タンゴ2

タンゴ2
識別子
エイリアスTANGO2、C22orf25、MECRCN、輸送およびゴルジ体2ホモログ
外部IDオミム: 616830 ; MGI : 101825 ;ホモロジーン: 44029 ;ジーンカード：TANGO2 ; OMA : TANGO2 - オルソログ
オーソログ
種人間ねずみ
エントレズ

128989

27883

アンサンブル

ENSG00000183597

ENSMUSG00000013539

ユニプロット

Q6ICL3

P54797

RefSeq (mRNA)

NM_138583

RefSeq（タンパク質）

該当なし

場所（UCSC）22章: 20.02 – 20.07 MB該当なし
PubMed検索[ 2 ][ 3 ]
ウィキデータ
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輸送およびゴルジ体組織 2 ホモログ(TANGO2) は、染色体 22オープン リーディング フレーム25 (C22orf25)としても知られ、ヒトでは TANGO2 遺伝子によってコード化される タンパク質です。

C22orf25の機能は現在のところ不明です。NRDEスーパーファミリードメイン（DUF883）を特徴とし、厳密には（N）-アスパラギン（R）-アルギニン（D）-アスパラギン酸（E）-グルタミン酸という保存されたアミノ酸配列で知られています。このドメインは、6つの界：[ 4 ]真正細菌、古細菌、原生生物、菌類、植物界、動物界の遠縁の種に見られ、ゴルジ体組織やタンパク質分泌に関与することが知られています。[ 5 ]細胞質 に局在していると考えられますが、 2番目のアミノ酸によって細胞膜に固定されています。 [ 6 ] [ 7 ] C22orf25は、鶏痘ウイルスやカナリア痘ウイルスのT10様タンパク質とも異種です。 C22orf25をコードする遺伝子は22番染色体のq11.21に位置しているため、22q11.2欠失症候群と関連することが多い。[ 8 ]

タンパク質

遺伝子のサイズタンパク質のサイズエクソン数プロモーター配列シグナルペプチド分子量ドメインの長さ
2271 bp276 アミノ酸9 [ 9 ]687 bpいいえ[ 10 ]30.9 kDa [ 11 ]270 アミノ酸

ジーン地区

C22orf25遺伝子は、22番染色体の長腕（q）の領域1、バンド1、サブバンド2（22q11.21）に位置し、20,008,631塩基対で始まり、20,053,447塩基対で終わります。[ 8 ]この領域には、約30～40個の遺伝子 を含む1.5～3.0 Mbの欠失があり、これが22q11.2欠失症候群と呼ばれる最も生存率の高い遺伝子欠失疾患を引き起こします。この症候群は、一般的にはディジョージ症候群または口蓋垂顔面症候群として知られています。[ 12 ] [ 13 ] 22q11.2欠失症候群には、非常に多様な表現型があり、単一の遺伝子の喪失に起因するものではありません。多様な表現型は、ディジョージ症候群の重要領域（DGCR）遺伝子や疾患遺伝子だけでなく、他の未確認遺伝子の欠失からも生じます。[ 14 ]

C22orf25はDGCR8のすぐ近くにあるほか、ディジョージ症候群に関与することが知られている他の遺伝子、例えば口蓋心臓顔面症候群で欠失したアルマジロリピート遺伝子（ARVCF）、カテコール-O-メチルトランスフェラーゼ（COMT）、T-ボックス1（TBX1）にも近接している。[ 15 ] [ 16 ]

C22orf25の遺伝子近傍
C22orf25の遺伝子近傍

予測されるmRNAの特徴

プロモーター

C22orf25遺伝子のプロモーターは、20,008,092塩基対から20,008,878塩基対にわたる687塩基対に及び、予測される転写開始部位は104塩基対で、20,008,591塩基対から20,008,694塩基対に及ぶ。[ 17 ] C22orf25遺伝子のプロモーター領域と開始領域（20,008,263塩基対から20,009,250塩基対）は、霊長類を超えて保存されていない。この領域は、転写因子相互作用の解明に用いられた。

転写因子

プロモーターに結合する主な転写因子のいくつかを以下に挙げる。[ 18 ]

参照詳細な家族情報開始（アミノ酸）末端（アミノ酸）ストランド
XBBFX-box の結合要因227245-
GCMF絨毛膜特異的転写因子（GCM DNA結合ドメインを有する）151165-
YBXFYボックス結合転写因子158170-
急ぐSWI/SNF関連核リン酸化タンパク質（RINGフィンガー結合モチーフを有する）222232-
ニュールNeuroD、Beta2、HLHドメイン214226-
PCBEPREBコア結合エレメント148162-
NR2F核受容体サブファミリー2因子169193-
AP1RMAFおよびAP1関連因子201221-
ZF02C2H2ジンクフィンガー転写因子2108130-
物語TGモチーフを認識するTALEホメオドメインクラス216232-
WHNF翼状らせん転写因子271281-
FKHDフォークヘッドドメイン要因119135+
マイオッド筋芽細胞決定因子218234+
AP1FAP1、活性化タンパク質1118130+
BCL6B細胞で発現するPOZドメインジンクフィンガー190206+
ケアカルシウム応答要素196206+
EVI1EVI1核転写因子90106+
ETSFETS転写因子162182+
ティーフTEA/ATTS DNA結合ドメイン因子176188+

発現解析

発現配列タグマッピング、マイクロアレイ、およびin situハイブリダイゼーションによる発現データは、ホモ・サピエンスにおいて血液、骨髄、神経において高い発現を示している。[ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] 発現はこれらの領域に限定されず、体の他の部位では低い発現が見られる。線虫Caenorhabditis elegansでは、snt-1遺伝子（C22orf25ホモログ）が神経環、腹側および背側索突起、神経筋接合部、そしてニューロンにおいて発現していた。[ 22 ]

進化の歴史

NRDE (DUF883) ドメインは、C22orf25 遺伝子の大部分に及ぶ機能不明のドメインであり、ウイルスを含む遠縁の種に見られます。

属と種通称受入番号シーケンス長シーケンスIDシーケンス類似度王国分岐の時
ホモ・サピエンス人間NP_690870.3276aa--動物界-
パン・トログロダイトチンパンジーBAK62258.1276aa99%100%動物界640万年前
メラノレウカジャイアントパンダXP_002920626276aa91%94%動物界9440万年前
ハツカネズミハツカネズミNP_613049.2276aa88%95%動物界9240万年前
メレアグリス・ガロパボ七面鳥XP_003210928276aa74%88%動物界3億170万年前
ガルス・ガルスアカヤケイNP_001007837276aa73%88%動物界3億170万年前
アフリカツメガエルアフリカツメガエルNP_001083694275aa69%86%動物界3億7120万年前
アフリカツメガエル（シルラナ）トロピカリスニシツメガエルNP_001004885.1276aa68%85%動物界3億7120万年前
サルモ・サラーアトランティックサーモンNP_001167100274aa66%79%動物界4億100万年前
ダニオ・レリオゼブラフィッシュNP_001003781273aa64%78%動物界4億100万年前
カナリア痘ウイルスNP_955117275aa50%69%--
鳥痘ウイルスNP_039033273aa44%63%--
クプリアヴィドゥスプロテオバクテリアYP_002005507.1275aa38%52%真正細菌2313.2百万年前
バークホルデリアプロテオバクテリアYP_004977059273aa37%53%真正細菌2313.2百万年前
ヒメツリガネゴケ苔XP_001781807275aa37%54%植物界1369百万年前
トウモロコシトウモロコシACG35095266aa33%53%植物界1369百万年前
トリコフィトン・ルブルム菌類XP_003236126306aa32%47%菌類12億1580万年前
スポリソリウム・レイリアヌム植物病原体CBQ69093321aa32%43%菌類12億1580万年前
パーキンサス・マリヌスカキの病原体XP_002787624219aa31%48%原生生物1381.2百万年前
テトラヒメナ・サーモフィリア繊毛虫原生動物XP_001010229277aa26%44%原生生物1381.2百万年前
ナトリアルバ・マガディ極限環境生物YP_003481665300aa25%39%古細菌3556.3百万年前
ハロピガー・ザナドゥエンシス好塩性古細菌YP_004597780.1264aa24%39%古細菌3556.3百万年前

予測されるタンパク質の特徴

翻訳後修飾

動物界、植物界、およびカナリア痘ウイルスにおいて進化的に保存されているC22orf25遺伝子の翻訳後修飾には、糖化（C-マンノシル化）[ 23 ] 、糖化[ 24 ] 、リン酸化（キナーゼ特異的）[ 25 ] 、 およびパルミトイル化[ 26 ]が含まれる。

予測されたトポロジー

C22orf25は細胞質に局在し、2番目のアミノ酸によって細胞膜に固定されています。前述のように、2番目のアミノ酸はパルミトイル化によって修飾されています。パルミトイル化は疎水性を高めるため、膜会合に寄与することが知られています[ 27 ] 。 [ 6 ]パルミトイル化は、タンパク質の輸送[ 28 ] 、安定性[ 29 ]、および選別の調節に役割を果たすことが知られています[ 30 ] 。パルミトイル化は細胞シグナル伝達[ 31 ]および神経伝達にも関与しています[ 32 ] 。

タンパク質相互作用

C22orf25はNFKB1、[ 33 ]、 RELA、[ 33 ] 、 RELB、[ 33 ] 、 BTRC、[ 33 ] 、 RPS27A、[ 33]、 BCL3、[ 33 ] 、 MAP3K8、[ 33 ] 、 NFKBIA、[ 33 ] 、 SIN3A、[ 33 ] 、 SUMO1、[ 33 ] 、 Tatと相互作用することが示されている。[ 34 ]

臨床的意義

TANGO2遺伝子の変異は、ミトコンドリアβ酸化の欠陥[ 35 ]や小胞体ストレスの増加、ゴルジ体容積密度の低下を引き起こす可能性がある。 [ 36 ] これらの変異は、早期発症の低血糖、高アンモニア血症、横紋筋融解症、不整脈、脳症を引き起こし、後に認知障害に発展する。[ 35 ] [ 36 ]異常なオートファジーとミトファジーはTANGO2関連疾患と関連しており、二次的な脂肪酸異常やミトコンドリア代謝など、筋生検におけるさまざまな症状を説明できる可能性がある。[ 37 ]

参考文献

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