大腸菌のクラスターを1万倍に拡大

微生物（microorganism ） [ a]は、微視的な大きさの生物であり、単細胞または細胞群として存在する。目に見えない微生物の存在は古代から疑われており、その初期の証拠は紀元前6世紀のインドで著されたジャイナ教の文献に記載されている。微生物の科学的研究は、1670年代にアントン・ファン・レーウェンフックが顕微鏡で観察したことから始まった。1850年代には、ルイ・パスツールが、微生物が食品の腐敗を引き起こすことを発見し、自然発生説を覆した。1880年代には、ロベルト・コッホが、微生物が結核、コレラ、ジフテリア、炭疽病を引き起こすことを発見した。

微生物は極めて多様性に富み、生命の3つのドメインすべてにおいて単細胞生物の大部分を占めています。3つのドメインのうち、古細菌と細菌の2つには微生物のみが含まれます。3つ目のドメインである真核生物には、すべての多細胞生物に加え、微生物である多くの単細胞原生生物と原生動物が含まれます。原生生物の中には動物と関連しているものもあれば、緑色植物と関連しているものもあります。多くの多細胞生物も微小なものであり、具体的には微小動物、真菌、藻類などがあります。

微生物は多様な生息地を持ち、極地から赤道まで、砂漠、間欠泉、岩石、深海など、あらゆる場所に生息しています。中には極度の高温や低温といった極限環境に適応したものや、高圧に適応したもの、そしてデイノコッカス・ラジオデュランスのように高放射線環境に適応したものもいます。微生物はまた、あらゆる多細胞生物の体内および体表に見られる微生物叢を構成しています。34億5000万年前のオーストラリアの岩石にかつて微生物が含まれていたという証拠があり、これは地球上で生命が存在した最古の直接的な証拠です。[1] [2]

微生物は、食品の発酵や下水処理、燃料、酵素、その他の生理活性化合物の生産など、人間の文化と健康において様々な意味で重要な役割を果たしています。微生物はモデル生物として生物学において不可欠なツールであり、生物兵器やバイオテロにも利用されてきました。微生物は肥沃な土壌の重要な構成要素です。人体においては、必須の腸内フローラを含むヒト微生物叢が微生物によって構成されています。多くの感染症の原因となる病原体は微生物であり、そのため衛生対策の対象となっています。

発見

古代の先駆者

アントニー・ファン・レーウェンフックは微生物を研究した最初の人物でした。
ラザロ・スパランツァーニは、スープを沸騰させると腐敗を防ぐことができることを実証しました。

微生物の存在の可能性は、17世紀に発見されるまで何世紀にもわたって議論されてきました。紀元前6世紀までに、現在のインドのジャイナ教徒は、ニゴーダと呼ばれる微小な生物の存在を仮定していました。[3]これらのニゴーダは群れをなして生まれ、植物、動物、人間の体を含むあらゆる場所に生息し、その寿命はほんの一瞬であると言われています。[4]ジャイナ教の第24代説教師であるマハヴィーラによると、人間は、食べたり、呼吸したり、座ったり、動いたりするときに、これらのニゴーダを大量に破壊します。[3]現代の多くのジャイナ教徒は、マハヴィーラの教えが、科学によって発見された微生物の存在を予見していたと主張しています。[5]

目に見えない生物によって病気が広がる可能性を示唆した最も古い考えは、紀元前1世紀のローマの学者マルクス・テレンティウス・ウァロによる『農業について』という本の中で、目に見えない生物を「アニマリア・ミヌータ」と呼び、沼地の近くに家を建てることに対して警告を発している。[6]

…目に見えない小さな生物が繁殖し、空気中に浮遊して口や鼻から体内に入り込み、深刻な病気を引き起こすからです。[6]

アヴィセンナは『医学典範』（1020年）の中で、結核やその他の病気が伝染する可能性があると示唆した。[7] [8]

近世

15 世紀、トルコの科学者アクシャムサディンは著書『生命の物質』の中で、病気と微生物の関わりについて次のように推測しました。

病気が個々人に発症すると考えるのは誤りです。病気は人から人へと伝染します。この伝染は、目には見えないものの、まだ生きている小さな種子を介して起こります。[9] [10]

1546年、ジローラモ・フラカストロは、伝染病は直接的または間接的な接触、あるいは長距離では接触がなくても感染を伝播する可能性のある、伝達可能な種子のような存在によって引き起こされると提唱しました。 [11]

アントニー・ファン・レーウェンフックは、微生物学の父の一人とされています。彼は1673年に初めて微生物を発見し、自ら設計した簡素な単レンズ顕微鏡を用いて科学的実験を行いました。 [12] [13] [14] [15] レーウェンフックと同時代のロバート・フックも、顕微鏡を用いてカビの子実体という形で微生物の生命を観察しました。1665年に出版された著書『ミクログラフィア』の中で、彼は研究の成果を図示し、「細胞」という用語を創始しました。[16]

19世紀

ルイ・パスツールは、粒子を遮断するフィルターを通って空気が流入したとしても、スパランツァーニの研究結果が当てはまることを示した。

ルイ・パスツール（1822-1895）は、粒子が培地を通過するのを防ぐフィルター付きの容器と、フィルターなしだが曲がった管を通して空気が入る容器で、沸騰させた培養液を空気にさらした。これにより塵埃の粒子が沈殿し、培養液と接触しない。パスツールは事前に培養液を沸騰させることで、実験開始時に培養液内に微生物が残らないようにした。パスツールの実験の過程で、培養液中には何も増殖しなかった。これは、培養液中で増殖した生物は、培養液内で自然発生したものではなく、塵埃の胞子として外部から来たものであることを意味している。こうしてパスツールは自然発生説を反駁し、病気の細菌説を支持した。[17]

ロベルト・コッホは微生物が病気を引き起こすことを証明した。

1876年、ロベルト・コッホ（1843-1910）は、微生物が病気を引き起こす可能性があることを立証しました。彼は、炭疽菌に感染した牛の血液には常に大量の炭疽菌（Bacillus anthracis）が含まれていることを発見しました。コッホは、感染した動物から少量の血液を採取し、それを健康な動物に注射することで、炭疽菌を動物から動物へと感染させ、健康な動物を病気にさせることを発見しました。また、彼は細菌を培養液中で培養し、それを健康な動物に注射することで病気を引き起こすことも発見しました。これらの実験に基づき、彼は微生物と病気の因果関係を確立するための基準を考案し、これらは現在コッホの原則として知られています。[18]これらの原則はすべての症例に当てはまるわけではありませんが、科学的思考の発展において歴史的に重要な意味を持ち、今日でも用いられています。[19]

ミドリムシのような微生物は、植物のように光合成を行うが、動物のように運動するため、動物界にも植物界にも属さないことが発見され、 1860年代に第三界の命名につながりました。1860年にジョン・ホッグはこれを原生生物界（Protoctista）と名付け、1866年にはエルンスト・ヘッケルが原生生物界（Protista）と名付けました。[20] [21] [22]

パスツールとコッホの研究は、医学に直接関連する微生物のみに焦点を当てていたため、微生物界の真の多様性を正確に反映していませんでした。微生物学の真の広がりが明らかになったのは、19世紀後半のマルティヌス・ベイエリンクとセルゲイ・ウィノグラツキーの研究によってでした。 [23]ベイエリンクは微生物学に2つの大きな貢献をしました。ウイルスの発見と集積培養技術の開発です。[24]タバコモザイクウイルスに関する研究はウイルス学の基本原理を確立しましたが、微生物学に最も直接的な影響を与えたのは集積培養法の開発であり、これにより生理学的に大きく異なるさまざまな微生物の培養が可能になりました。ウィノグラツキーは化学無機栄養の概念を初めて提唱し、それによって微生物が地球化学的プロセスにおいて重要な役割を果たすことを明らかにしました。[25]彼は硝化細菌と窒素固定細菌の両方を初めて分離し、記述した。[23]フランス系カナダ人の微生物学者フェリックス・デレルはバクテリオファージを共同発見し、最も初期の応用微生物学者の一人でした。[26]

分類と構造

微生物は地球上のほぼどこにでも存在します。細菌と古細菌はほぼ常に顕微鏡的であり、多くの真核生物も顕微鏡的であり、これにはほとんどの原生生物、一部の真菌、そして一部の微小動物や植物が含まれます。ウイルスは一般的に非生物とみなされているため、微生物とはみなされませんが、微生物学にはウイルスを研究するウイルス学という分野があります。 [27] [28] [29]

進化

単細胞微生物は、およそ 35 億年前、地球上で最初に発生した生命体でした。 [30] [31] [32]その後の進化は遅く、[33]先カンブリア時代 の約 30 億年間（地球上の生命の歴史の大部分）は、すべての生物が微生物でした。[34] [35] 2 億 2000 万年前の琥珀から細菌、藻類、真菌が確認されており、微生物の形態は少なくとも三畳紀以降ほとんど変わっていないことがわかります。[36]しかし、新たに発見されたニッケルの生物学的役割、特にシベリア・トラップの火山噴火によってもたらされた役割は、ペルム紀-三畳紀絶滅イベントの終わりに向けてメタン生成菌の進化を加速させた可能性があります。[37]

微生物は比較的速い進化速度を示す傾向がある。ほとんどの微生物は急速に増殖することができ、細菌は接合、形質転換、形質導入を通じて、大きく異なる種間でさえも自由に遺伝子を交換することができる。[38]この水平遺伝子伝播は、高い突然変異率やその他の形質転換手段と相まって、微生物が（自然選択を通じて）急速に進化し、新しい環境で生き残り、環境ストレスに対応することを可能にする。この急速な進化は医学において重要であり、抗生物質に耐性を持つ多剤耐性病原菌、いわゆるスーパーバグの発生につながっている。[39]

2012年、日本の科学者らによって、原核生物と真核生物の中間形態と考えられる微生物が発見されました。パラカリオン・ミオジネンシスは、典型的な原核生物よりも大型でありながら、真核生物と同様に核物質が膜に包まれ、細胞内共生菌が存在するという特異な微生物です。これは、原核生物から真核生物への進化段階を示す、微生物の進化形態として初めて有力視されています。[40] [41]

古細菌

古細菌は原核単細胞生物であり、カール・ウーゼの三ドメイン体系における生命の最初のドメインを形成します。原核生物は、細胞核やその他の膜で囲まれた細胞小器官を持たないと定義されます。古細菌は、かつて同じグループに分類されていた細菌とこの特徴を共有しています。1990年、微生物学者ウーゼは、生物を細菌、古細菌、真核生物に分ける三ドメイン体系を提唱し[42]、それによって原核生物のドメインを分割しました。

古細菌は遺伝学的にも生化学的にも細菌とは異なる。例えば、細菌の細胞膜はエステル結合したホスホグリセリドでできているのに対し、アカイアの細胞膜はエーテル脂質でできている。[43]古細菌はもともと温泉などの極限環境に生息する好極限生物として説明されたが、その後、あらゆる種類の生息地で発見されている。[44]科学者たちはようやく、古細菌が環境中にいかに広く存在するかを認識し始めており、海洋ではサーモプロテオータ（旧称クレンアーキオータ）が最も一般的な生命体であり、水深150メートル（490フィート）以下の生態系を支配している。[45] [46]これらの生物は土壌にもよく存在し、アンモニアの酸化において重要な役割を果たしている。[47]

古細菌と細菌を合わせた領域は、地球上で最も多様で豊富な生物群を構成し、温度が+140℃（284℉）以下のほぼすべての環境に生息しています。水中、土壌中、大気中、生物のマイクロバイオーム、温泉、さらには地殻深部の岩石中にも存在します。[48]原核生物の数は約5ノニオン（5×10の30乗）と推定されており、地球上の生物量の少なくとも半分を占めています。[49]

原核生物の生物多様性は不明ですが、非常に大きい可能性があります。2016年5月の推定では、既知の種の数と生物の大きさの法則に基づいて、地球上にはおそらく1兆種の生物が存在すると推定されており、そのほとんどが微生物です。現在、その総数の1000分の1%しか記載されていません。[50]一部の種の 古細菌細胞は凝集し、特にDNA損傷を引き起こすストレスの多い環境条件下では、直接接触を通じてDNAを細胞間で移動させます。[51] [52]

細菌

約10,000倍に拡大した黄色ブドウ球菌

古細菌と同様に、細菌は原核生物、すなわち単細胞生物であり、細胞核やその他の膜で囲まれた細胞小器官を持たない。細菌は顕微鏡でしか見えないが、Thiomargarita namibiensis [53]のような極めて稀な例外もある。細菌は個々の細胞として機能し、増殖するが、多細胞コロニーを形成することもしばしばある。[54]粘液細菌などの一部の種は、複雑な群集構造を形成し、そのライフサイクルの一環として多細胞集団として機能したり、[55]大腸菌のように細菌コロニー内でクラスターを形成したりする。

細菌のゲノムは通常、環状の細菌染色体（ DNAの単一ループ）ですが、プラスミドと呼ばれる小さなDNA断片を保有することもできます。これらのプラスミドは、細菌の接合によって細胞間で伝達されます。細菌は細胞壁で囲まれており、これが細胞に強度と剛性を与えています。細菌は二分裂または時には出芽によって繁殖しますが、減数分裂による有性 生殖は行いません。しかし、多くの細菌種は、自然形質転換と呼ばれる水平遺伝子伝達プロセスによって個々の細胞間でDNAを伝達できます。[56]一部の種は非常に回復力のある胞子を形成しますが、細菌にとってこれは生存のためのメカニズムであり、繁殖ではありません。最適な条件下では、細菌は非常に急速に増殖し、その数は20分ごとに倍増することもあります。[57]

真核生物

成体の状態で肉眼で見える生物のほとんどは、人間も含めて真核生物です。しかし、多くの真核生物は微生物でもあります。細菌や古細菌とは異なり、真核生物は細胞内に細胞核、ゴルジ体、ミトコンドリアなどの細胞小器官を持っています。核は細胞のゲノムを構成するDNAを収めた細胞小器官です。DNA (デオキシリボ核酸) 自体は複雑な染色体に配列されています。[58]ミトコンドリアは、クエン酸回路や酸化的リン酸化が行われる場所であるため、代謝に不可欠な細胞小器官です。ミトコンドリアは共生細菌から進化し、名残のゲノムを保持しています。[59]細菌と同様に、植物細胞には細胞壁があり、他の真核生物の細胞小器官に加えて葉緑体などの細胞小器官が含まれています。葉緑体は光合成によって光からエネルギーを生産し、もともと共生細菌でもありました。[59]

単細胞真核生物は、そのライフサイクル全体を通して単一の細胞から構成されます。この特徴は、ほとんどの多細胞真核生物が、ライフサイクルの初期段階においてのみ接合子と呼ばれる単一の細胞から構成されることを考慮すると重要です。微生物真核生物は、一倍体または二倍体のいずれかであり、一部の生物は複数の細胞核を有します。

単細胞真核生物は、通常、好ましい条件下では有糸分裂によって無性生殖する。しかし、栄養不足やDNA損傷に関連するその他のストレス条件下では、減数分裂および合配偶によって有性生殖する傾向がある。[60]

原生生物

ユーグレナ・ムタビリス、光合成 鞭毛虫

真核生物群の中で、原生生物は最も一般的には単細胞で微小な生物群です。これは非常に多様な生物群であり、分類は容易ではありません。[ 61 ] [62]藻類 の中には多細胞の原生生物がいくつかあり、粘菌は単細胞、群体、多細胞へと変化する独特のライフサイクルを持っています。[63]原生生物の種数は、ごく一部しか特定されていないため不明です。海洋、深海噴出孔、河川堆積物、酸性河川では原生生物の多様性が高く、多くの真核微生物群がまだ発見されている可能性があることを示唆しています。[64] [65]

菌類

真菌には、パン酵母（サッカロミセス・セレビシエ）や分裂酵母（シゾサッカロミセス・ポンベ）など、単細胞種がいくつか存在します。病原性酵母であるカンジダ・アルビカンスなど、一部の真菌は表現型の転換を起こし、ある環境では単細胞として、別の環境では糸状菌糸として増殖します。[66]

植物

緑藻類は、多くの微生物を含む光合成性真核生物の大きなグループです。一部の緑藻は原生生物に分類されますが、車軸藻類などは、陸上植物の中で最もよく知られている胚植物に分類されます。藻類は単細胞として、または長い細胞鎖として成長します。緑藻類には、単細胞および群体性の鞭毛藻類（通常は1細胞あたり2本の鞭毛を持ちますが、必ずしもそうとは限りません）のほか、様々な群体、球状、糸状の形態があります。高等植物に最も近縁の車軸藻類では、細胞は生物体内でいくつかの異なる組織に分化します。緑藻類は約6000種存在します。[67]

生態学

微生物は、自然界のほぼすべての生息地で見つかります。北極や南極、砂漠、間欠泉、岩などの過酷な環境も含まれます。また、海洋や深海のあらゆる海洋微生物も含まれます。微生物の中には、極限環境に適応してコロニーを維持しているものがあり、これらの生物は極限環境微生物として知られています。極限環境微生物は、地表から 7 キロメートルもの深さの岩石から分離されており、[68]地表下に生息する生物の量は、地表上または地表上の生命の量に匹敵すると示唆されています。[48]極限環境微生物は真空中でも長期間生存することが知られており、放射線に対して非常に耐性があるため、宇宙でも生存できる可能性があります。[69]多くの種類の微生物は、他の大型生物と密接な共生関係にあります。微生物の中には、互いに有益なもの（相利共生）もあれば、宿主生物に害を及ぼすもの（寄生）もあります。微生物が宿主に病気を引き起こす場合、それらは病原体と呼ばれます。微生物は分解と窒素固定を担うため、地球の生物地球化学循環において重要な役割を果たしています。[70]

細菌は、地球上のほぼあらゆる環境ニッチに適応することを可能にする制御ネットワークを利用しています。 [71] [72] DNA、RNA、タンパク質、代謝物など、多様な分子間の相互作用ネットワークは、細菌が遺伝子発現を制御するために利用されています。細菌における制御ネットワークの主な機能は、栄養状態や環境ストレスなどの環境変化への反応を制御することです。[73]ネットワークの複雑な組織化により、微生物は複数の環境シグナルを調整し、統合することができます。[71]

極限環境生物

放射線耐性極限環境細菌デイノコッカス・ラジオデュランスの四分子

極限環境微生物は、通常ほとんどの生命にとって致命的となる極限環境でも生存し、繁栄できるように適応した微生物です。好熱菌と超好熱菌は高温で繁栄します。好冷菌は極低温で繁栄します。 – 最高130℃（266℉）[74]最低-17℃（1℉）[75] Halobacterium salinarum（古細菌）などの好塩菌は、高塩分の条件で飽和まで繁栄します。[ 76] 好アルカリ菌は、約8.5～11のアルカリ性pHで繁栄します。 [77]好酸性菌はpH2.0以下で繁栄できます。[78]好圧菌は、1,000～2,000気圧から宇宙の真空のような0気圧まで、非常に高い圧力下で繁殖します。[b]デイノコッカス・ラジオデュランスなどの一部の極限環境好圧菌は放射線耐性を持ち、[80]最大5k Gyの放射線被曝に耐えます。極限環境好圧菌は様々な意味で重要です。地球上の生命を地球の水圏、地殻、大気圏の大部分にまで広げ、極限環境への適応という独自の進化メカニズムはバイオテクノロジーに活用でき、また、極限条件下でのその存在自体が地球外生命の存在の可能性を高めます。[81]

植物と土壌

土壌における窒素循環は、大気中の窒素固定に依存しています。これは、多くのジアゾ栄養菌によって達成されます。その一因として、マメ科植物の根粒に共生するリゾビウム属、メソリゾビウム属、シノリゾビウム属、ブラディリゾビウム属、アゾリゾビウム属の細菌が挙げられます。[82]

植物の根は根圏と呼ばれる狭い領域を形成し、根の微生物叢と呼ばれる多くの微生物を支えています。[83]

根のマイクロバイオームに生息するこれらの微生物は、シグナルや合図を通じて、互いに、そして周囲の植物と相互作用することができる。例えば、菌根菌は、植物と菌類との間の化学シグナルを通じて、多くの植物の根系と通信することができる。これにより、両者は共生関係にある。しかし、これらのシグナルは、他の細菌を捕食する土壌細菌Myxococcus xanthusなどの他の微生物によって盗聴される可能性がある。植物や微生物などの意図しない受信者からのシグナルの盗聴、つまり傍受は、大規模な進化的結果につながる可能性がある。例えば、植物と微生物のペアと同様に、シグナル伝達者と受信者のペアは、盗聴者の変動性のために、近隣の集団と通信する能力を失う可能性がある。地元の盗聴者を避けるために適応する過程で信号の分岐が発生し、その結果、植物や微生物が他の集団とコミュニケーションをとることができなくなり、孤立してしまう可能性がある。[84]

共生

地衣類ピレノコレマ・ハロディテスに含まれる光合成シアノバクテリア Hyella caespitosa（丸い形）と菌糸（半透明の糸）

地衣類は、マクロ的な菌類と光合成微生物である藻類またはシアノバクテリアの共生生物である。[85] [86]

アプリケーション

微生物は、食品の生産、廃水処理、バイオ燃料、そして様々な化学物質や酵素の生成に有用です。モデル生物として研究において非常に貴重です。また、兵器として利用され、時には戦争やバイオテロにも利用されています。土壌の肥沃度を維持し、有機物を分解する役割を通じて、農業にも不可欠です。さらに、バイオフロック技術など、水産養殖にも応用されています。

食料生産

微生物は、ヨーグルト、チーズ、カード、ケフィア、アイラン、キシノガラ、その他の食品の製造工程で発酵に利用されています。発酵菌は風味と香りを与え、有害微生物の増殖を抑制します。 [87]パンの発酵や、ワインやビールの糖をアルコールに変換するのにも微生物が利用されています。微生物は、醸造、ワイン製造、パン焼き、漬物、その他の食品製造工程でも利用されています。[88]

水処理

廃水処理施設では、有機物を酸化するために主に微生物に依存しています。

これらの浄水場は、有機物で汚染された水を浄化する能力を、溶解物質を呼吸できる微生物に依存しています。呼吸は好気性で行われ、緩速砂ろ過器などの十分に酸素化されたろ過床で行われます。[89] メタン生成菌による嫌気性消化は、副産物として有用なメタンガスを生成します。 [90]

エネルギー

微生物は発酵によってエタノールを生産するのに利用されている[ 91]。またバイオガス反応器ではメタンを生産するのに利用されている[92] 。科学者たちは、藻類を使って液体燃料を生産したり[93] 、バクテリアを使って様々な形態の農業廃棄物や都市廃棄物を使用可能な燃料に変換したりする研究を行っている[94]。

化学物質、酵素

微生物は、多くの商業用および工業用の化学物質、酵素、その他の生理活性分子の生産に利用されています。微生物発酵によって大規模な工業規模で生産される有機酸には、アセトバクター・アセチなどの酢酸菌が生産する酢酸、クロストリジウム・ブチリカムなどの細菌が生産する酪酸、ラクトバチルスなどの乳酸菌が生産する乳酸[95]、そしてカビの一種であるアスペルギルス・ニガーが生産するクエン酸[95]などがあります。

微生物は、細菌ストレプトコッカス由来のストレプトキナーゼ[96]、子嚢菌トリポクラジウム・インフラタム由来のシクロスポリンA [97]、酵母モナスカス・プルプレウスによって産生されるスタチン[98]などの生理活性分子の製造に使用されています。

科学

実験室の発酵容器

微生物は、バイオテクノロジー、生化学、遺伝学、分子生物学において不可欠なツールです。酵母である サッカロミセス・セレビシエとシゾサッカロミセス・ポンベは、単純な真核生物であり、大量に迅速に増殖でき、操作も容易であるため、科学において重要なモデル生物です。 [99]特に遺伝学、ゲノミクス、プロテオミクスにおいて貴重です。[100] [101]微生物は、ステロイドの製造や皮膚疾患の治療などに利用できます。科学者たちはまた、微生物を生体燃料電池[ 102]や汚染対策に利用することも検討しています。[103]

戦争

中世には、生物兵器の初期の例として、城の包囲攻撃の際に、カタパルトなどの攻城兵器を用いて病死体が城内に投げ込まれた。死体の近くにいた人々は病原体に曝露し、他の人々に病原体を拡散させる可能性が高かった。[104]

現代では、バイオテロとしては、 1984年のラジニーシーバイオテロ攻撃[105]や、1993年の東京でのオウム真理教による炭疽菌散布[106]などが挙げられます。

土壌

微生物は土壌中の栄養素やミネラルを植物が利用できるようにし、成長を促進するホルモンを産生し、植物の免疫系を刺激し、ストレス反応を誘発または抑制します。一般的に、土壌微生物の多様性が高まるほど、植物病害が減少し、収量が増加します。[107]

人間の健康

ヒトの腸内細菌叢

微生物は、より大型の生物と共生関係を形成することがあります。例えば、微生物共生は免疫系において重要な役割を果たします。消化管内の腸内フローラを構成する微生物は、腸管免疫に寄与し、葉酸やビオチンなどのビタミンを合成し、消化されにくい複合炭水化物を発酵させます。[108]健康に有益であるとされる微生物の中には、プロバイオティクスと呼ばれるものがあり、栄養補助食品や食品添加物として入手可能です。[109]

病気

真核生物の寄生虫である熱帯 熱マラリア原虫（ 青いとげのある形状）は、人間の血液中に存在し、マラリアの原因となる。

微生物は多くの感染症の原因物質（病原体）である。関与する生物には、ペスト、結核、炭疽病などの原因となる病原細菌、マラリア、睡眠病、赤痢、トキソプラズマ症などの原因となる原生動物寄生虫、また白癬、カンジダ症、ヒストプラズマ症などの原因となる真菌などがある。しかし、インフルエンザ、黄熱病、エイズなど他の疾患は病原性ウイルスによって引き起こされるが、これらは通常、生物として分類されず、したがって厳密な定義では微生物ではない。古細菌病原体の明確な例は知られていないが、[110]一部の古細菌メタン生成菌とヒトの歯周病との関係が提案されている。[111]多くの微生物病原体は、感染した宿主内での生存を容易にすると思われる有性生殖能力を有する。[112]

衛生

衛生とは、周囲から微生物を除去することで感染や食品の腐敗を防ぐための一連の手順です。微生物、特に細菌は事実上あらゆる場所に存在するため、有害な微生物は完全に除去されるのではなく、許容レベルまで減少する可能性があります。食品の調理においては、調理、器具の清潔さ、保管期間の短縮、低温保存などの保存方法によって微生物が減少します。外科用器具のように完全な無菌性が必要な場合は、オートクレーブを用いて熱と圧力で微生物を殺菌します。[113] [114]

フィクションでは

参照

注記

  1. ^ 微生物（ / ˌ m aɪ k r oʊ ˈ ɔːr ɡ ə n ɪ z əm /）という単語は、 micro-（ギリシア語のμικρός , mikros、「小さい」）とorganism （ὀργανισμός , organismós、 「生物」）の結合形である。通常は一単語として書かれるが、特に古い文献ではハイフンでつながれることもある（ micro-organism）。非公式の同義語である微生物（ / ˈ m aɪ k r oʊ b / ）は、 mikrosとβίος , bíos、「生命」に由来する。
  2. ^ 好圧細菌ハロモナス・サラリアは1,000気圧の圧力を必要とする。また、推測上の生物であるナノベスは、2,000気圧の地殻で発見されたと報告されている。[79]

参考文献

  1. ^ Tyrell, Kelly April (2017年12月18日). 「これまでに発見された最古の化石は、地球上の生命が35億年前より前に始まったことを示している」ウィスコンシン大学マディソン校. 2017年12月18日閲覧。
  2. ^ Schopf, J. William; Kitajima, Kouki; Spicuzza, Michael J.; Kudryavtsev, Anatolly B.; Valley, John W. (2017). 「SIMS分析による最古の微化石群の分析は、その分類群と相関する炭素同位体組成を明らかにする」PNAS . 115 (1): 53– 58. Bibcode :2018PNAS..115...53S. doi : 10.1073/pnas.1718063115 . PMC 5776830. PMID  29255053 . 
  3. ^ ab Long, Jeffery D. (2013). Jainism: An Introduction. IBTauris. p. 100. ISBN 978-0-85771-392-6。
  4. ^ シン・ウピンダー（2008年）『古代・初期中世インドの歴史：石器時代から12世紀まで』ピアソン・エデュケーション・インディア、315頁。ISBN 978-81-317-1677-9。
  5. ^ ダンダス、ポール (2003). 『ジャイナ教』 ラウトレッジ p. 106. ISBN 978-1-134-50165-6。
  6. ^ ab Varro on Agriculture 1, xii Loeb
  7. ^ Tschanz, David W. 「ヨーロッパ医学のアラブ的ルーツ」Heart Views 4 ( 2). 2011年5月3日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  8. ^ コルガン、リチャード（2009年）『若き医師へのアドバイス：医療の芸術について』シュプリンガー、33ページ、ISBN 978-1-4419-1033-2。
  9. ^ Taşköprülüzâde: Shaqaiq-e Numaniya、v. 1、p. 2 48
  10. ^ Osman Şevki Uludağ: Beş Buçuk Asırlık Türk Tabâbet Tarihi (5世紀半のトルコ医療史)。イスタンブール、1969 年、35 ～ 36 ページ
  11. ^ ナットン、ヴィヴィアン (1990). 「フラカストロの伝染理論の受容：茨の中に落ちた種子？」.オシリス. 第2シリーズ, 第6巻, ルネサンス医学学習：伝統の進化: 196–234 . doi :10.1086/368701. JSTOR  301787. PMID  11612689. S2CID  37260514.
  12. ^ レーウェンフック, A. (1753). 「羊の肝臓の虫、ブヨ、そしてカエルの排泄物中の動物相について、アントニー・ファン・レーウェンフック氏からの手紙の一部」. Philosophical Transactions . 22 ( 260–276 ): 509–518 . Bibcode :1700RSPT...22..509V. doi : 10.1098/rstl.1700.0013 .
  13. ^ レーウェンフック, A. (1753). 「水中に生える緑の雑草とその周囲に見られるいくつかの動物について、アントニー・ファン・レーウェンフック氏（FRS）からの手紙の一部」. Philosophical Transactions . 23 ( 277– 288): 1304– 1311. Bibcode :1702RSPT...23.1304V. doi :10.1098/rstl.1702.0042. S2CID  186209549.
  14. ^ レーン、ニック(2015). 「見えない世界：レーウェンフック（1677）『小動物について』についての考察」Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 370 (1666) 20140344. doi :10.1098/rstb.2014.0344. PMC 4360124 . PMID  25750239. 
  15. ^ Payne、AS The Cleere Observer: A Biography of Antoni Van Leeuwenhoek、p. 13、マクミラン、1970
  16. ^ Gest, H. (2005). 「ロバート・フック（1635–1703）の驚くべき先見：微生物界の初観測者」. Perspect. Biol. Med . 48 (2): 266– 272. doi :10.1353/pbm.2005.0053. PMID  15834198. S2CID  23998841.
  17. ^ Bordenave, G. (2003). 「ルイ・パスツール (1822–1895)」. Microbes Infect . 5 (6): 553– 560. doi :10.1016/S1286-4579(03)00075-3. PMID  12758285.
  18. ^ 1905年のノーベル生理学・医学賞 Nobelprize.org 2006年11月22日にアクセス。
  19. ^ O'Brien, S.; Goedert, J. (1996). 「HIVはAIDSを引き起こす：コッホの原則は満たされている」. Curr Opin Immunol . 8 (5): 613– 618. doi :10.1016/S0952-7915(96)80075-6. PMID  8902385.
  20. ^ Scamardella, JM (1999). 「植物でも動物でもない：原生動物界、原生生物界、原生生物界の起源に関する簡潔な歴史」（PDF） . International Microbiology . 2 (4): 207– 221. PMID 10943416. 2011年6月14日時点の オリジナル（PDF）からアーカイブ。 2017年10月1日閲覧。
  21. ^ Rothschild, LJ (1989). 「原生動物、原生生物、原生生物：名前の持つ意味とは？」J Hist Biol . 22 (2): 277– 305. doi :10.1007/BF00139515. PMID  11542176. S2CID  32462158.
  22. ^ Solomon, Eldra Pearl; Berg, Linda R.; Martin, Diana W. 編 (2005). 「王国かドメインか？」生物学（第7版）. Brooks/Cole Thompson Learning. pp.  421–7 . ISBN 978-0-534-49276-2。
  23. ^ ab Madigan, M.; Martinko, J. 編 (2006). Brock Biology of Microorganisms (第13版). Pearson Education. p. 1096. ISBN 978-0-321-73551-5。
  24. ^ Johnson, J. (2001) [1998]. 「Martinus Willem Beijerinck」. APSnet . アメリカ植物病理学会. 2010年6月20日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2010年5月2日閲覧。2014年1月12日にインターネットアーカイブから取得。
  25. ^ Paustian, T.; Roberts, G. (2009). 「ベイエリンクとウィノグラツキーが環境微生物学の分野を切り開いた」. 『顕微鏡を通して：小さなものすべてを見る』（第3版）. 教科書コンソーシアム. § 1–14. 2008年9月14日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2017年10月3日閲覧。
  26. ^ Keen, EC (2012). 「フェリックス・デレルと私たちの微生物の未来」. Future Microbiology . 7 (12): 1337– 1339. doi :10.2217/fmb.12.115. PMID  23231482.
  27. ^ リム、ダニエル V. (2001)。 「微生物学」。eLS。ジョン・ワイリー。土井：10.1038/npg.els.0000459。ISBN 978-0-470-01590-2。
  28. ^ “What is Microbiology?” highveld.com . 2015年2月15日時点のオリジナルよりアーカイブ。2017年6月2日閲覧。
  29. ^ Cann, Alan (2011). 『分子ウイルス学の原理』（第5版）. Academic Press. ISBN 978-0-12-384939-7。
  30. ^ Schopf, J. (2006). 「始生代生命の化石証拠」. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 361 (1470): 869– 885. doi :10.1098/rstb.2006.1834. PMC 1578735. PMID  16754604 . 
  31. ^ Altermann, W.; Kazmierczak, J. (2003). 「始生代微化石：地球初期生命の再評価」Res Microbiol . 154 (9): 611– 617. doi : 10.1016/j.resmic.2003.08.006 . PMID  14596897.
  32. ^ Cavalier-Smith, T. (2006). 「細胞進化と地球史：停滞と革命」Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 361 (1470): 969– 1006. doi :10.1098/rstb.2006.1842. PMC 1578732 . PMID  16754610. 
  33. ^ Schopf, J. (1994). 「異なる速度、異なる運命：先カンブリア時代から顕生代にかけて変化した進化のテンポと様式」PNAS 91 ( 15 ): 6735– 6742. Bibcode :1994PNAS...91.6735S. doi : 10.1073/pnas.91.15.6735 . PMC 44277. PMID  8041691 . 
  34. ^ Stanley, S. (1973年5月). 「後期先カンブリア代における多細胞生命の突発的起源に関する生態学的理論」. PNAS . 70 (5): 1486–1489 . Bibcode :1973PNAS...70.1486S. doi : 10.1073/pnas.70.5.1486 . PMC 433525. PMID  16592084 . 
  35. ^ DeLong, E.; Pace, N. (2001). 「細菌と古細菌の環境多様性」. Syst Biol . 50 (4): 470– 478. CiteSeerX 10.1.1.321.8828 . doi :10.1080/106351501750435040. PMID  12116647. 
  36. ^ シュミット、A.;ラガッツィ、E.コッペロッティ、O.ロギ、G. (2006)。 「三畳紀の琥珀のミクロの世界」。自然。444 (7121): 835。ビブコード:2006Natur.444..835S。土井：10.1038/444835a。PMID  17167469。S2CID 4401723  。
  37. ^ Schirber, Michael (2014年7月27日). 「微生物の革新が地球上で最大の絶滅イベントを引き起こした可能性」Space.com . Astrobiology Magazine.ニッケルの急上昇により、メタン生成菌が急増した。
  38. ^ Wolska, K. (2003). 「環境中における細菌間のDNA水平伝播」. Acta Microbiol Pol . 52 (3): 233– 243. PMID  14743976.
  39. ^ Enright, M.; Robinson, D.; Randle, G.; Feil, E.; Grundmann, H.; Spratt, B. (2002年5月). 「メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）の進化史」. Proc Natl Acad Sci USA . 99 (11): 7687– 7692. Bibcode :2002PNAS...99.7687E. doi : 10.1073/pnas.122108599 . PMC 124322. PMID  12032344 . 
  40. ^ 「深海微生物と真核細胞の起源」（PDF） . 2017年10月24日閲覧。
  41. ^ 山口 正志; 他 (2012年12月1日). 「原核生物か真核生物か？深海から発見されたユニークな微生物」. Journal of Electron Microscopy . 61 (6): 423– 431. doi :10.1093/jmicro/dfs062. PMID  23024290.
  42. ^ Woese, C. ; Kandler, O. ; Wheelis, M. (1990). 「生物の自然システムに向けて：古細菌、細菌、および真核生物ドメインへの提案」Proc Natl Acad Sci USA . 87 (12): 4576– 4579. Bibcode :1990PNAS...87.4576W. doi : 10.1073/pnas.87.12.4576 . PMC 54159 . PMID  2112744. 
  43. ^ De Rosa, M.; Gambacorta, A.; Gliozzi, A. (1986年3月1日). 「古細菌脂質の構造、生合成、および物理化学的性質」. Microbiol. Rev. 50 ( 1): 70– 80. doi :10.1128/mmbr.50.1.70-80.1986. PMC 373054. PMID  3083222 . 
  44. ^ Robertson, C.; Harris, J.; Spear, J.; Pace, N. (2005). 「環境古細菌の系統学的多様性と生態学」Curr Opin Microbiol . 8 (6): 638– 642. doi :10.1016/j.mib.2005.10.003. PMID  16236543.
  45. ^ Karner, MB; DeLong, EF; Karl, DM (2001). 「太平洋中深海域における古細菌の優占」. Nature . 409 (6819): 507– 510. Bibcode :2001Natur.409..507K. doi :10.1038/35054051. PMID  11206545. S2CID  6789859.
  46. ^ シニンヘ・ダムステ、JS;ウィスコンシン州ライプストラ。ホップマンズ、EC;フロリダ州プラール;ジョージア州ウェイクハム。スショウテン、S. (2002 年 6 月)。 「アラビア海における浮遊性クレンカエオタの膜脂質の分布」。応用環境。微生物。68 (6): 2997–3002。ビブコード:2002ApEnM..68.2997S。土井：10.1128/AEM.68.6.2997-3002.2002。PMC 123986。PMID  12039760。 
  47. ^ ライニンガー、S.;ユーリッヒ、T.シュローター、M.シュワーク、L. Qi、J.ニコル、GW; JI プロッサー;サウスカロライナ州シュスター。 Schleper、C. (2006)。 「土壌中のアンモニア酸化原核生物の中で古細菌が優勢である」。自然。442 (7104): 806–809。書誌コード:2006Natur.442..806L。土井：10.1038/nature04983. PMID  16915287。S2CID 4380804  。
  48. ^ ab Gold, T. (1992). 「深部高温生物圏」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (13): 6045– 6049. Bibcode :1992PNAS...89.6045G. doi : 10.1073/pnas.89.13.6045 . PMC 49434 . PMID  1631089. 
  49. ^ Whitman, W.; Coleman, D.; Wiebe, W. (1998). 「原核生物：目に見えない大多数」. PNAS . 95 (12): 6578– 6583. Bibcode :1998PNAS...95.6578W. doi : 10.1073/pnas.95.12.6578 . PMC 33863. PMID  9618454 . 
  50. ^ 「研究者ら、地球には1兆種の生物が生息している可能性があると結論」国立科学財団2016年5月2日. 2016年5月6日閲覧。
  51. ^ van Wolferen, M.; Wagner, A.; van der Does, C.; Albers, SV (2016). 「古細菌のCedシステムによるDNAの輸入」Proc Natl Acad Sci USA . 113 (9): 2496– 501. Bibcode :2016PNAS..113.2496V. doi : 10.1073/pnas.1513740113 . PMC 4780597 . PMID  26884154. 
  52. ^ Bernstein H, Bernstein C. 古細菌における性コミュニケーション、減数分裂の前駆過程。古細菌のバイオコミュニケーション（Guenther Witzany編）2017年、103～117頁。Springer International Publishing ISBN 978-3-319-65535-2DOI 10.1007/978-3-319-65536-9
  53. ^ Schulz, H.; Jorgensen, B. (2001). 「巨大細菌」Annu Rev Microbiol . 55 : 105–137 . doi :10.1146/annurev.micro.55.1.105. PMID  11544351.
  54. ^ Shapiro, JA (1998). 「細菌集団を多細胞生物として考える」(PDF) . Annu. Rev. Microbiol . 52 : 81– 104. doi :10.1146/annurev.micro.52.1.81. PMID  9891794. 2011年7月17日時点のオリジナル(PDF)からアーカイブ。
  55. ^ ムニョス・ドラド、J.;マルコス・トーレス、フロリダ州;ガルシア＝ブラボ、E.モラレダ＝ムニョス、A.ペレス、J. (2016)。 「粘液菌: 一緒に移動し、殺し、餌を与え、そして生き残る」。微生物学のフロンティア。7 : 781.土井: 10.3389/fmicb.2016.00781。PMC 4880591。PMID  27303375。 
  56. ^ Johnsbor, O.; Eldholm, V.; Håvarstein, LS (2007年12月). 「自然な遺伝子形質転換：その頻度、メカニズム、そして機能」. Res. Microbiol . 158 (10): 767– 778. doi : 10.1016/j.resmic.2007.09.004 . PMID  17997281.
  57. ^ Eagon, R. (1962). 「世代時間が10分未満の海洋細菌、シュードモナス・ナトリゲンス」J Bacteriol . 83 (4): 736– 737. doi :10.1128/JB.83.4.736-737.1962. PMC 279347. PMID  13888946 . 
  58. ^ 真核生物：形態学についてさらに詳しく（2006年10月10日閲覧）
  59. ^ ab Dyall, S.; Brown, M.; Johnson, P. (2004). 「古代の侵略：共生菌から細胞小器官へ」. Science . 304 (5668): 253– 257. Bibcode :2004Sci...304..253D. doi :10.1126/science.1094884. PMID  15073369. S2CID  19424594.
  60. ^ Bernstein, H.; Bernstein, C.; Michod, RE (2012). 「第1章」 木村 桜; 清水 空 (編).細菌および真核生物における性行動の主要な適応機能としてのDNA修復. DNA修復：新たな研究. Nova Sci. Publ. pp.  1– 49. ISBN 978-1-62100-808-8. 2018年7月22日時点のオリジナルよりアーカイブ。
  61. ^ Cavalier-Smith T (1993年12月1日). 「原生動物界とその18門」. Microbiol. Rev. 57 ( 4): 953–994 . doi : 10.1128/mmbr.57.4.953-994.1993 . PMC 372943. PMID  8302218 . 
  62. ^ Corliss, JO (1992). 「原生生物には別個の命名法が必要か？」BioSystems . 28 ( 1– 3): 1– 14. Bibcode :1992BiSys..28....1C. doi :10.1016/0303-2647(92)90003-H. PMID  1292654.
  63. ^ Devreotes, P. (1989). 「Dictyostelium discoideum：発生における細胞間相互作用のモデルシステム」. Science . 245 (4922): 1054– 1058. Bibcode :1989Sci...245.1054D. doi :10.1126/science.2672337. PMID  2672337.
  64. ^ Slapeta, J.; Moreira, D.; López-García, P. (2005). 「原生生物多様性の範囲：淡水真核生物の分子生態学からの洞察」Proc. Biol. Sci . 272 (1576): 2073– 2081. doi :10.1098/rspb.2005.3195. PMC 1559898. PMID 16191619  . 
  65. ^ Moreira, D.; López-García, P. (2002). 「真核微生物の分子生態学が明らかにする隠された世界」(PDF) . Trends Microbiol . 10 (1): 31– 38. doi :10.1016/S0966-842X(01)02257-0. PMID  11755083.
  66. ^ カリフォルニア州熊本；ヴィンス、MD (2005). 「カンジダ・アルビカンスの病原性に対する菌糸および菌糸共制御遺伝子の寄与」. Cell. Microbiol . 7 (11): 1546– 1554. doi : 10.1111/j.1462-5822.2005.00616.x . PMID  16207242.
  67. ^ トーマス、デイビッド・C. (2002).海藻. ロンドン: 自然史博物館. ISBN 978-0-565-09175-0。
  68. ^ Szewzyk, U.; Szewzyk, R.; Stenström, T. (1994). 「スウェーデンの花崗岩の深部掘削孔から分離された好熱性嫌気性細菌」. PNAS . 91 (5): 1810– 1813. Bibcode :1994PNAS...91.1810S. doi : 10.1073/pnas.91.5.1810 . PMC 43253. PMID 11607462  . 
  69. ^ Horneck, G. (1981). 「宇宙における微生物の生存：レビュー」. Adv Space Res . 1 (14): 39– 48. doi :10.1016/0273-1177(81)90241-6. PMID  11541716.
  70. ^ Rousk, Johannes; Bengtson, Per (2014). 「微生物による地球規模の生物地球化学サイクルの調節」. Frontiers in Microbiology . 5 (2): 210– 225. doi : 10.3389/fmicb.2014.00103 . PMC 3954078. PMID  24672519 . 
  71. ^ ab Filloux, AAM編 (2012).細菌制御ネットワーク. Caister Academic Press . ISBN 978-1-908230-03-4。
  72. ^ Gross, R.; Beier, D. 編 (2012).細菌における二成分系. Caister Academic Press . ISBN 978-1-908230-08-9。
  73. ^ Requena, JM編 (2012).微生物学におけるストレス反応. Caister Academic Press . ISBN 978-1-908230-04-1。
  74. ^ 超好熱性古細菌である株121は、121℃（250°F）で増殖し、130℃（266°F）で生存することが示されている。[1]
  75. ^ 一部の好冷細菌は-17℃（1℉）でも生育可能であり[2]、絶対零度付近でも生存できる。「月面における地球微生物」。2010年3月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2009年7月20日閲覧。
  76. ^ Dyall-Smith, Mike, HALOARCHAEA, メルボルン大学。Haloarchaeaも参照。
  77. ^ Olsson, Karen; Keis, Stefanie; Morgan, Hugh W.; Dimroth, Peter; Cook, Gregory M. (2003年1月15日). 「バチルス・アルカロフィルスはpH11.5まで増殖できる」(PDF) . Journal of Bacteriology . 185 (2): 461– 465. doi :10.1128/JB.185.2.461-465.2003. PMC 145327. PMID  12511491 . 
  78. ^ ピクロフィラスはpH-0.06でも生育できる。[3] 2010年6月22日アーカイブ、Wayback Machine
  79. ^ 「Microscopy-UK ホーム（顕微鏡愛好家とアマチュアのためのリソース。無料の月刊電子雑誌 Micscape を含む）」。
  80. ^ アンダーソン, AW; ノーダン, HC; ケイン, RF; パリッシュ, G.; ダガン, D. (1956). 「放射線耐性球菌に関する研究. I. 分離、形態、培養特性、およびガンマ線耐性」.食品技術. 10 (1): 575– 577.
  81. ^ Cavicchioli, R. (2002). 「極限環境微生物と地球外生命の探査」(PDF) . Astrobiology . 2 (3): 281– 292. Bibcode :2002AsBio...2..281C. CiteSeerX 10.1.1.472.3179 . doi :10.1089/153110702762027862. PMID 12530238. 2022年4月26日時点 のオリジナル(PDF)からのアーカイブ。 2017年10月26日閲覧。 
  82. ^ Barea, J.; Pozo, M.; Azcón, R.; Azcón-Aguilar, C. (2005). 「根圏における微生物の協力」J Exp Bot . 56 (417): 1761– 1778. doi : 10.1093/jxb/eri197 . PMID  15911555.
  83. ^ Gottel, Neil R.; Castro, Hector F.; Kerley, Marilyn; Yang, Zamin; Pelletier, Dale A.; Podar, Mircea; Karpinets, Tatiana; Uberbacher, Ed; Tuskan, Gerald A.; Vilgalys, Rytas; Doktycz, Mitchel J.; Schadt, Christopher W. (2011). 「土壌タイプの違いによるポプラの根圏と根圏における明確な微生物群集」.応用環境微生物学. 77 (17): 5934– 5944. Bibcode :2011ApEnM..77.5934G. doi :10.1128/AEM.05255-11. PMC 3165402 . PMID  21764952。 
  84. ^ Rebolleda-Gómez, M.; Wood, CW (2019). 「不明確な意図：微生物および植物システムにおける盗聴」. Frontiers in Ecology and Evolution . 7 (385). doi : 10.3389/fevo.2019.00385 .
  85. ^ 「地衣類とは何か？」オーストラリア国立植物園。 2017年9月30日閲覧。
  86. ^ 「地衣類入門 ― 界間の同盟」カリフォルニア大学古生物学博物館. 2017年9月30日閲覧。
  87. ^ 「乳製品微生物学」グエルフ大学. 2006年10月9日閲覧。
  88. ^ Hui, YH; Meunier-Goddik, L.; Josephsen, J.; Nip, WK; Stanfield, PS (2004). Handbook of Food and Beverage Fermentation Technology. CRC Press. pp. 27 et passim. ISBN 978-0-8247-5122-7。
  89. ^ Gray, NF (2004).廃水処理の生物学. インペリアル・カレッジ・プレス. p. 1164. ISBN 978-1-86094-332-4。
  90. ^ Tabatabaei, Meisam (2010). 「嫌気性廃水処理におけるメタン生成古細菌群の重要性」(PDF) . Process Biochemistry . 45 (8): 1214– 1225. doi :10.1016/j.procbio.2010.05.017.
  91. ^ キタニ・オサム; ホール・カール・W. (1989).バイオマスハンドブック. テイラー＆フランシス社, 米国. p. 256. ISBN 978-2-88124-269-4。
  92. ^ ピメンタル、デイヴィッド（2007年）『食料、エネルギー、そして社会』CRCプレス、289頁。ISBN 978-1-4200-4667-0。
  93. ^ ティッケル、ジョシュア他 (2000). 『フライヤーから燃料タンクへ：植物油を代替燃料として使うための完全ガイド』バイオディーゼルアメリカ. 53ページ. ISBN 978-0-9707227-0-6。
  94. ^ インスリー、ジェイ他 (2008). 『アポロの火：アメリカのクリーンエネルギー経済の活性化』 アイランド・プレス. p. 157. ISBN 978-1-59726-175-3。
  95. ^ ab Sauer, Michael; Porro, Danilo; et al. (2008). 「微生物による有機酸の生産：市場の拡大」（PDF） . Trends in Biotechnology . 26 (2): 100– 108. doi :10.1016/j.tibtech.2007.11.006. PMID 18191255. 2017年9月28日時点の オリジナル（PDF）からアーカイブ。 2017年9月28日閲覧。
  96. ^ Babashamsi, Mohammed; et al. (2009). 「保護アフィニティークロマトグラフィーによるストレプトキナーゼの生産と精製」. Avicenna Journal of Medical Biotechnology . 1 (1): 47– 51. PMC 3558118. PMID 23407807.ストレプトキナーゼは、β溶血性連鎖球菌の特定の株から抽出される細胞外タンパク質です 。 
  97. ^ Borel, JF; Kis, ZL; Beveridge, T. (1995). 「シクロスポリンの発見と開発の歴史」 Merluzzi, VJ; Adams, J. (編).抗炎症薬の探索：構想から臨床までの症例史 ボストン: Birkhäuser. pp.  27– 63. ISBN 978-1-4615-9846-6。
  98. ^ 12年生向け生物学教科書。国立教育研究訓練評議会。2006年。183ページ。ISBN 978-81-7450-639-9。
  99. ^ Castrillo, JI; Oliver, SG (2004). 「ポストゲノム研究における試金石としての酵母：機能ゲノミクスにおける統合解析戦略」J. Biochem. Mol. Biol . 37 (1): 93– 106. doi : 10.5483/BMBRep.2004.37.1.093 . PMID  14761307.
  100. ^ Suter, B.; Auerbach, D.; Stagljar, I. (2006). 「酵母ベースの機能ゲノミクスおよびプロテオミクス技術：最初の15年間とそれ以降」. BioTechniques . 40 (5): 625– 644. doi : 10.2144/000112151 . PMID  16708762.
  101. ^ Sunnerhagen, P. (2002). 「Schizosaccharomyces pombeにおける機能ゲノミクスの展望」. Curr. Genet . 42 (2): 73– 84. doi :10.1007/s00294-002-0335-6. PMID  12478386. S2CID  22067347.
  102. ^ ソニ、SK（2007年）『微生物：21世紀のエネルギー源』ニューインディア出版、ISBN 978-81-89422-14-1。
  103. ^ モーゼス、ヴィヴィアン他 (1999). 『バイオテクノロジー：科学とビジネス』 CRC Press. p. 563. ISBN 978-90-5702-407-8。
  104. ^ ラングフォード、ローランド・E. (2004).大量破壊兵器入門：放射線、化学、生物兵器. Wiley-IEEE. p. 140. ISBN 978-0-471-46560-7。
  105. ^ マット・ノヴァック（2016年11月3日）「米国史上最大のバイオテロ攻撃は選挙を左右する試みだった」ギズモード。
  106. ^ 高橋 宏; ポール・ケイム; アーノルド・F・カウフマン; クリスティン・キーズ; キモシー・L・スミス; 谷口 清洲; 井上 栄; 倉田 武 (2004). 「炭疽菌バイオテロ事件、東京亀戸、1993年」.新興感染症. 10 (1): 117– 120. doi :10.3201/eid1001.030238. PMC 3322761. PMID  15112666 . 
  107. ^ Vrieze、Jop de (2015 年 8 月 14 日)。 「最も小さな農夫たち」。科学。349 (6249): 680–683。書誌コード:2015Sci...349..680D。土井：10.1126/science.349.6249.680。PMID  26273035。
  108. ^ O'Hara, A.; Shanahan, F. (2006). 「忘れられた臓器としての腸内フローラ」. EMBO Rep . 7 (7): 688– 693. doi :10.1038/sj.embor.7400731. PMC 1500832. PMID 16819463  . 
  109. ^ Schlundt, Jorgen. 「生きた乳酸菌入り粉乳を含む食品におけるプロバイオティクスの健康と栄養特性」（PDF）。生きた乳酸菌入り粉乳を含む食品におけるプロバイオティクスの健康と栄養特性の評価に関するFAO/WHO合同専門家協議報告書。FAO /WHO。 2012年10月22日時点のオリジナル（PDF）からアーカイブ。 2012年12月17日閲覧。
  110. ^ Eckburg, P.; Lepp, P.; Relman, D. (2003). 「古細菌とヒト疾患における潜在的な役割」. Infect Immun . 71 (2): 591– 596. doi :10.1128/IAI.71.2.591-596.2003. PMC 145348. PMID  12540534 . 
  111. ^ Lepp, P.; Brinig, M.; Ouverney, C.; Palm, K.; Armitage, G.; Relman, D. (2004). 「メタン生成古細菌とヒト歯周病」Proc Natl Acad Sci USA . 101 (16): 6176– 6181. Bibcode :2004PNAS..101.6176L. doi : 10.1073/pnas.0308766101 . PMC 395942 . PMID  15067114. 
  112. ^ Bernstein H.; Bernstein, C.; Michod, RE (2018年1月). 「微生物病原体における性別」. Infect Genet Evol . 57 : 8–25 . Bibcode :2018InfGE..57....8B. doi : 10.1016/j.meegid.2017.10.024 . PMID  29111273.
  113. ^ 「衛生」世界保健機関（WHO）2004年8月23日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2017年5月18日閲覧。
  114. ^ 「より安全な食品プログラムへの5つの鍵」世界保健機関。2003年12月7日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年5月23日閲覧。
  • Microbes.info は、微生物学の分野に関連する記事、ニュース、よくある質問、リンクなど、膨大なリソースのコレクションを含む微生物学情報ポータルです。
  • 私たちの微生物の惑星ウェイバックマシンで 2013 年 2 月 15 日にアーカイブ微生物の有益な役割に関する米国科学アカデミーの無料ポスター。
  • 「未知の微生物の世界：環境における微生物とその活動」アメリカ微生物学会報告書
  • 私たちの微生物惑星を理解する: メタゲノミクスの新しい科学Wayback Machineに 2013 年 2 月 15 日にアーカイブメタゲノミクスと私たちの微生物惑星の基本的な概要を紹介する 20 ページの教育小冊子。
  • 生命の樹 真核生物
  • ゲノムニュースネットワークからの微生物ニュース
  • 医療微生物学オンライン教科書
  • 顕微鏡を通して：小さなものすべてを見る 2008年9月13日アーカイブWayback Machineウィスコンシン大学マディソン校のティモシー・パウスティアンとゲイリー・ロバーツによるオンライン微生物学教科書
  • YouTubeの池の水中の微生物
  • メタンを排出する微生物が最悪の大量絶滅の原因とされる。CBCニュース