID 234061584 . ^ Reynaud L, Bouchet-Spinelli A, Raillon C, Buhot A (2020年8月). 「ナノポアとアプタマーによるセンシング:今後の展望」 . Sensors . 20 ( 16): 4495. Bibcode : 2020Senso..20.4495R . doi : 10.3390/s20164495 . PMC 7472324. PMID 32796729 . ^ Yang Y, Yin S, Li Y, Lu D, Zhang J, Sun C (2017). 「異なるマトリックス中の抗生物質の検出およびクロマトグラフィー精製におけるアプタマーの応用」 . TrAC Trends in Analytical Chemistry . 95 : 1– 22. doi : 10.1016/j.trac.2017.07.023 . 2022年 7月4日 閲覧 。 ^ Murphy MB, Fuller ST, Richardson PM, Doyle SA (2003年9月). 「アプタマーのin vitro進化のための改良法とタンパク質検出・精製への応用」 . Nucleic Acids Research . 31 (18): 110e–110. doi : 10.1093/nar/gng110 . PMC 203336. PMID 12954786 . ^ Chen K, Zhou J, Shao Z, Liu J, Song J, Wang R, et al. (2020年7月). 「抗体産生モニタリングおよび品質管理のための多用途分子ツールとしてのアプタマー」. Journal of the American Chemical Society . 142 (28): 12079– 12086. Bibcode : 2020JAChS.14212079C . doi : 10.1021 / jacs.9b13370 . PMID 32516525. S2CID 219564070 . ^ Keijzer JF , Albada B (2022年3月). 「DNA支援による部位選択的タンパク質修飾」 . Biopolymers . 113 ( 3) e23483. doi : 10.1002/bip.23483 . PMC 9285461. PMID 34878181. S2CID 244954278 . ^ Smith D, Collins BD, Heil J, Koch TH (2003年1月). 「光アプタマープローブの感度と特異性」 . Molecular & Cellular Proteomics . 2 (1): 11– 18. doi : 10.1074/mcp.m200059-mcp200 . PMID 12601078. S2CID 13406870 . ^ ヴィンケンボーグ JL、メイヤー G、ファムロック M (2012 年 9 月)。 「アプタマーに基づくタンパク質のアフィニティー標識」 。 アンゲヴァンテ・ケミー 。 51 (36): 9176–9180 。 Bibcode : 2012ACIE...51.9176V 。 土井 : 10.1002/anie.201204174 。 PMID 22865679 。 ^ Keijzer JF, Firet J, Albada B (2021年12月). 「アプタマー触媒複合体を用いたトロンビンの部位選択的かつ誘導性アシル化」 . Chemical Communications . 57 (96): 12960– 12963. doi : 10.1039 / d1cc05446e . PMID 34792071. S2CID 243998479 . ^ Wilson, Brandon D.; Soh, H. Tom (2020-08-01). 「結合アッセイに関する従来の知見の再評価」 . Trends in Biochemical Sciences . 45 (8): 639– 649. doi : 10.1016/j.tibs.2020.04.005 . ISSN 0968-0004 . PMC 7368832. PMID 32402748 . ^ Janson, Jan-Christer (2012-01-03). タンパク質精製:原理、高分解能法、そして応用 . John Wiley & Sons. ISBN 978-1-118-00219-3 。^ Chen A, Yang S (2015年9月). 「ラテラルフロー免疫アッセイにおける抗体のアプタマーへの置換」. Biosensors & Bioelectronics . 71 : 230–242 . doi : 10.1016/j.bios.2015.04.041 . PMID 25912679 . ^ Toh SY, Citartan M, Gopinath SC, Tang TH (2015年2月). 「酵素結合免疫吸着法における抗体の代替としてのアプタマー」. Biosensors & Bioelectronics . 64 : 392–403 . doi : 10.1016/j.bios.2014.09.026 . PMID 25278480 . ^ Bruno JG, Sivils JC (2016). 「アプタマーによる大腸菌外膜タンパク質および病原性大腸菌血清型における主要な毒性因子のウェスタンブロッティング」 . アプタマーと合成抗体 . ^ Bauer M, Macdonald J, Henri J, Duan W, Shigdar S (2016年6月). 「免疫組織化学におけるアプタマーの応用」. Nucleic Acid Therapeutics . 26 (3): 120– 126. doi : 10.1089/nat.2015.0569 . PMID 26862683 . ^ Meyer M, Scheper T, Walter JG (2013年8月). 「アプタマー:フローサイトメトリーのための多用途プローブ」. 応用微生物学およびバイオテクノロジー . 97 (16): 7097– 7109. doi : 10.1007/s00253-013-5070 - z . PMID 23838792. S2CID 13996688 . ^ Zhou J, Rossi J (2017年3月). 「標的治療薬としてのアプタマー:現在の可能性と課題」 . Nature Reviews. Drug Discovery . 16 (3): 181– 202. doi : 10.1038/nrd.2016.199 . PMC 5700751. PMID 27807347 . ^ Bruno JG (2015年4月). 「アプタマーベースの診断および治療の不確かな未来を予測する」 . Molecules . 20 ( 4): 6866– 6887. doi : 10.3390/molecules20046866 . PMC 6272696. PMID 25913927 . ^ Wang T, Chen C, Larcher LM, Barrero RA, Veedu RN (2019). 「30年間の核酸アプタマー技術:アプタマー開発における教訓、進歩、そして可能性」 . Biotechnology Advances . 37 (1): 28– 50. doi : 10.1016/j.biotechadv.2018.11.001 . PMID 30408510. S2CID 53242220 . ^ Melbourne J, Bishop P, Brown J, Stoddart G (2016年10月). 「動物実験を使わない研究方法の世界的な普及 に 向けた多面的なアプローチ」 . 実験動物代替法 . 44 (5): 495– 498. doi : 10.1177/026119291604400511 . PMID 27805832. S2CID 1002312 . ^ Alfaleh MA, Alsaab HO, Mahmoud AB, Alkayyal AA, Jones ML, Mahler SM, Hashem AM (2020). 「 ファージ ディスプレイ由来モノクローナル抗体:実験室からベッドサイドへ」 . Frontiers in Immunology . 11 1986. doi : 10.3389/fimmu.2020.01986 . PMC 7485114. PMID 32983137 . ^ Soontornworajit B, Zhou J, Shaw MT, Fan TH, Wang Y (2010年3月). 「DNAアプタマーを用いたハイドロゲル機能化によるPDGF-BBの持続放出」. Chemical Communications . 46 (11): 1857– 1859. doi : 10.1039/B924909E . PMID 20198232 . ^ Battig MR, Soontornworajit B, Wang Y (2012年8月). 「アプタマー機能化ハイドロゲルからの核酸ハイブリダイゼーションによる複数タンパク質薬剤のプログラム可能な放出」. Journal of the American Chemical Society . 134 (30): 12410– 12413. Bibcode : 2012JAChS.13412410B . doi : 10.1021/ja305238a . PMID 22816442 . ^ Stejskalová A, Oliva N, England FJ, Almquist BD (2019年2月). 「生物学的に着想を得た、牽引力によるアプタマー捕捉成長因子の細胞選択的放出」 . Advanced Materials . 31 (7) e1806380. Bibcode : 2019AdM....3106380S . doi : 10.1002/adma.201806380 . PMC 6375388. PMID 30614086 . ^ Rana D, Rangel VR, Padmanaban P, Trikalitis VD, Kandar A, Kim HW, Rouwkema J (2024-11-01). 「4Dにおけるマルチスケール微小血管形態 形成 を調節するためのアプタマーベースのプログラマブルバイオインクのバイオプリンティング」 . Advanced Healthcare Materials . 14 (1) 2402302. doi : 10.1002/adhm.202402302 . PMC 11694088. PMID 39487611 . ^ Rana D, Kandar A, Salehi-Nik N, Inci I, Koopman B, Rouwkema J (2021年10月23日). 「 時空間的に制御されたアプタマーを介した成長因子の放出は、人工組織内の微小血管形成を局所的に制御する」 . Bioactive Materials . 12 : 71– 84. doi : 10.1016/j.bioactmat.2021.10.024 . PMC 8777207. PMID 35087964 . ^ Berezovski MV, Lechmann M, Musheev MU, Mak TW, Krylov SN (2008年7月). 「アプタマー促進バイオマーカー発見(AptaBiD)」. Journal of the American Chemical Society . 130 (28): 9137– 9143. Bibcode : 2008JAChS.130.9137B . doi : 10.1021/ja801951p . PMID 18558676 . ^ Colas P, Cohen B, Jessen T, Grishina I, McCoy J, Brent R (1996年4月). 「サイクリン依存性キナーゼ2を認識し阻害するペプチドアプタマーの遺伝的選択」. Nature . 380 ( 6574): 548– 550. Bibcode : 1996Natur.380..548C . doi : 10.1038/380548a0 . PMID 8606778. S2CID 4327303 . ^ Nolan GP (2005年1月). 「尾で捕らえたオタマジャクシ」. Nature Methods . 2 (1): 11– 12. doi : 10.1038/nmeth0105-11 . PMID 15782163. S2CID 1423778 . ^ Spolar RS, Record MT (1994年2月). 「局所フォールディングとタンパク質のDNAへの部位特異的結合の相関」. Science . 263 (5148): 777– 784. Bibcode : 1994Sci...263..777S . doi : 10.1126/science.8303294 . PMID 8303294 . ^ Huang J, Ru B, Zhu P, Nie F, Yang J, Wang X, 他 (2012年1月). 「MimoDB 2.0:ミモトープデータベースとその先へ」 . Nucleic Acids Research . 40 (データベース号): D271– D277. doi : 10.1093/nar/ gkr922 . PMC 3245166. PMID 22053087 . ^ 「MimoDB:ミモトペデータベースとその先へ」 immunet.cn . 2012年11月16日時点の オリジナル よりアーカイブ 。 2016年2月3日 閲覧。 ^ Geyer CR、Colman-Lerner A、Brent R(1999年7月) 。 ペプチドアプタマーによる「突然変異誘発」は遺伝子ネットワークのメンバーと経路のつながりを特定する 。米国 科学 アカデミー紀要 。96 (15) : 8567– 8572。Bibcode : 1999PNAS ... 96.8567G。doi : 10.1073 / pnas.96.15.8567。PMC 17557。PMID 10411916 。 ^ Dibenedetto S, Cluet D, Stebe PN, Baumle V, Léault J, Terreux R, et al. (2013年7月). 「カルシニューリンAとNS5A-TP2/HDドメイン含有2の比較:ペプチドアプタマーの標的特異性を解明するため の 部位特異的低頻度ランダム変異導入の事例研究」 . Molecular & Cellular Proteomics . 12 (7): 1939– 1952. doi : 10.1074/mcp.M112.024612 . PMC 3708177. PMID 23579184 . ^ Colas P, Cohen B, Ko Ferrigno P, Silver PA, Brent R (2000年12月). 「細胞タンパク質の標的修飾と輸送」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (25 ) : 13720– 13725. Bibcode : 2000PNAS...9713720C . doi : 10.1073/pnas.97.25.13720 . PMC 17642. PMID 11106396 . ^ 「FDAがアイテック/ファイザーのマクゲンを承認」 Review of Ophthalmology . 2022年 6月30日 閲覧。 ^ Dutt S. 「SomaLogicとIlluminaの強みが融合し、プロテオミクスにおけるイノベーションを推進」 BioSpace . 2022年 6月30日 閲覧 。 ^ 「Apta-Index™(アプタマーデータベース)- 500種類以上のアプタマーのライブラリ」 APTAGEN , LLC . 2022年12月16日 閲覧 。
さらに読む Ellington AD, Szostak JW (1990年8月). 「特異的リガンドに結合するRNA分子のin vitro選択」. Nature . 346 ( 6287): 818– 822. Bibcode : 1990Natur.346..818E . doi : 10.1038/346818a0 . PMID 1697402. S2CID 4273647 . Bock LC, Griffin LC, Latham JA, Vermaas EH, Toole JJ (1992年2月). 「ヒトトロンビンに結合し阻害する一本鎖DNA分子の選択」. Nature . 355 ( 6360): 564– 566. Bibcode : 1992Natur.355..564B . doi : 10.1038/355564a0 . PMID 1741036. S2CID 4349607 . Hoppe-Seyler F, Butz K (2000). 「ペプチドアプタマー:分子医学のための強力な新ツール」. Journal of Molecular Medicine . 78 (8): 426– 430. doi : 10.1007/s001090000140 . PMID 11097111. S2CID 52872561 . Carothers JM, Oestreich SC, Davis JH, Szostak JW (2004年4月). 「RNA構造の情報複雑性と機能活性」 . Journal of the American Chemical Society . 126 (16): 5130– 5137. Bibcode : 2004JAChS.126.5130C . doi : 10.1021/ja031504a . PMC 5042360. PMID 15099096 . Cohen BA, Colas P, Brent R (1998年11月). 「コンビナトリアルライブラリーから単離された人工細胞周期阻害剤」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (24): 14272– 14277. Bibcode : 1998PNAS...9514272C . doi : 10.1073 / pnas.95.24.14272 . PMC 24363. PMID 9826690 . Binkowski BF, Miller RA, Belshaw PJ (2005年7月). 「リガンド制御ペプチド:小分子によるタンパク質-ペプチド相互作用の調節のための一般的なアプローチ」 . Chemistry & Biology . 12 (7): 847– 855. doi : 10.1016/j.chembiol.2005.05.021 . PMID 16039531 . Sullenger BA, Gilboa E (2002年7月). 「RNAの新たな臨床応用」. Nature . 418 ( 6894): 252– 258. Bibcode : 2002Natur.418..252S . doi : 10.1038/418252a . PMID 12110902. S2CID 4431755 . Ng EW, Shima DT, Calias P, Cunningham ET, Guyer DR, Adamis AP (2006年2月). 「ペガプタニブ:眼血管疾患に対する標的抗VEGFアプタマー」. Nature Reviews. Drug Discovery . 5 (2): 123– 132. doi : 10.1038 / nrd1955 . PMID 16518379. S2CID 8833436 . Drabovich AP, Berezovski M, Okhonin V, Krylov SN (2006年5月). 「カイネティックキャピラリー電気泳動法によるスマートアプタマーの選択」.分析化学 . 78 (9): 3171– 3178. doi : 10.1021/ac060144h . PMID 16643010 . Cho EJ, Lee JW, Ellington, AD Cho EJ, Lee JW, Ellington AD (2009). 「アプタマーのセンサーとしての応用」. Annual Review of Analytical Chemistry . 2 (1): 241– 264. Bibcode : 2009ARAC....2..241C . doi : 10.1146/annurev.anchem.1.031207.112851 . PMID 20636061 . Spill F, Weinstein ZB, Irani Shemirani A, Ho N, Desai D, Zaman MH (2016年10月). 「アプタマー選択における不確実性の制御」 . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 113 (43): 12076– 12081. arXiv : 1612.08995 . Bibcode : 2016PNAS..11312076S . doi : 10.1073/pnas.1605086113 . PMC 5087011. PMID 27790993 .