クロトナーゼファミリー
エノイルCoAヒドラターゼ/イソメラーゼファミリー
識別子
シンボルECH
ファムPF00378
インタープロIPR001753
プロサイトPDOC00150
SCOP21dub /スコープ/ SUPFAM
CDDcd06558
利用可能なタンパク質構造:
PDB  1dub A:48-214 2dub E:48-214 1ey3 B:48-214

1mj3 A:48-214 1hzd D:90-259 1wdm A:18-190 1wdk B:18-190 1wdl B:18-190 1uiy A:10-180 2f6q B:116-287 1q52 B:48-235 1q51 B:48-235 1rjn A:48-235 1rjm A:48-235 1dci A:67-247 1wz8 B:22-191 2a81 A:11-180 2a7k F:11-180 1ef8 B:15-183 1ef9 A:15-183 1pjh A:20-200 1k39 B:20-200 1hno A:20-200 1hnu A:20-200 2fbm A:295-467 1szo C:27-195 1o8u D:27-195 1xx4 A:45-215 1sg4 C:58-228 IPR001753 PF00378 ( ECOD ; PDBsum )

 
アルファフォールド

クロトナーゼファミリーは、保存された三量体四次構造（時には三量体の二量体からなる六量体）を共有する機構的に多様なタンパク質で構成され、その中心部分は 4 回転の (ベータ/ベータ/アルファ)n スーパーヘリックスから構成されます。

このスーパーファミリーの酵素の中には、脱ハロゲン化酵素、ヒドラターゼ、イソメラーゼ活性を示すものがあり、また、炭素-炭素結合の形成と切断、さらにはチオエステルの加水分解に関与する酵素もある。[ 1 ]しかし、これらの異なる酵素は、アシルCoA基質由来のエノラートアニオン中間体を安定化させるという点で共通している。これは、構造的に保存された2つのペプチドNH基によって達成される。このNH基は、アシルCoA基質のカルボニル基に水素結合を供給し、「オキシアニオンホール」を形成する。CoAチオエステル誘導体は特徴的なフック形状で結合し、保存されたトンネルがCoAのパンテテイン基に結合し、3'-リン酸ADP結合部位と反応部位を連結する。[ 2 ]クロトナーゼスーパーファミリーの酵素には以下が含まれる。

このドメインを含むヒトタンパク質

ああ; CDY2B ; CDYL ; CDYL2 ; DCI ; ECH1 ; ECHDC1 ; ECHDC2 ; ECHDC3 ; ECHS1 ; エハド; ハダ; HCA64 ; ヒビッチ; PECI ;

参考文献

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  13. ^濡木 修、深井 聡、横山 聡、武藤 勇、栗本 健 (2001). 「エノイルCoAヒドラターゼの一本鎖RNA結合ホモログ、ヒトAUHタンパク質の結晶構造」 . Structure . 9 (12): 1253–63 . doi : 10.1016/S0969-2126(01)00686-4 . PMID 11738050 . 
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