ストレプトマイセス・アルビドフラバス
ストレプトマイセス・アルビドフラバス
科学的分類この分類を編集する
ドメイン： 細菌
界： バチルス
門 放線菌門
綱 放線菌綱
目 放線菌綱
科 放線菌科
属: ストレプトマイセス
種:
S.アルビドフラバス
二名法
ストレプトマイセス・アルビドフラバス
（ロッシ・ドーリア 1891）ワクスマンとヘンリチ 1948（承認リスト 1980）[ 1 ]
基準株
AS 4.1291、ATCC 25422、BCRC 13699、CBS 416.34、CBS 920.69、CCRC 13699、CGMCC 4.1291、CIP 105122、DSM 40455、ETH 10209、ICMP 12537、ICSSB 1006、IFO 13010、IMRU 850、IMSNU 20133、IMSNU 21006、ISP 5455、JCM 4446、KCC S-0446、KCC S-0466、KCC S-1072、KCCS-0466、KCTC 9202、Lanoot R-8660、LMG 19300、MTCC 932、 NBIMCC 2386, NBRC 13010, NCIB 10043, NCIMB 10043, NRRL B-1271, NRRL B-2663, NRRL BB-2663, NRRL-ISP 5455, RIA 1202, 株 ATCC 25422, VK​​M Ac-746, VTT E-991429 [ 2 ]
同義語[ 3 ] [ 4 ]
  • 「アクチノマイセス・アルビドフラバス」（ロッシ・ドーリア 1891）ガスペリーニ 1894
  • 「アクチノマイセス・グロビスポルス亜種コーカシクス」クドリナ 1957
  • 「アクチノマイセス・サンプソニ」ミラードとバー 1926
  • 「Cladothrix albido-flava」[原文のまま] (ロッシ・ドリア 1891) メイス 1901
  • ストレプトマイセス・カネセンス・ワクスマン 1957（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・チャンパヴァティ ウマとナラシンハ・ラオ 1959（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・セリカラー（ミュラー 1908）ワックスマンとヘンリシ 1948（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・フェレウス・リンデンバイン 1952 (承認リスト 1980)
  • ストレプトマイセス・グロビスポルス亜種コーカシクス（クドリナ 1957）プリダムら1958（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・グリセウス亜種ソルビファシエンス・プリダム 1970（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・リモサス・リンデンバイン 1952（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・オドリファー（ルルマン 1895）ワックスマン 1953（承認リスト 1980）
  • ストレプトマイセス・サンプソニ（ミラードとバー 1926）ワックスマン 1953（承認リスト 1980）
  • 「Streptothrix albidoflava」ロッシ・ドリア 1891
  • 「Streptotrix albidoflava」[原文ママ] ロッシ・ドリア 1891
  • 「Streptothrix coelicolor」ミュラー 1908

ストレプトマイセス・アルビドフラバスは、ポーランドの土壌から分離されたストレプトマイセス属の細菌種である。 [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]ストレプトマイセス・アルビドフラバスは、フタル酸ジブチルとストレプトトリシンを産生する。 [ 6 ] [ 7 ]

低分子非コードRNA

細菌の低分子RNAは転写後制御に関与しています。ディープシーケンシングを用いて、 S. albidoflavusのトランスクリプトームを指数関数的増殖の終わりに解析しました。63の低分子RNAが同定されました。そのうち11の発現はノーザンブロットによって確認されました。これらのsRNAはストレプトマイセス属にのみ存在することが示されました。[ 8 ]

sRNA scr4677（ストレプトマイセス・コエリカラーsRNA 4677）は、抗シグマ因子SCO4677遺伝子と推定調節タンパク質遺伝子SCO4676との間の遺伝子間領域に位置する。scr4677の発現にはSCO4677の活性が必要であり、scr4677 sRNA自体がSCO4676関連転写産物のレベルに影響を与えると思われる。[ 9 ]

S. albidoflavusの非コードRNAのうち2つの標的が同定されている。グルタミン合成酵素Iの非コードRNAは、抗生物質産生を調節することが示された。[ 10 ]小型RNA scr5239（ SCO5239の上流のStreptomyces coelicolor sRNA）には2つの標的がある。このRNAは、dagAコード領域に直接塩基対合することによりアガラーゼDagAの発現を阻害し、メチオニン合成酵素metE （SCO0985）のオープンリーディングフレームの5'末端における翻訳を抑制する。[ 11 ] [ 12 ]

脂肪酸合成

S. albidoflavusの[アシルキャリアタンパク質] S-マロニルトランスフェラーゼの結晶構造が利用可能です。S . albidoflavusのACP S -MTは、脂肪酸合成IIとポリケチド合成酵素の両方に関与しており、大腸菌の類似体と構造的に類似しています。[ 13 ]

バイオテクノロジーにおける利用

S. albidoflavusの菌株は、アクチノロジン、メチレノマイシン、ウンデシルプロディジオシン[ 14 ] 、ペリマイシン[ 15 ]など、様々な抗生物質を生産する。[16 ] S. albidoflavusの特定の菌株は、異種タンパク質発現に利用できる。[ 17 ]

DNA修復

Ku ホモログはSCF55.25cです。C末端にエビアルカリホスファターゼ様（SAP様）ドメインを有します。S . albidoflavusは、（推定上）単一ドメインタンパク質SC9H11.09cを産生します。これは、多くの細菌性LigDに共通するLigD NucDomと相同性があります。（LigDはDNAリガーゼのサブファミリーです。細菌では、すべてではありませんが、多くのLigDが、普遍的に存在する中心のリガーゼドメインから分岐した追加のヌクレアーゼドメインを持っています。この場合のように存在する場合、ヌクレアーゼドメインはN末端の延長です。）[ 18 ]

遺伝学

ゲノムは単一の線状分子で構成されており、Kuが末端維持を行うと予想されるものの、これまでのところ観察されていません。[ 18 ]

参照

参考文献

  1. ^ a b LPSN bacterio.net
  2. ^ストレプトマイセス・アルビドフラバスの菌株情報
  3. ^ a bユニプロット
  4. ^ a b Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen [1]
  5. ^ Swiontek Brzezinska, M.; Jankiewicz, U.; Burkowska, A. (2013). 「ストレプトマイセス・アルビドフラバスの抗真菌成分の精製と特性評価」.応用生化学・微生物学. 49 (5): 451. doi : 10.1134/S0003683813050025 . S2CID  17097515 .
  6. ^ Roy, ​​RN; Laskar, S.; Sen, SK (2006). 「ストレプトマイセス・アルビドフラバス321.2が産生する生理活性化合物、ジブチルフタレート」 .微生物研究. 161 (2): 121–6 . doi : 10.1016/j.micres.2005.06.007 . PMID 16427514 . 
  7. ^スチュアート・シャピロ (1989). 『放線菌における二次代謝の制御』 CRC Press. ISBN 0-8493-6927-4。
  8. ^ Vockenhuber MP, Sharma CM, Statt MG, Schmidt D, Xu Z, Dietrich S, et al. (2011年5月). 「ストレプトマイセス・コエリカラーにおける低分子ノンコーディングRNAのディープシーケンシングに基づく同定」 . RNA Biology . 8 (3): 468–77 . doi : 10.4161/rna.8.3.14421 . PMC 3218513. PMID 21521948  
  9. ^ Moody MJ, Jones SE, Elliot MA (2014-01-01). 「 Streptomyces coelicolorにおける低分子RNAを介した複雑なオペロン内ダイナミクス」 . PLOS ONE . 9 (1) e85856. Bibcode : 2014PLoSO...985856H . doi : 10.1371/ journal.pone.0085856 . PMC 3896431. PMID 24465751 .  
  10. ^ダリア D、ニーゼルト K、シュタイゲレ S、ミュラー J、フェルブルク I、高野 E (2010 年 2 月)。「グルタミン合成酵素 I の非コード RNA は、Streptomyces coelicolor A3 における抗生物質の産生を調節する(2)」。細菌学ジャーナル。192 (4): 1160–4 .土井: 10.1128/JB.01374-09。PMC 2812974。PMID 19966003。  
  11. ^ Vockenhuber MP, Suess B (2012年2月). 「ストレプトマイセス・コエリカラーsRNA scr5239はdagAコード領域への直接塩基対合によりアガラーゼ発現を阻害する」 . Microbiology . 158 (Pt 2): 424– 435. doi : 10.1099/mic.0.054205-0 . PMID 22075028 . 
  12. ^ Vockenhuber MP, Heueis N, Suess B (2015-01-01). 「Streptomyces coelicolorにおけるsRNA scr5239の第二標的としてのmetEの同定」 . PLOS ONE . 10 (3) e0120147. Bibcode : 2015PLoSO..1020147V . doi : 10.1371/journal.pone.0120147 . PMC 4365011. PMID 25785836 .  
  13. ^ White, Stephen W.; Zheng, Jie; Zhang, Yong-Mei; Rock, Charles O. (2005). 「II型脂肪酸生合成の構造生物学」. Annual Review of Biochemistry . 74 (1). Annual Reviews : 791– 831. doi : 10.1146/annurev.biochem.74.082803.133524 . ISSN 0066-4154 . PMID 15952903 .  
  14. ^ Brian P, Riggle PJ, Santos RA, Champness WC (1996年6月). 「absAをコードした推定シグナル伝達系によるStreptomyces coelicolor抗生物質合成の包括的負制御」 . Journal of Bacteriology . 178 ( 11): 3221–31 . doi : 10.1128/jb.178.11.3221-3231.1996 . PMC 178074. PMID 8655502 .  
  15. ^ Liu CM, McDaniel LE, Schaffner CP (1972年3月). 「ファンギマイシン、その芳香族部分の生合成」 . The Journal of Antibiotics . 25 (3): 187–8 . doi : 10.7164/antibiotics.25.187 . PMID 5034814 . 
  16. ^ Lee CH, Schaffner CP (1969年5月). 「ペリマイシン. いくつかの分解生成物の構造」. Tetrahedron . 25 (10): 2229–32 . doi : 10.1016/S0040-4020(01)82770-8 . PMID 5788396 . 
  17. ^ 「ストレプトマイセス・コエリカラー」ジョン・イネス・センター。2005年10月19日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2010年1月25日閲覧。
  18. ^ a b Pitcher, Robert S.; Brissett, Nigel C.; Doherty, Aidan J. (2007). 「細菌における非相同末端結合：微生物学の視点」Annual Review of Microbiology 61 ( 1). Annual Reviews : 259– 282. doi : 10.1146/annurev.micro.61.080706.093354 . ISSN 0066-4227 . PMID 17506672 .  

さらに読む

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